253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_4212 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_4212  flagellar motor switch protein FliG  100 
 
 
330 aa  653    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3837  flagellar motor switch protein FliG  85.15 
 
 
330 aa  577  1.0000000000000001e-163  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3921  flagellar motor switch protein FliG  85.15 
 
 
330 aa  577  1.0000000000000001e-163  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0392291 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0411  flagellar motor switch protein FliG  78.79 
 
 
330 aa  541  1e-153  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3111  flagellar motor switch protein FliG  77.27 
 
 
330 aa  531  1e-150  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3427  flagellar motor switch protein FliG  76.06 
 
 
330 aa  526  1e-148  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3303  flagellar motor switch protein FliG  73.33 
 
 
333 aa  508  1e-143  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0466  flagellar motor switch protein G  43.94 
 
 
340 aa  283  2.0000000000000002e-75  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1112  flagellar motor switch protein G  42.12 
 
 
339 aa  279  5e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2004  flagellar motor switch protein G  42.73 
 
 
339 aa  278  7e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1692  flagellar motor switch protein G  40.91 
 
 
335 aa  275  8e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2050  flagellar motor switch protein G  42.86 
 
 
342 aa  272  5.000000000000001e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2172  flagellar motor switch protein G  42.42 
 
 
335 aa  271  1e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0570  flagellar motor switch protein FliG  40.91 
 
 
343 aa  270  2e-71  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1191  flagellar motor switch protein FliG  37.61 
 
 
340 aa  266  5e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0728  flagellar motor switch protein G  40.85 
 
 
335 aa  265  5e-70  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0704  flagellar motor switch protein G  40.55 
 
 
335 aa  265  7e-70  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1968  flagellar motor switch protein G  35.89 
 
 
338 aa  259  4e-68  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0477  flagellar motor switch protein G  38.48 
 
 
336 aa  258  7e-68  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2043  flagellar motor switch protein FliG  40.48 
 
 
337 aa  258  7e-68  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0833  flagellar motor switch protein G  36.78 
 
 
336 aa  252  7e-66  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00477309  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0772  flagellar motor switch protein G  39.58 
 
 
336 aa  252  7e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.250722 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1392  flagellar motor switch protein FliG  38.48 
 
 
335 aa  251  1e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.819068 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0362  flagellar motor switch protein FliG  38.79 
 
 
343 aa  251  1e-65  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.230636  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1537  flagellar motor switch protein G  35.69 
 
 
339 aa  250  2e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1764  flagellar motor switch protein FliG  41.64 
 
 
336 aa  251  2e-65  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.792926  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1336  flagellar motor switch protein FliG  39.7 
 
 
336 aa  250  2e-65  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.219515  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0270  flagellar motor switch protein FliG  38.92 
 
 
336 aa  248  7e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1216  flagellar motor switch protein G  40 
 
 
349 aa  248  1e-64  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3030  flagellar motor switch protein FliG  38.79 
 
 
336 aa  246  4e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.647679  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1159  flagellar motor switch protein FliG  35.26 
 
 
337 aa  245  9e-64  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00707491 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4149  flagellar motor switch protein G  39.7 
 
 
334 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2716  flagellar motor switch protein FliG  39.39 
 
 
339 aa  244  1.9999999999999999e-63  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1390  flagellar motor switch protein FliG  37.88 
 
 
336 aa  244  1.9999999999999999e-63  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0296  flagellar motor switch protein G  40.3 
 
 
344 aa  242  7.999999999999999e-63  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4368  flagellar motor switch protein G  34.15 
 
 
339 aa  240  2e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.861838 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3929  flagellar motor switch protein G  34.15 
 
 
339 aa  240  2e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3693  flagellar motor switch protein G  33.74 
 
 
339 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1499  flagellar motor switch protein G  34.15 
 
 
339 aa  239  4e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.757112  normal  0.857063 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1374  flagellar motor switch protein FliG  37.46 
 
 
338 aa  239  4e-62  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.332403  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1723  flagellar motor switch protein  35.26 
 
 
329 aa  239  6.999999999999999e-62  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1723  flagellar motor switch protein  35.26 
 
 
329 aa  239  6.999999999999999e-62  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1959  flagellar motor switch protein FliG  33.74 
 
 
333 aa  237  2e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.193303  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0772  flagellar motor switch protein FliG  36.7 
 
 
334 aa  237  2e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0843003  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1977  flagellar motor switch protein FliG  33.85 
 
 
331 aa  237  2e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0710  flagellar motor switch protein FliG  34.95 
 
 
334 aa  237  2e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.618446 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1017  flagellar motor switch protein FliG  36 
 
 
333 aa  237  2e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3456  flagellar motor switch protein G  33.43 
 
 
338 aa  236  3e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50130  flagellar motor switch protein G  33.43 
 
 
338 aa  236  4e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.509893  hitchhiker  0.0042041 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2824  flagellar motor switch protein G  33.23 
 
