253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3096 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_3096  flagellar motor switch protein FliG  100 
 
 
330 aa  657    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0466  flagellar motor switch protein G  46.91 
 
 
340 aa  308  9e-83  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0728  flagellar motor switch protein G  46.34 
 
 
335 aa  306  3e-82  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0704  flagellar motor switch protein G  46.04 
 
 
335 aa  306  5.0000000000000004e-82  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2050  flagellar motor switch protein G  45.06 
 
 
342 aa  303  3.0000000000000004e-81  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2004  flagellar motor switch protein G  46.91 
 
 
339 aa  291  1e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0477  flagellar motor switch protein G  47.08 
 
 
336 aa  290  2e-77  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1692  flagellar motor switch protein G  42.46 
 
 
335 aa  287  1e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1392  flagellar motor switch protein FliG  42.77 
 
 
335 aa  287  2e-76  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.819068 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1374  flagellar motor switch protein FliG  40.61 
 
 
338 aa  285  5.999999999999999e-76  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.332403  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1112  flagellar motor switch protein G  44.62 
 
 
339 aa  283  2.0000000000000002e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1390  flagellar motor switch protein FliG  44.44 
 
 
336 aa  281  1e-74  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2407  flagellar motor switch protein FliG  44.86 
 
 
337 aa  280  2e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2043  flagellar motor switch protein FliG  44.24 
 
 
337 aa  280  3e-74  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0758  flagellar motor switch protein FliG  44.07 
 
 
341 aa  279  4e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0833  flagellar motor switch protein G  43.33 
 
 
336 aa  279  6e-74  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00477309  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1764  flagellar motor switch protein FliG  42.68 
 
 
336 aa  276  2e-73  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.792926  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4149  flagellar motor switch protein G  42.55 
 
 
334 aa  276  3e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2716  flagellar motor switch protein FliG  44.34 
 
 
339 aa  276  4e-73  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0772  flagellar motor switch protein G  43.16 
 
 
336 aa  273  2.0000000000000002e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.250722 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2172  flagellar motor switch protein G  45.68 
 
 
335 aa  274  2.0000000000000002e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0296  flagellar motor switch protein G  45.03 
 
 
344 aa  269  5.9999999999999995e-71  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0362  flagellar motor switch protein FliG  40.12 
 
 
343 aa  268  1e-70  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.230636  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1336  flagellar motor switch protein FliG  43.83 
 
 
336 aa  267  2e-70  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.219515  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1216  flagellar motor switch protein G  39.69 
 
 
349 aa  261  1e-68  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2346  flagellar motor switch protein FliG  42.68 
 
 
338 aa  261  2e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.122165  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0039  flagellar motor switch protein FliG  40.43 
 
 
360 aa  258  9e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.81346  normal  0.741048 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0842  flagellar motor switch protein FliG  41.77 
 
 
335 aa  256  5e-67  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0789  flagellar motor switch protein FliG  40.43 
 
 
348 aa  242  5e-63  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0173837  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0689  flagellar motor switch protein FliG  39.69 
 
 
338 aa  240  2e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0977  flagellar motor switch protein FliG  39.27 
 
 
361 aa  237  2e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.252383  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1651  flagellar motor switch protein FliG  40.72 
 
 
341 aa  233  3e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.100481  normal  0.381395 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0411  flagellar motor switch protein FliG  39.26 
 
 
330 aa  227  3e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3111  flagellar motor switch protein FliG  38.65 
 
 
330 aa  227  3e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3030  flagellar motor switch protein FliG  37.85 
 
 
336 aa  225  1e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.647679  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0138  flagellar motor switch protein FliG  41.51 
 
 
337 aa  222  7e-57  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.902934  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2026  flagellar motor switch protein FliG  37.95 
 
 
341 aa  218  1e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.423161 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3427  flagellar motor switch protein FliG  36.2 
 
 
330 aa  214  9.999999999999999e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3303  flagellar motor switch protein FliG  37.27 
 
 
333 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3837  flagellar motor switch protein FliG  36.81 
 
 
330 aa  213  4.9999999999999996e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3921  flagellar motor switch protein FliG  36.81 
 
 
330 aa  213  4.9999999999999996e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0392291 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4212  flagellar motor switch protein FliG  35.58 
 
 
330 aa  212  5.999999999999999e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31210  flagellar motor switch protein FliG  37.95 
 
 
337 aa  212  7.999999999999999e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0507459  normal  0.0710438 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2669  flagellar motor switch protein FliG  37.04 
 
 
338 aa  211  1e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00980  flagellar motor switch protein FliG  35.26 
 
 
336 aa  209  5e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.882654  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06186  flagellar motor switch protein FliG  35.26 
 
 
336 aa  209  5e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0060655  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0270  flagellar motor switch protein FliG  36.59 
 
 
336 aa  209  7e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1651  flagellar motor switch protein FliG  36.86 
 
