251 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2288 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_2288  flagellar motor switch protein FliG  100 
 
 
338 aa  671    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2669  flagellar motor switch protein FliG  86.98 
 
 
338 aa  549  1e-155  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0352  flagellar motor switch protein FliG  85.5 
 
 
333 aa  509  1e-143  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1571  flagellar motor switch protein FliG  78.48 
 
 
331 aa  491  9.999999999999999e-139  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.239902  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3030  flagellar motor switch protein FliG  69.09 
 
 
336 aa  478  1e-134  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.647679  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0411  flagellar motor switch protein FliG  38.79 
 
 
330 aa  257  2e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3303  flagellar motor switch protein FliG  39.39 
 
 
333 aa  252  6e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2043  flagellar motor switch protein FliG  40.91 
 
 
337 aa  251  1e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3427  flagellar motor switch protein FliG  39.39 
 
 
330 aa  251  2e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1692  flagellar motor switch protein G  37.12 
 
 
335 aa  249  3e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0570  flagellar motor switch protein FliG  37.84 
 
 
343 aa  248  8e-65  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0466  flagellar motor switch protein G  38.79 
 
 
340 aa  248  8e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3111  flagellar motor switch protein FliG  38.79 
 
 
330 aa  248  1e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2407  flagellar motor switch protein FliG  36.86 
 
 
337 aa  248  2e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0362  flagellar motor switch protein FliG  37.01 
 
 
343 aa  246  4e-64  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.230636  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1764  flagellar motor switch protein FliG  39.63 
 
 
336 aa  246  4e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.792926  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0477  flagellar motor switch protein G  39.26 
 
 
336 aa  242  6e-63  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0728  flagellar motor switch protein G  38.41 
 
 
335 aa  241  1e-62  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1216  flagellar motor switch protein G  38.14 
 
 
349 aa  240  2e-62  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1392  flagellar motor switch protein FliG  37.08 
 
 
335 aa  241  2e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.819068 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2050  flagellar motor switch protein G  38.53 
 
 
342 aa  241  2e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0704  flagellar motor switch protein G  38.11 
 
 
335 aa  240  2e-62  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4212  flagellar motor switch protein FliG  36.67 
 
 
330 aa  239  6.999999999999999e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3096  flagellar motor switch protein FliG  39.38 
 
 
330 aa  238  1e-61  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3837  flagellar motor switch protein FliG  38.07 
 
 
330 aa  238  1e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3921  flagellar motor switch protein FliG  38.07 
 
 
330 aa  237  2e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0392291 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1112  flagellar motor switch protein G  38.53 
 
 
339 aa  236  3e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1336  flagellar motor switch protein FliG  37.65 
 
 
336 aa  236  3e-61  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.219515  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1390  flagellar motor switch protein FliG  37.35 
 
 
336 aa  236  4e-61  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1968  flagellar motor switch protein G  36.69 
 
 
338 aa  236  4e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0833  flagellar motor switch protein G  37.73 
 
 
336 aa  236  5.0000000000000005e-61  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00477309  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1191  flagellar motor switch protein FliG  36.09 
 
 
340 aa  235  9e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2004  flagellar motor switch protein G  38.69 
 
 
339 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2172  flagellar motor switch protein G  39.76 
 
 
335 aa  233  3e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0296  flagellar motor switch protein G  37.88 
 
 
344 aa  233  4.0000000000000004e-60  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1374  flagellar motor switch protein FliG  34.85 
 
 
338 aa  231  2e-59  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.332403  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0544  flagellar motor switch protein G  37.42 
 
 
339 aa  231  2e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0579063  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0270  flagellar motor switch protein FliG  38.44 
 
 
336 aa  231  2e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1651  flagellar motor switch protein FliG  37.35 
 
 
338 aa  229  5e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.234145  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2716  flagellar motor switch protein FliG  37.57 
 
 
339 aa  229  7e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0039  flagellar motor switch protein FliG  38.19 
 
 
360 aa  228  1e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.81346  normal  0.741048 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1159  flagellar motor switch protein FliG  35.5 
 
 
337 aa  228  1e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00707491 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06186  flagellar motor switch protein FliG  36.25 
 
 
336 aa  227  2e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0060655  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00980  flagellar motor switch protein FliG  36.25 
 
 
336 aa  227  2e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.882654  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0772  flagellar motor switch protein G  36.47 
 
 
336 aa  226  4e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.250722 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0689  flagellar motor switch protein FliG  36.56 
 
 
338 aa  226  5.0000000000000005e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2358  flagellar motor switch protein FliG  38.37 
 
 
334 aa  226  6e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1723  flagellar motor switch protein  34.04 
 
 
329 aa  224  1e-57  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1723  flagellar motor switch protein  34.04 
 
 
329 aa  224  2e-57  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1017  flagellar motor switch protein FliG  39.21 
 