 
338 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.113129  normal  0.0174319 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4269  flagellar motor switch protein G  33.43 
 
 
338 aa  236  6e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0460415  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2900  flagellar motor switch protein FliG  37.8 
 
 
333 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0290509  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2407  flagellar motor switch protein FliG  37.46 
 
 
337 aa  234  1.0000000000000001e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0434  flagellar motor switch protein FliG  37.35 
 
 
346 aa  232  8.000000000000001e-60  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0450299  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0789  flagellar motor switch protein FliG  35.51 
 
 
348 aa  229  5e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0173837  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3447  flagellar motor switch protein G  32.41 
 
 
337 aa  229  5e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1651  flagellar motor switch protein FliG  39.51 
 
 
341 aa  228  8e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.100481  normal  0.381395 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5262  flagellar motor switch protein G  36.17 
 
 
337 aa  228  1e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0973096  normal  0.0777701 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0842  flagellar motor switch protein FliG  37.61 
 
 
335 aa  228  1e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0758  flagellar motor switch protein FliG  37 
 
 
341 aa  228  1e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3046  flagellar motor switch protein G  35.56 
 
 
351 aa  227  2e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5098  flagellar motor switch protein G  35.76 
 
 
337 aa  226  3e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.699284  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1325  flagellar motor switch protein G  33.64 
 
 
348 aa  226  4e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1996  flagellar motor switch protein G  32.5 
 
 
347 aa  226  4e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06186  flagellar motor switch protein FliG  33.02 
 
 
336 aa  226  5.0000000000000005e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0060655  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00980  flagellar motor switch protein FliG  33.02 
 
 
336 aa  226  5.0000000000000005e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.882654  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02888  flagellar motor switch protein G  34.06 
 
 
346 aa  225  8e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2358  flagellar motor switch protein FliG  33.13 
 
 
334 aa  224  2e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0497  flagellar motor switch protein FliG  33.64 
 
 
329 aa  224  2e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.324062  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3065  flagellar motor switch protein G  32.83 
 
 
349 aa  223  3e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0039  flagellar motor switch protein FliG  35.76 
 
 
360 aa  223  4e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.81346  normal  0.741048 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4394  flagellar motor switch protein FliG  35.06 
 
 
331 aa  223  4e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3227  flagellar motor switch protein G  34.04 
 
 
348 aa  223  4.9999999999999996e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1283  flagellar motor switch protein G  34.04 
 
 
348 aa  222  4.9999999999999996e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1350  flagellar motor switch protein G  34.04 
 
 
348 aa  222  4.9999999999999996e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.679184  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1343  flagellar motor switch protein G  34.04 
 
 
348 aa  223  4.9999999999999996e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.415793 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3806  flagellar motor switch protein FliG  35.67 
 
 
331 aa  222  6e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.055767  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3080  flagellar motor switch protein FliG  35.67 
 
 
331 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.178582  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1651  flagellar motor switch protein FliG  35.24 
 
 
338 aa  221  9.999999999999999e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.234145  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3067  flagellar motor switch protein G  33.74 
 
 
350 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.999326 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2296  flagellar motor switch protein G  33.44 
 
 
345 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2935  flagellar motor switch protein G  33.74 
 
 
350 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2925  flagellar motor switch protein G  33.74 
 
 
350 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1438  flagellar motor switch protein G  33.74 
 
 
350 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2575  flagellar motor switch protein G  33.74 
 
 
348 aa  220  3e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.272553  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24220  flagellar motor switch protein  35.35 
 
 
331 aa  219  3.9999999999999997e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00171195  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2669  flagellar motor switch protein FliG  36.97 
 
 
338 aa  218  8.999999999999998e-56  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1601  flagellar motor switch protein FliG  33.74 
 
 
333 aa  218  1e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.523158  normal  0.301606 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1183  flagellar motor switch protein G  33.84 
 
 
351 aa  217  2e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0685  flagellar motor switch protein G  35.35 
 
 
340 aa  216  2.9999999999999998e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.569445 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2187  flagellar motor switch protein G  32.62 
 
 
346 aa  216  4e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1367  flagellar motor switch protein G  31.61 
 
 
347 aa  216  5e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0566  flagellar motor switch protein  34.15 
 
 
331 aa  216  5.9999999999999996e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.298533  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1956  flagellar motor switch protein FliG  35.65 
 
 
331 aa  215  9.999999999999999e-55  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.389436  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2976  flagellar motor switch protein G  33.95 
 
 
331 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.593842 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1503  flagellar motor switch protein G  35.71 
 
 
351 aa  214  1.9999999999999998e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0689  flagellar motor switch protein FliG  35.44 
 
 
338 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0639  flagellar motor switch protein FliG  35.06 
 
 
331 aa  214  1.9999999999999998e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3110  flagellar motor switch protein G  33.95 
 
 
331 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.464673  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0199  flagellar motor switch protein G  34.26 
 
 
331 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>