253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1216 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE1216  flagellar motor switch protein G  100 
 
 
349 aa  694    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0362  flagellar motor switch protein FliG  71.73 
 
 
343 aa  495  1e-139  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.230636  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0296  flagellar motor switch protein G  67.96 
 
 
344 aa  454  1e-127  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0466  flagellar motor switch protein G  60.41 
 
 
340 aa  429  1e-119  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2050  flagellar motor switch protein G  63.11 
 
 
342 aa  424  1e-117  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1392  flagellar motor switch protein FliG  57.14 
 
 
335 aa  415  9.999999999999999e-116  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.819068 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1112  flagellar motor switch protein G  57.27 
 
 
339 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2004  flagellar motor switch protein G  57.7 
 
 
339 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1692  flagellar motor switch protein G  57.7 
 
 
335 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1390  flagellar motor switch protein FliG  55.59 
 
 
336 aa  393  1e-108  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1336  flagellar motor switch protein FliG  56.85 
 
 
336 aa  390  1e-107  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.219515  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2716  flagellar motor switch protein FliG  58.97 
 
 
339 aa  383  1e-105  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2172  flagellar motor switch protein G  59.82 
 
 
335 aa  379  1e-104  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0772  flagellar motor switch protein G  53.33 
 
 
336 aa  377  1e-103  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.250722 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4149  flagellar motor switch protein G  53.5 
 
 
334 aa  374  1e-102  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0728  flagellar motor switch protein G  55.05 
 
 
335 aa  370  1e-101  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0704  flagellar motor switch protein G  54.74 
 
 
335 aa  369  1e-101  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2043  flagellar motor switch protein FliG  54.38 
 
 
337 aa  367  1e-100  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2407  flagellar motor switch protein FliG  53.03 
 
 
337 aa  365  1e-100  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1764  flagellar motor switch protein FliG  53.96 
 
 
336 aa  362  4e-99  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.792926  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0833  flagellar motor switch protein G  51.52 
 
 
336 aa  357  1.9999999999999998e-97  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00477309  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0477  flagellar motor switch protein G  51.06 
 
 
336 aa  355  5e-97  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0689  flagellar motor switch protein FliG  50.59 
 
 
338 aa  348  1e-94  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1374  flagellar motor switch protein FliG  49.22 
 
 
338 aa  347  2e-94  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.332403  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0842  flagellar motor switch protein FliG  45.21 
 
 
335 aa  313  3.9999999999999997e-84  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0039  flagellar motor switch protein FliG  45.59 
 
 
360 aa  311  1e-83  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.81346  normal  0.741048 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2346  flagellar motor switch protein FliG  45.76 
 
 
338 aa  301  8.000000000000001e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.122165  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1651  flagellar motor switch protein FliG  44.01 
 
 
341 aa  293  3e-78  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.100481  normal  0.381395 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0789  flagellar motor switch protein FliG  40.18 
 
 
348 aa  292  6e-78  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0173837  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0758  flagellar motor switch protein FliG  44.65 
 
 
341 aa  283  4.0000000000000003e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0977  flagellar motor switch protein FliG  42.73 
 
 
361 aa  279  4e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.252383  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2026  flagellar motor switch protein FliG  41.44 
 
 
341 aa  263  4e-69  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.423161 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31210  flagellar motor switch protein FliG  43.37 
 
 
337 aa  261  1e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0507459  normal  0.0710438 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3096  flagellar motor switch protein FliG  39.69 
 
 
330 aa  261  2e-68  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0411  flagellar motor switch protein FliG  40.3 
 
 
330 aa  251  1e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3303  flagellar motor switch protein FliG  38.37 
 
 
333 aa  249  4e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4212  flagellar motor switch protein FliG  40 
 
 
330 aa  248  1e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0138  flagellar motor switch protein FliG  38.18 
 
 
337 aa  245  6e-64  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.902934  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1159  flagellar motor switch protein FliG  38.32 
 
 
337 aa  245  9.999999999999999e-64  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00707491 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3427  flagellar motor switch protein FliG  38.18 
 
 
330 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3111  flagellar motor switch protein FliG  37.88 
 
 
330 aa  241  1e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0270  flagellar motor switch protein FliG  38.44 
 
 
336 aa  241  1e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0710  flagellar motor switch protein FliG  37.88 
 
 
334 aa  237  2e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.618446 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3837  flagellar motor switch protein FliG  37.88 
 
 
330 aa  237  2e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3921  flagellar motor switch protein FliG  37.88 
 
 
330 aa  237  3e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0392291 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3030  flagellar motor switch protein FliG  37.69 
 
 
336 aa  236  5.0000000000000005e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.647679  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2990  flagellar motor switch protein FliG  37.83 
 
 
344 aa  231  1e-59  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00618749 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0219  flagellar motor switch protein FliG  37.8 
 
 
341 aa  231  1e-59  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1968  flagellar motor switch protein G  34.82 
 
 
338 aa  231  2e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1592  flagellar motor switch protein G  36.97 
 