 
333 aa  224  2e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4149  flagellar motor switch protein G  36.89 
 
 
334 aa  223  4e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0710  flagellar motor switch protein FliG  36.94 
 
 
334 aa  222  9e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.618446 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1325  flagellar motor switch protein G  35.38 
 
 
348 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0497  flagellar motor switch protein FliG  36.48 
 
 
329 aa  220  1.9999999999999999e-56  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.324062  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2183  flagellar motor switch protein G  37.76 
 
 
342 aa  220  3e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.86816  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0434  flagellar motor switch protein FliG  37.08 
 
 
346 aa  220  3e-56  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0450299  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3447  flagellar motor switch protein G  36.2 
 
 
337 aa  219  5e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0685  flagellar motor switch protein G  37.92 
 
 
340 aa  218  7.999999999999999e-56  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.569445 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2187  flagellar motor switch protein G  36.84 
 
 
346 aa  217  2e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0566  flagellar motor switch protein  38.79 
 
 
331 aa  218  2e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.298533  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1996  flagellar motor switch protein G  35.62 
 
 
347 aa  216  4e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2296  flagellar motor switch protein G  36.64 
 
 
345 aa  216  5e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1013  flagellar motor switch protein G  37.39 
 
 
339 aa  216  5.9999999999999996e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.19786  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4394  flagellar motor switch protein FliG  37.99 
 
 
331 aa  215  8e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3065  flagellar motor switch protein G  35.24 
 
 
349 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0473  flagellar motor switch protein G  37.73 
 
 
342 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50130  flagellar motor switch protein G  34.03 
 
 
338 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.509893  hitchhiker  0.0042041 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4269  flagellar motor switch protein G  34.03 
 
 
338 aa  212  5.999999999999999e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0460415  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1499  flagellar motor switch protein G  35.4 
 
 
339 aa  211  1e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.757112  normal  0.857063 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1537  flagellar motor switch protein G  34.58 
 
 
339 aa  211  1e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4368  flagellar motor switch protein G  35.09 
 
 
339 aa  211  2e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.861838 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2824  flagellar motor switch protein G  33.92 
 
 
338 aa  210  2e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.113129  normal  0.0174319 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02888  flagellar motor switch protein G  33.64 
 
 
346 aa  211  2e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3929  flagellar motor switch protein G  35.09 
 
 
339 aa  211  2e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1343  flagellar motor switch protein G  35.74 
 
 
348 aa  210  2e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.415793 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2307  flagellar motor switch protein G  33.83 
 
 
350 aa  210  2e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3227  flagellar motor switch protein G  36.17 
 
 
348 aa  210  3e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1651  flagellar motor switch protein FliG  34.51 
 
 
341 aa  209  4e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.100481  normal  0.381395 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3693  flagellar motor switch protein G  33.64 
 
 
339 aa  209  5e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0551  flagellar motor switch protein FliG  36.34 
 
 
332 aa  209  7e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1283  flagellar motor switch protein G  35.44 
 
 
348 aa  209  7e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1350  flagellar motor switch protein G  35.44 
 
 
348 aa  209  7e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.679184  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1183  flagellar motor switch protein G  35.78 
 
 
351 aa  208  8e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0219  flagellar motor switch protein FliG  36.31 
 
 
341 aa  208  1e-52  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3067  flagellar motor switch protein G  35.14 
 
 
350 aa  207  1e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.999326 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1438  flagellar motor switch protein G  35.14 
 
 
350 aa  207  1e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2935  flagellar motor switch protein G  35.14 
 
 
350 aa  207  1e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2925  flagellar motor switch protein G  35.14 
 
 
350 aa  207  1e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1367  flagellar motor switch protein G  34.35 
 
 
347 aa  208  1e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0842  flagellar motor switch protein FliG  33.43 
 
 
335 aa  206  3e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1114  flagellar motor switch protein FliG  37.39 
 
 
331 aa  206  3e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.622643  normal  0.125066 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1879  flagellar motor switch protein FliG  36.96 
 
 
333 aa  207  3e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.246079  normal  0.586274 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0772  flagellar motor switch protein FliG  37.42 
 
 
334 aa  206  4e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0843003  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2575  flagellar motor switch protein G  35.26 
 
 
348 aa  206  4e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.272553  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0266  flagellar motor switch protein G  36.65 
 
 
342 aa  206  5e-52  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3080  flagellar motor switch protein FliG  35.87 
 
 
331 aa  205  7e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.178582  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03161  flagellar motor switch protein G  34.35 
 
 
351 aa  205  9e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0789  flagellar motor switch protein FliG  33.43 
 
 
348 aa  204  1e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0173837  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002816  flagellar motor switch protein FliG  34.04 
 
 
351 aa  205  1e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1959  flagellar motor switch protein FliG  33.03 
 
 
333 aa  204  2e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.193303  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>