253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0411 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU0411  flagellar motor switch protein FliG  100 
 
 
330 aa  660    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3111  flagellar motor switch protein FliG  88.79 
 
 
330 aa  596  1e-169  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3427  flagellar motor switch protein FliG  80.3 
 
 
330 aa  560  1e-158  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3837  flagellar motor switch protein FliG  78.48 
 
 
330 aa  541  1e-153  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4212  flagellar motor switch protein FliG  78.79 
 
 
330 aa  541  1e-153  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3921  flagellar motor switch protein FliG  78.18 
 
 
330 aa  540  9.999999999999999e-153  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0392291 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3303  flagellar motor switch protein FliG  76.97 
 
 
333 aa  534  1e-151  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0570  flagellar motor switch protein FliG  44.55 
 
 
343 aa  293  2e-78  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1191  flagellar motor switch protein FliG  40.9 
 
 
340 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2004  flagellar motor switch protein G  43.5 
 
 
339 aa  281  1e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1112  flagellar motor switch protein G  42.3 
 
 
339 aa  281  2e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2043  flagellar motor switch protein FliG  43.2 
 
 
337 aa  273  4.0000000000000004e-72  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0466  flagellar motor switch protein G  41.82 
 
 
340 aa  273  4.0000000000000004e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1692  flagellar motor switch protein G  39.7 
 
 
335 aa  270  2e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0728  flagellar motor switch protein G  41.46 
 
 
335 aa  266  2.9999999999999995e-70  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0704  flagellar motor switch protein G  41.16 
 
 
335 aa  266  4e-70  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0477  flagellar motor switch protein G  40.42 
 
 
336 aa  263  2e-69  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2050  flagellar motor switch protein G  40.12 
 
 
342 aa  259  5.0000000000000005e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1968  flagellar motor switch protein G  36.17 
 
 
338 aa  257  2e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1764  flagellar motor switch protein FliG  41.95 
 
 
336 aa  256  4e-67  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.792926  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3030  flagellar motor switch protein FliG  40.61 
 
 
336 aa  256  4e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.647679  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1336  flagellar motor switch protein FliG  40.3 
 
 
336 aa  256  5e-67  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.219515  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2172  flagellar motor switch protein G  40.3 
 
 
335 aa  256  6e-67  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1392  flagellar motor switch protein FliG  39.09 
 
 
335 aa  255  7e-67  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.819068 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0772  flagellar motor switch protein G  38.79 
 
 
336 aa  254  1.0000000000000001e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.250722 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1374  flagellar motor switch protein FliG  38.79 
 
 
338 aa  253  3e-66  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.332403  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0362  flagellar motor switch protein FliG  39.39 
 
 
343 aa  252  6e-66  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.230636  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1216  flagellar motor switch protein G  40.3 
 
 
349 aa  251  1e-65  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0833  flagellar motor switch protein G  37.08 
 
 
336 aa  251  1e-65  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00477309  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0789  flagellar motor switch protein FliG  38.63 
 
 
348 aa  251  1e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0173837  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1159  flagellar motor switch protein FliG  36.78 
 
 
337 aa  251  2e-65  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00707491 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2407  flagellar motor switch protein FliG  38.51 
 
 
337 aa  250  2e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0270  flagellar motor switch protein FliG  39.82 
 
 
336 aa  249  6e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1017  flagellar motor switch protein FliG  38.15 
 
 
333 aa  246  4e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1390  flagellar motor switch protein FliG  39.09 
 
 
336 aa  246  4.9999999999999997e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0710  flagellar motor switch protein FliG  36.17 
 
 
334 aa  242  7.999999999999999e-63  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.618446 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2716  flagellar motor switch protein FliG  38.79 
 
 
339 aa  241  1e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1723  flagellar motor switch protein  36.17 
 
 
329 aa  241  1e-62  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1723  flagellar motor switch protein  36.17 
 
 
329 aa  241  1e-62  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0772  flagellar motor switch protein FliG  37 
 
 
334 aa  241  2e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0843003  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2900  flagellar motor switch protein FliG  39.02 
 
 
333 aa  240  2e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0290509  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0296  flagellar motor switch protein G  40 
 
 
344 aa  239  4e-62  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4149  flagellar motor switch protein G  37.88 
 
 
334 aa  239  5e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2669  flagellar motor switch protein FliG  38.79 
 
 
338 aa  238  1e-61  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0758  flagellar motor switch protein FliG  38.23 
 
 
341 aa  237  2e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3693  flagellar motor switch protein G  33.74 
 
 
339 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1537  flagellar motor switch protein G  33.74 
 
 
339 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4368  flagellar motor switch protein G  33.43 
 
 
339 aa  233  3e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.861838 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3929  flagellar motor switch protein G  33.43 
 
 
339 aa  233  3e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1499  flagellar motor switch protein G  33.43 
 
