253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_3845 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_1458  flagellar motor switch protein G  91.99 
 
 		 362 aa  679    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1273  flagellar motor switch protein G  95.86 
 
 		 362 aa  703    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0206621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0942  flagellar motor switch protein G  88.67 
 
 		 362 aa  663    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.386394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3845  flagellar motor switch protein G  100 
 
 		 362 aa  731    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00997148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0690  flagellar motor switch protein G  83.98 
 
 		 362 aa  636    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.183913  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0598  flagellar motor switch protein G  83.2 
 
 		 363 aa  627  1e-178  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1875  flagellar motor switch protein G  80.11 
 
 		 362 aa  608  1e-173  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.937536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2183  flagellar motor switch protein G  62.31 
 
 		 342 aa  442  1e-123  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.86816  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0544  flagellar motor switch protein G  61.33 
 
 		 339 aa  436  1e-121  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0579063  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1013  flagellar motor switch protein G  61.03 
 
 		 339 aa  431  1e-119  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.19786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0685  flagellar motor switch protein G  59.57 
 
 		 340 aa  429  1e-119  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.569445 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5058  flagellar motor switch protein G  57.06 
 
 		 352 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0468557  normal  0.917887 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6058  flagellar motor switch protein G  56.51 
 
 		 350 aa  398  9.999999999999999e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0938799  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5125  flagellar motor switch protein G  56.8 
 
 		 350 aa  393  1e-108  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0108237 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4572  flagellar motor switch protein G  55.62 
 
 		 351 aa  384  1e-105  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.69886  normal  0.551331 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4091  flagellar motor switch protein G  55.62 
 
 		 351 aa  375  1e-103  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0769367  normal  0.520256 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4459  flagellar motor switch protein G  55.62 
 
 		 351 aa  375  1e-103  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.845302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3459  flagellar motor switch protein G  51.35 
 
 		 350 aa  345  6e-94  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.195732  normal  0.0569561 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1474  flagellar motor switch protein G  49.35 
 
 		 336 aa  321  9.999999999999999e-87  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0617  flagellar motor switch protein FliG  35.91 
 
 		 358 aa  219  5e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.588192 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0649  flagellar motor switch protein FliG  35.29 
 
 		 359 aa  218  1e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.150242 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0638  flagellar motor switch protein FliG  35.29 
 
 		 359 aa  218  1e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.270127  normal  0.23501 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1092  flagellar motor switch protein FliG  32.25 
 
 		 344 aa  204  1e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.606344 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3216  flagellar motor switch protein FliG  33.54 
 
 		 345 aa  200  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.476285 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0466  flagellar motor switch protein G  32.94 
 
 		 340 aa  195  8.000000000000001e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1374  flagellar motor switch protein FliG  33.03 
 
 		 338 aa  191  1e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.332403  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0728  flagellar motor switch protein G  33.43 
 
 		 335 aa  191  2e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4212  flagellar motor switch protein FliG  30 
 
 		 330 aa  191  2e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0704  flagellar motor switch protein G  33.43 
 
 		 335 aa  191  2e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3427  flagellar motor switch protein FliG  30.3 
 
 		 330 aa  190  4e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1692  flagellar motor switch protein G  31.74 
 
 		 335 aa  189  7e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3921  flagellar motor switch protein FliG  30.82 
 
 		 330 aa  189  9e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0392291 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3837  flagellar motor switch protein FliG  30.82 
 
 		 330 aa  188  1e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0411  flagellar motor switch protein FliG  29.39 
 
 		 330 aa  187  2e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3303  flagellar motor switch protein FliG  30.3 
 
 		 333 aa  187  2e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0021  flagellar motor switch protein FliG  31.33 
 
 		 344 aa  187  2e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3111  flagellar motor switch protein FliG  30.82 
 
 		 330 aa  186  5e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0833  flagellar motor switch protein G  33.74 
 
 		 336 aa  185  8e-46  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00477309  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0477  flagellar motor switch protein G  34.23 
 
 		 336 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3030  flagellar motor switch protein FliG  31.38 
 
 		 336 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.647679  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2172  flagellar motor switch protein G  34.73 
 
 		 335 aa  182  7e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1715  flagellar motor switch protein FliG  31.1 
 
 		 342 aa  181  2e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.635605  normal  0.0531667 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1336  flagellar motor switch protein FliG  34.13 
 
 		 336 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.219515  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1392  flagellar motor switch protein FliG  30.3 
 
 		 335 aa  179  4.999999999999999e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.819068 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2004  flagellar motor switch protein G  31.96 
 
 		 339 aa  179  8e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2807  flagellar motor switch protein FliG  29.64 
 
 		 344 aa  176  4e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.996528 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2043  flagellar motor switch protein FliG  32.63 
 
 		 337 aa  175  9e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1216  flagellar motor switch protein G  32.93 
 
 		 349 aa  174  1.9999999999999998e-42  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0296  flagellar motor switch protein G  35.65 
 
 		 344 aa  174  1.9999999999999998e-42  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0497  flagellar motor switch protein FliG  33.44 
 
