252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2183 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_2183  flagellar motor switch protein G  100 
 
 
342 aa  691    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.86816  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0685  flagellar motor switch protein G  68.86 
 
 
340 aa  498  1e-140  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.569445 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1013  flagellar motor switch protein G  71.43 
 
 
339 aa  498  1e-140  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.19786  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0544  flagellar motor switch protein G  66.47 
 
 
339 aa  482  1e-135  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0579063  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1875  flagellar motor switch protein G  63.45 
 
 
362 aa  465  9.999999999999999e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.937536  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0598  flagellar motor switch protein G  65.65 
 
 
363 aa  460  9.999999999999999e-129  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0690  flagellar motor switch protein G  65.35 
 
 
362 aa  461  9.999999999999999e-129  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.183913  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1458  flagellar motor switch protein G  63.53 
 
 
362 aa  449  1e-125  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1273  flagellar motor switch protein G  63.22 
 
 
362 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0206621  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0942  flagellar motor switch protein G  62.92 
 
 
362 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.386394  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3845  flagellar motor switch protein G  62.31 
 
 
362 aa  442  1e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00997148  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5058  flagellar motor switch protein G  54.79 
 
 
352 aa  391  1e-108  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0468557  normal  0.917887 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5125  flagellar motor switch protein G  52.63 
 
 
350 aa  376  1e-103  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0108237 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4572  flagellar motor switch protein G  55.02 
 
 
351 aa  377  1e-103  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.69886  normal  0.551331 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6058  flagellar motor switch protein G  53.8 
 
 
350 aa  375  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0938799  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4459  flagellar motor switch protein G  54.1 
 
 
351 aa  365  1e-100  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.845302  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4091  flagellar motor switch protein G  54.1 
 
 
351 aa  365  1e-100  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0769367  normal  0.520256 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3459  flagellar motor switch protein G  50.3 
 
 
350 aa  351  1e-95  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.195732  normal  0.0569561 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1474  flagellar motor switch protein G  51.47 
 
 
336 aa  328  8e-89  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0617  flagellar motor switch protein FliG  34.98 
 
 
358 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.588192 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0638  flagellar motor switch protein FliG  34.37 
 
 
359 aa  210  2e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.270127  normal  0.23501 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0649  flagellar motor switch protein FliG  34.06 
 
 
359 aa  207  1e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.150242 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3030  flagellar motor switch protein FliG  35.58 
 
 
336 aa  204  3e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.647679  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3216  flagellar motor switch protein FliG  34.78 
 
 
345 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.476285 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0728  flagellar motor switch protein G  35.37 
 
 
335 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0704  flagellar motor switch protein G  35.67 
 
 
335 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1374  flagellar motor switch protein FliG  34.82 
 
 
338 aa  199  3.9999999999999996e-50  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.332403  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0411  flagellar motor switch protein FliG  31.72 
 
 
330 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2288  flagellar motor switch protein FliG  38.15 
 
 
338 aa  198  1.0000000000000001e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3427  flagellar motor switch protein FliG  31.42 
 
 
330 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2669  flagellar motor switch protein FliG  35.58 
 
 
338 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0466  flagellar motor switch protein G  34.24 
 
 
340 aa  197  2.0000000000000003e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0270  flagellar motor switch protein FliG  34.74 
 
 
336 aa  196  4.0000000000000005e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0477  flagellar motor switch protein G  35.01 
 
 
336 aa  195  8.000000000000001e-49  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1112  flagellar motor switch protein G  34.41 
 
 
339 aa  192  6e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3111  flagellar motor switch protein FliG  31.72 
 
 
330 aa  192  7e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1692  flagellar motor switch protein G  32.22 
 
 
335 aa  190  2e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4212  flagellar motor switch protein FliG  30.82 
 
 
330 aa  191  2e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3921  flagellar motor switch protein FliG  31.72 
 
 
330 aa  190  2.9999999999999997e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0392291 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3837  flagellar motor switch protein FliG  31.72 
 
 
330 aa  190  2.9999999999999997e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3303  flagellar motor switch protein FliG  30.72 
 
 
333 aa  189  5e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0648  flagellar motor switch protein FliG  35 
 
 
332 aa  189  8e-47  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0245668  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1191  flagellar motor switch protein FliG  32.74 
 
 
340 aa  188  9e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2004  flagellar motor switch protein G  33.63 
 
 
339 aa  189  9e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0352  flagellar motor switch protein FliG  35.58 
 
 
333 aa  187  3e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0021  flagellar motor switch protein FliG  31.8 
 
 
344 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2807  flagellar motor switch protein FliG  31.31 
 
 
344 aa  185  1.0000000000000001e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.996528 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1571  flagellar motor switch protein FliG  34.89 
 
 
331 aa  184  3e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.239902  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1715  flagellar motor switch protein FliG  30.27 
 