 
339 aa  233  5e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.757112  normal  0.857063 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1977  flagellar motor switch protein FliG  34.15 
 
 
331 aa  233  5e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3080  flagellar motor switch protein FliG  37.5 
 
 
331 aa  231  1e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.178582  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2824  flagellar motor switch protein G  34.46 
 
 
338 aa  231  1e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.113129  normal  0.0174319 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1325  flagellar motor switch protein G  35.45 
 
 
348 aa  231  2e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00980  flagellar motor switch protein FliG  34.05 
 
 
336 aa  230  3e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.882654  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50130  flagellar motor switch protein G  33.74 
 
 
338 aa  230  3e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.509893  hitchhiker  0.0042041 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3806  flagellar motor switch protein FliG  37.5 
 
 
331 aa  230  3e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.055767  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06186  flagellar motor switch protein FliG  34.05 
 
 
336 aa  230  3e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0060655  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0434  flagellar motor switch protein FliG  38.27 
 
 
346 aa  229  3e-59  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0450299  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4269  flagellar motor switch protein G  33.74 
 
 
338 aa  229  5e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0460415  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2358  flagellar motor switch protein FliG  34.24 
 
 
334 aa  228  8e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1651  flagellar motor switch protein FliG  35.54 
 
 
338 aa  228  1e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.234145  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1959  flagellar motor switch protein FliG  33.13 
 
 
333 aa  227  2e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.193303  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3096  flagellar motor switch protein FliG  39.26 
 
 
330 aa  227  3e-58  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3456  flagellar motor switch protein G  32.83 
 
 
338 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0497  flagellar motor switch protein FliG  34.06 
 
 
329 aa  226  5.0000000000000005e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.324062  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4394  flagellar motor switch protein FliG  35.67 
 
 
331 aa  225  7e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0566  flagellar motor switch protein  35.69 
 
 
331 aa  225  8e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.298533  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1367  flagellar motor switch protein G  34.04 
 
 
347 aa  224  1e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0842  flagellar motor switch protein FliG  37.31 
 
 
335 aa  224  2e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3065  flagellar motor switch protein G  34.82 
 
 
349 aa  224  2e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1601  flagellar motor switch protein FliG  34.66 
 
 
333 aa  223  4.9999999999999996e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.523158  normal  0.301606 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0352  flagellar motor switch protein FliG  40.95 
 
 
333 aa  222  6e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0551  flagellar motor switch protein FliG  35.06 
 
 
332 aa  222  8e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0689  flagellar motor switch protein FliG  35.35 
 
 
338 aa  221  9e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2346  flagellar motor switch protein FliG  36.25 
 
 
338 aa  221  1.9999999999999999e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.122165  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0639  flagellar motor switch protein FliG  35.37 
 
 
331 aa  221  1.9999999999999999e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3062  flagellar motor switch protein G  34.88 
 
 
331 aa  220  3e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1183  flagellar motor switch protein G  36.14 
 
 
351 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0199  flagellar motor switch protein G  34.26 
 
 
331 aa  219  5e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02888  flagellar motor switch protein G  33.44 
 
 
346 aa  219  6e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3447  flagellar motor switch protein G  31.17 
 
 
337 aa  219  6e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1343  flagellar motor switch protein G  35.12 
 
 
348 aa  219  6e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.415793 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2296  flagellar motor switch protein G  34.38 
 
 
345 aa  219  6e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3227  flagellar motor switch protein G  35.12 
 
 
348 aa  219  7e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1651  flagellar motor switch protein FliG  37.99 
 
 
341 aa  218  7.999999999999999e-56  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.100481  normal  0.381395 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1571  flagellar motor switch protein FliG  37.27 
 
 
331 aa  218  1e-55  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.239902  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3280  flagellar motor switch protein G  33.64 
 
 
331 aa  217  2e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.67552  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0416  flagellar motor switch protein G  33.64 
 
 
331 aa  217  2e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.329911  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1438  flagellar motor switch protein G  34.82 
 
 
350 aa  217  2e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3067  flagellar motor switch protein G  34.82 
 
 
350 aa  217  2e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.999326 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1283  flagellar motor switch protein G  34.82 
 
 
348 aa  217  2e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1350  flagellar motor switch protein G  34.82 
 
 
348 aa  217  2e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.679184  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1996  flagellar motor switch protein G  31.56 
 
 
347 aa  218  2e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2945  flagellar motor switch protein G  33.64 
 
 
331 aa  217  2e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.18619  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2925  flagellar motor switch protein G  34.82 
 
 
350 aa  217  2e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2935  flagellar motor switch protein G  34.82 
 
 
350 aa  217  2e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0221  flagellar motor switch protein G  33.64 
 
 
331 aa  217  2e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0619042  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0233  flagellar motor switch protein G  33.64 
 
 
331 aa  217  2e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0631477  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2143  flagellar motor switch protein G  33.64 
 
 
331 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.536155  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>