 
338 aa  208  1e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.234145  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1571  flagellar motor switch protein FliG  36.62 
 
 
331 aa  207  2e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.239902  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1592  flagellar motor switch protein G  36.86 
 
 
343 aa  205  9e-52  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1968  flagellar motor switch protein G  35.8 
 
 
338 aa  205  9e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3447  flagellar motor switch protein G  34.35 
 
 
337 aa  204  1e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2288  flagellar motor switch protein FliG  38.96 
 
 
338 aa  202  5e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1669  flagellar motor switch protein G  36.54 
 
 
343 aa  201  1.9999999999999998e-50  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0219  flagellar motor switch protein FliG  36 
 
 
341 aa  200  3e-50  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2824  flagellar motor switch protein G  34.95 
 
 
338 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.113129  normal  0.0174319 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0364  flagellar motor switch protein G  35.38 
 
 
342 aa  199  5e-50  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0341  flagellar motor switch protein G  35.38 
 
 
342 aa  199  5e-50  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1959  flagellar motor switch protein FliG  34.97 
 
 
333 aa  199  6e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.193303  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0473  flagellar motor switch protein G  36.83 
 
 
342 aa  198  9e-50  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1644  flagellar motor switch protein G  35.38 
 
 
342 aa  197  2.0000000000000003e-49  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.255846  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3456  flagellar motor switch protein G  34.66 
 
 
338 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1537  flagellar motor switch protein G  34.66 
 
 
339 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3693  flagellar motor switch protein G  34.26 
 
 
339 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0352  flagellar motor switch protein FliG  37.86 
 
 
333 aa  196  3e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4269  flagellar motor switch protein G  34.66 
 
 
338 aa  197  3e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0460415  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0497  flagellar motor switch protein FliG  33.74 
 
 
329 aa  196  6e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.324062  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1017  flagellar motor switch protein FliG  34.56 
 
 
333 aa  195  7e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50130  flagellar motor switch protein G  34.36 
 
 
338 aa  195  8.000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.509893  hitchhiker  0.0042041 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4368  flagellar motor switch protein G  33.44 
 
 
339 aa  194  1e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.861838 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3929  flagellar motor switch protein G  33.44 
 
 
339 aa  194  1e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1325  flagellar motor switch protein G  33.12 
 
 
348 aa  194  1e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1996  flagellar motor switch protein G  35.06 
 
 
347 aa  194  1e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1499  flagellar motor switch protein G  33.44 
 
 
339 aa  194  2e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.757112  normal  0.857063 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02888  flagellar motor switch protein G  33.74 
 
 
346 aa  192  7e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2358  flagellar motor switch protein FliG  35.89 
 
 
334 aa  192  8e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1723  flagellar motor switch protein  32.52 
 
 
329 aa  191  1e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1357  flagellar motor switch protein G  35.44 
 
 
342 aa  192  1e-47  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1723  flagellar motor switch protein  32.52 
 
 
329 aa  191  2e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0266  flagellar motor switch protein G  34.94 
 
 
342 aa  191  2e-47  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1367  flagellar motor switch protein G  33.13 
 
 
347 aa  191  2e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0054  flagellar motor switch protein FliG  35.38 
 
 
340 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0822309  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1689  flagellar motor switch protein FliG  35.38 
 
 
340 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00159309  hitchhiker  0.00060474 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1159  flagellar motor switch protein FliG  32.22 
 
 
337 aa  189  4e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00707491 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2296  flagellar motor switch protein G  33.13 
 
 
345 aa  188  9e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0710  flagellar motor switch protein FliG  33.13 
 
 
334 aa  188  1e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.618446 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0570  flagellar motor switch protein FliG  32.22 
 
 
343 aa  187  2e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0772  flagellar motor switch protein FliG  34.15 
 
 
334 aa  187  2e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0843003  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1183  flagellar motor switch protein G  33.03 
 
 
351 aa  187  2e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1642  flagellar motor switch protein FliG  34.65 
 
 
339 aa  187  3e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.049908  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0434  flagellar motor switch protein FliG  32.1 
 
 
346 aa  186  4e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0450299  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3046  flagellar motor switch protein G  31.91 
 
 
351 aa  186  5e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0391  flagellar motor switch protein G  32.93 
 
 
330 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.977742  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3065  flagellar motor switch protein G  32.41 
 
 
349 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3227  flagellar motor switch protein G  32.22 
 
 
348 aa  184  3e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1438  flagellar motor switch protein G  32.11 
 
 
350 aa  183  3e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2935  flagellar motor switch protein G  32.11 
 
 
350 aa  183  3e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1343  flagellar motor switch protein G  32.22 
 
 
348 aa  183  3e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.415793 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3067  flagellar motor switch protein G  32.11 
 
 
350 aa  183  3e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.999326 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2925  flagellar motor switch protein G  32.11 
 
 
350 aa  183  3e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>