 
343 aa  227  2e-58  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1537  flagellar motor switch protein G  36.11 
 
 
339 aa  227  2e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1651  flagellar motor switch protein FliG  35.14 
 
 
338 aa  227  2e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.234145  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0772  flagellar motor switch protein FliG  36.09 
 
 
334 aa  226  4e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0843003  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4368  flagellar motor switch protein G  35.19 
 
 
339 aa  224  1e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.861838 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3929  flagellar motor switch protein G  35.19 
 
 
339 aa  224  1e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3693  flagellar motor switch protein G  35.8 
 
 
339 aa  224  1e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3447  flagellar motor switch protein G  36.31 
 
 
337 aa  224  2e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1499  flagellar motor switch protein G  34.57 
 
 
339 aa  223  3e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.757112  normal  0.857063 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0497  flagellar motor switch protein FliG  35.29 
 
 
329 aa  221  9.999999999999999e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.324062  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1996  flagellar motor switch protein G  35.4 
 
 
347 aa  220  3e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1669  flagellar motor switch protein G  36.06 
 
 
343 aa  219  3.9999999999999997e-56  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2824  flagellar motor switch protein G  34.57 
 
 
338 aa  218  2e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.113129  normal  0.0174319 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3806  flagellar motor switch protein FliG  37.31 
 
 
331 aa  218  2e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.055767  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0570  flagellar motor switch protein FliG  35.12 
 
 
343 aa  217  2.9999999999999998e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4394  flagellar motor switch protein FliG  35.78 
 
 
331 aa  216  2.9999999999999998e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0639  flagellar motor switch protein FliG  37 
 
 
331 aa  216  4e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0266  flagellar motor switch protein G  35.76 
 
 
342 aa  216  4e-55  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3456  flagellar motor switch protein G  34.34 
 
 
338 aa  216  5e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0473  flagellar motor switch protein G  34.37 
 
 
342 aa  216  5e-55  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1959  flagellar motor switch protein FliG  34.04 
 
 
333 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.193303  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50130  flagellar motor switch protein G  34.04 
 
 
338 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.509893  hitchhiker  0.0042041 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4269  flagellar motor switch protein G  34.04 
 
 
338 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0460415  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0551  flagellar motor switch protein FliG  34.94 
 
 
332 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3080  flagellar motor switch protein FliG  37 
 
 
331 aa  213  2.9999999999999995e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.178582  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00980  flagellar motor switch protein FliG  32.83 
 
 
336 aa  213  3.9999999999999995e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.882654  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06186  flagellar motor switch protein FliG  32.83 
 
 
336 aa  213  3.9999999999999995e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0060655  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0391  flagellar motor switch protein G  37.65 
 
 
330 aa  213  4.9999999999999996e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.977742  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03161  flagellar motor switch protein G  32.94 
 
 
351 aa  213  4.9999999999999996e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02888  flagellar motor switch protein G  33.13 
 
 
346 aa  211  1e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1017  flagellar motor switch protein FliG  34.56 
 
 
333 aa  210  2e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4730  flagellar motor switch protein G  37.72 
 
 
330 aa  211  2e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.231859  normal  0.0614958 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3653  flagellar motor switch protein G  37.72 
 
 
330 aa  211  2e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.552774 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0054  flagellar motor switch protein FliG  32.74 
 
 
340 aa  210  3e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0822309  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1689  flagellar motor switch protein FliG  32.74 
 
 
340 aa  210  3e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00159309  hitchhiker  0.00060474 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002816  flagellar motor switch protein FliG  33.23 
 
 
351 aa  209  4e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1642  flagellar motor switch protein FliG  33.73 
 
 
339 aa  210  4e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.049908  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1114  flagellar motor switch protein FliG  36.39 
 
 
331 aa  209  6e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.622643  normal  0.125066 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1644  flagellar motor switch protein G  34.55 
 
 
342 aa  209  7e-53  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.255846  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2288  flagellar motor switch protein FliG  38.49 
 
 
338 aa  209  8e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0434  flagellar motor switch protein FliG  34.65 
 
 
346 aa  209  8e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0450299  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1571  flagellar motor switch protein FliG  35.91 
 
 
331 aa  208  9e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.239902  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2296  flagellar motor switch protein G  34.03 
 
 
345 aa  208  9e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0364  flagellar motor switch protein G  34.55 
 
 
342 aa  208  1e-52  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0341  flagellar motor switch protein G  34.55 
 
 
342 aa  208  1e-52  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2900  flagellar motor switch protein FliG  34.46 
 
 
333 aa  207  2e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0290509  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1183  flagellar motor switch protein G  34.33 
 
 
351 aa  207  2e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2358  flagellar motor switch protein FliG  33.54 
 
 
334 aa  207  3e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1283  flagellar motor switch protein G  33.93 
 
 
348 aa  207  3e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1350  flagellar motor switch protein G  33.93 
 
 
348 aa  207  3e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.679184  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1343  flagellar motor switch protein G  33.93 
 
 
348 aa  206  4e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.415793 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>