 		 329 aa  174  2.9999999999999996e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.324062  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1112  flagellar motor switch protein G  30.61 
 
 		 339 aa  173  5e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2669  flagellar motor switch protein FliG  31.02 
 
 		 338 aa  173  5e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2050  flagellar motor switch protein G  30.24 
 
 		 342 aa  172  5.999999999999999e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0362  flagellar motor switch protein FliG  32.93 
 
 		 343 aa  171  2e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.230636  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1191  flagellar motor switch protein FliG  30.95 
 
 		 340 aa  171  2e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0352  flagellar motor switch protein FliG  32.06 
 
 		 333 aa  170  3e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0772  flagellar motor switch protein G  31.61 
 
 		 336 aa  169  6e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.250722 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2288  flagellar motor switch protein FliG  32.69 
 
 		 338 aa  169  7e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0648  flagellar motor switch protein FliG  31.9 
 
 		 332 aa  168  1e-40  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0245668  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0710  flagellar motor switch protein FliG  32.51 
 
 		 334 aa  167  2.9999999999999998e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.618446 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0434  flagellar motor switch protein FliG  30.63 
 
 		 346 aa  166  4e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0450299  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1571  flagellar motor switch protein FliG  30.43 
 
 		 331 aa  166  5e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.239902  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0758  flagellar motor switch protein FliG  30.61 
 
 		 341 aa  166  5e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0789  flagellar motor switch protein FliG  31.9 
 
 		 348 aa  166  5.9999999999999996e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0173837  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1968  flagellar motor switch protein G  31.16 
 
 		 338 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2716  flagellar motor switch protein FliG  30.65 
 
 		 339 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0842  flagellar motor switch protein FliG  29.73 
 
 		 335 aa  164  3e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00980  flagellar motor switch protein FliG  31.71 
 
 		 336 aa  163  5.0000000000000005e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.882654  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06186  flagellar motor switch protein FliG  31.71 
 
 		 336 aa  163  5.0000000000000005e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0060655  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0039  flagellar motor switch protein FliG  32.73 
 
 		 360 aa  162  6e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.81346  normal  0.741048 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1390  flagellar motor switch protein FliG  30.82 
 
 		 336 aa  162  8.000000000000001e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02888  flagellar motor switch protein G  29.38 
 
 		 346 aa  162  1e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1367  flagellar motor switch protein G  30.91 
 
 		 347 aa  161  1e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4149  flagellar motor switch protein G  31.64 
 
 		 334 aa  161  2e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0270  flagellar motor switch protein FliG  29.31 
 
 		 336 aa  160  2e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1651  flagellar motor switch protein FliG  31.72 
 
 		 341 aa  160  4e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.100481  normal  0.381395 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1764  flagellar motor switch protein FliG  31.14 
 
 		 336 aa  160  4e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.792926  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2560  flagellar motor switch protein FliG  32.34 
 
 		 349 aa  158  1e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00224788  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3065  flagellar motor switch protein G  29.91 
 
 		 349 aa  159  1e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3227  flagellar motor switch protein G  29.43 
 
 		 348 aa  158  2e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1537  flagellar motor switch protein G  29.88 
 
 		 339 aa  157  2e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2464  flagellar motor switch protein FliG  32.34 
 
 		 349 aa  158  2e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00903662  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1619  flagellar motor switch protein G  29.79 
 
 		 349 aa  157  2e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3046  flagellar motor switch protein G  28.88 
 
 		 351 aa  157  2e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1343  flagellar motor switch protein G  29.43 
 
 		 348 aa  158  2e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.415793 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3096  flagellar motor switch protein FliG  32.28 
 
 		 330 aa  157  2e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3693  flagellar motor switch protein G  29.25 
 
 		 339 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1288  flagellar motor switch protein FliG  32.52 
 
 		 344 aa  157  3e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.392476  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2407  flagellar motor switch protein FliG  30.12 
 
 		 337 aa  157  3e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1325  flagellar motor switch protein G  28.07 
 
 		 348 aa  156  4e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1996  flagellar motor switch protein G  31.01 
 
 		 347 aa  157  4e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1283  flagellar motor switch protein G  29.13 
 
 		 348 aa  156  5.0000000000000005e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1350  flagellar motor switch protein G  29.13 
 
 		 348 aa  156  5.0000000000000005e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.679184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2187  flagellar motor switch protein G  30.67 
 
 		 346 aa  156  6e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2346  flagellar motor switch protein FliG  34.04 
 
 		 338 aa  156  6e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.122165  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1438  flagellar motor switch protein G  28.95 
 
 		 350 aa  156  6e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2925  flagellar motor switch protein G  28.95 
 
 		 350 aa  156  6e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2935  flagellar motor switch protein G  28.95 
 
 		 350 aa  156  6e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3067  flagellar motor switch protein G  28.95 
 
 		 350 aa  156  6e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.999326 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2296  flagellar motor switch protein G  30.03 
 
 		 345 aa  155  8e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>