 
342 aa  182  6e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.635605  normal  0.0531667 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0833  flagellar motor switch protein G  32.34 
 
 
336 aa  181  1e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00477309  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1092  flagellar motor switch protein FliG  29.85 
 
 
344 aa  181  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.606344 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2050  flagellar motor switch protein G  31.53 
 
 
342 aa  180  2.9999999999999997e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1336  flagellar motor switch protein FliG  34.24 
 
 
336 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.219515  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1968  flagellar motor switch protein G  32.15 
 
 
338 aa  178  1e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0362  flagellar motor switch protein FliG  32.16 
 
 
343 aa  177  2e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.230636  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2043  flagellar motor switch protein FliG  33.94 
 
 
337 aa  177  2e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1390  flagellar motor switch protein FliG  33.03 
 
 
336 aa  176  6e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1392  flagellar motor switch protein FliG  31.21 
 
 
335 aa  175  9.999999999999999e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.819068 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0710  flagellar motor switch protein FliG  32.72 
 
 
334 aa  174  9.999999999999999e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.618446 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2172  flagellar motor switch protein G  32.13 
 
 
335 aa  175  9.999999999999999e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0497  flagellar motor switch protein FliG  33.02 
 
 
329 aa  173  3.9999999999999995e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.324062  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1537  flagellar motor switch protein G  31.99 
 
 
339 aa  172  1e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0423  flagellar motor switch protein FliG  32 
 
 
339 aa  171  2e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.442925  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4149  flagellar motor switch protein G  33.73 
 
 
334 aa  170  3e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4368  flagellar motor switch protein G  32.11 
 
 
339 aa  168  1e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.861838 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2307  flagellar motor switch protein G  31.82 
 
 
350 aa  168  1e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3929  flagellar motor switch protein G  32.11 
 
 
339 aa  168  1e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1216  flagellar motor switch protein G  30.7 
 
 
349 aa  167  2e-40  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1996  flagellar motor switch protein G  31.56 
 
 
347 aa  167  2e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1499  flagellar motor switch protein G  31.8 
 
 
339 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.757112  normal  0.857063 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2407  flagellar motor switch protein FliG  31.12 
 
 
337 aa  168  2e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2716  flagellar motor switch protein FliG  31.83 
 
 
339 aa  166  5e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1764  flagellar motor switch protein FliG  32.34 
 
 
336 aa  166  5e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.792926  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3065  flagellar motor switch protein G  30.49 
 
 
349 aa  166  5.9999999999999996e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00980  flagellar motor switch protein FliG  30.33 
 
 
336 aa  165  9e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.882654  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3046  flagellar motor switch protein G  31.71 
 
 
351 aa  165  9e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06186  flagellar motor switch protein FliG  30.33 
 
 
336 aa  165  9e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0060655  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1343  flagellar motor switch protein G  31.1 
 
 
348 aa  165  9e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.415793 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3227  flagellar motor switch protein G  31.1 
 
 
348 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3693  flagellar motor switch protein G  31.19 
 
 
339 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0842  flagellar motor switch protein FliG  31.36 
 
 
335 aa  165  1.0000000000000001e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1367  flagellar motor switch protein G  30.79 
 
 
347 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50130  flagellar motor switch protein G  31.5 
 
 
338 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.509893  hitchhiker  0.0042041 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1362  flagellar motor switch protein G  30.56 
 
 
349 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0789  flagellar motor switch protein FliG  31.71 
 
 
348 aa  164  3e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0173837  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4269  flagellar motor switch protein G  31.5 
 
 
338 aa  164  3e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0460415  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1283  flagellar motor switch protein G  30.79 
 
 
348 aa  163  3e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1350  flagellar motor switch protein G  30.79 
 
 
348 aa  163  3e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.679184  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03161  flagellar motor switch protein G  31.52 
 
 
351 aa  163  3e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002816  flagellar motor switch protein FliG  31.21 
 
 
351 aa  162  6e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2187  flagellar motor switch protein G  31.78 
 
 
346 aa  162  6e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1325  flagellar motor switch protein G  29.43 
 
 
348 aa  162  7e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0434  flagellar motor switch protein FliG  30.37 
 
 
346 aa  162  1e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0450299  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02888  flagellar motor switch protein G  29.5 
 
 
346 aa  161  1e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3447  flagellar motor switch protein G  31.79 
 
 
337 aa  161  2e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2358  flagellar motor switch protein FliG  32.32 
 
 
334 aa  161  2e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0473  flagellar motor switch protein G  30.7 
 
 
342 aa  160  2e-38  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2824  flagellar motor switch protein G  30.36 
 
 
338 aa  160  2e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.113129  normal  0.0174319 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0689  flagellar motor switch protein FliG  31.99 
 
 
338 aa  161  2e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0758  flagellar motor switch protein FliG  31.31 
 
 
341 aa  160  2e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>