246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_04974 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_04974  flagellar motor switch protein G  100 
 
 
339 aa  696    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001187  flagellar motor switch protein FliG  93.56 
 
 
295 aa  572  1.0000000000000001e-162  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3564  flagellar motor switch protein G  46.18 
 
 
350 aa  323  4e-87  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0251  flagellar motor switch protein G  45.35 
 
 
336 aa  313  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3381  flagellar motor switch protein G  45.35 
 
 
336 aa  312  4.999999999999999e-84  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.344677  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4416  flagellar motor switch protein FliG  44.65 
 
 
354 aa  312  4.999999999999999e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.202988 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3475  flagellar motor switch protein G  46.58 
 
 
328 aa  312  6.999999999999999e-84  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3658  flagellar motor switch protein G  44.67 
 
 
338 aa  306  2.0000000000000002e-82  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0233  flagellar motor switch protein G  45.27 
 
 
347 aa  305  5.0000000000000004e-82  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.347754 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3978  flagellar motor switch protein G  45.65 
 
 
328 aa  305  5.0000000000000004e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0632  flagellar motor switch protein G  44.97 
 
 
347 aa  304  1.0000000000000001e-81  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0712  flagellar motor switch protein G  44.97 
 
 
347 aa  303  2.0000000000000002e-81  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0076  flagellar motor switch protein G  44.62 
 
 
337 aa  298  1e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0082  flagellar motor switch protein G  44.31 
 
 
337 aa  297  2e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4656  flagellar motor switch protein G  40.65 
 
 
350 aa  277  2e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.508113  normal  0.411432 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0172  flagellar motor switch protein G  44.44 
 
 
337 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.604211  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0224  flagellar motor switch protein G  44.44 
 
 
337 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2187  flagellar motor switch protein G  33.75 
 
 
346 aa  191  2e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1968  flagellar motor switch protein G  34.15 
 
 
338 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1996  flagellar motor switch protein G  33.75 
 
 
347 aa  189  5.999999999999999e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1159  flagellar motor switch protein FliG  32.91 
 
 
337 aa  175  9.999999999999999e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00707491 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1959  flagellar motor switch protein FliG  31.66 
 
 
333 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.193303  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3456  flagellar motor switch protein G  31.97 
 
 
338 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1977  flagellar motor switch protein FliG  32.18 
 
 
331 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3046  flagellar motor switch protein G  29.59 
 
 
351 aa  172  5.999999999999999e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4368  flagellar motor switch protein G  31.66 
 
 
339 aa  172  1e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.861838 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3929  flagellar motor switch protein G  31.66 
 
 
339 aa  172  1e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03161  flagellar motor switch protein G  30.38 
 
 
351 aa  171  2e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002816  flagellar motor switch protein FliG  30.38 
 
 
351 aa  170  3e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1537  flagellar motor switch protein G  31.03 
 
 
339 aa  170  3e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06186  flagellar motor switch protein FliG  32.19 
 
 
336 aa  170  3e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0060655  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00980  flagellar motor switch protein FliG  32.19 
 
 
336 aa  170  3e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.882654  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1367  flagellar motor switch protein G  30.72 
 
 
347 aa  169  4e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3693  flagellar motor switch protein G  31.35 
 
 
339 aa  169  5e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1183  flagellar motor switch protein G  30.41 
 
 
351 aa  169  9e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3067  flagellar motor switch protein G  30.41 
 
 
350 aa  167  2e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.999326 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1499  flagellar motor switch protein G  31.03 
 
 
339 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.757112  normal  0.857063 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1438  flagellar motor switch protein G  30.41 
 
 
350 aa  167  2e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2935  flagellar motor switch protein G  30.41 
 
 
350 aa  167  2e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4269  flagellar motor switch protein G  30.72 
 
 
338 aa  167  2e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0460415  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2925  flagellar motor switch protein G  30.41 
 
 
350 aa  167  2e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02888  flagellar motor switch protein G  29.65 
 
 
346 aa  167  2.9999999999999998e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1716  flagellar motor switch protein G  31.01 
 
 
338 aa  167  2.9999999999999998e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2296  flagellar motor switch protein G  31.03 
 
 
345 aa  166  4e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2307  flagellar motor switch protein G  28.75 
 
 
350 aa  166  5.9999999999999996e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1325  flagellar motor switch protein G  29.15 
 
 
348 aa  166  6.9999999999999995e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3227  flagellar motor switch protein G  30.09 
 
 
348 aa  165  8e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3447  flagellar motor switch protein G  30.41 
 
 
337 aa  165  9e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1343  flagellar motor switch protein G  30.09 
 
 
348 aa  165  9e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.415793 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1362  flagellar motor switch protein G  29.47 
 
 
349 aa  165  9e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50130  flagellar motor switch protein G  30.09 
 
 
338 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.509893  hitchhiker  0.0042041 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2824  flagellar motor switch protein G  30.6 
 
 
338 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.113129  normal  0.0174319 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1283  flagellar motor switch protein G  29.57 
 
 
348 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1350  flagellar motor switch protein G  29.57 
 
 
348 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.679184  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1017  flagellar motor switch protein FliG  29.65 
 
 
333 aa  163  3e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1601  flagellar motor switch protein FliG  29.85 
 
 
333 aa  163  4.0000000000000004e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.523158  normal  0.301606 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2575  flagellar motor switch protein G  29.47 
 
 
348 aa  163  4.0000000000000004e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.272553  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3065  flagellar motor switch protein G  30.09 
 
 
349 aa  162  6e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1619  flagellar motor switch protein G  29.97 
 
 
349 aa  162  1e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1114  flagellar motor switch protein FliG  29.9 
 
 
331 aa  161  1e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.622643  normal  0.125066 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0566  flagellar motor switch protein  29.97 
 
 
331 aa  159  9e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.298533  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1723  flagellar motor switch protein  27.76 
 
 
329 aa  157  2e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3806  flagellar motor switch protein FliG  29.62 
 
 
331 aa  157  2e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.055767  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1723  flagellar motor switch protein  27.76 
 
 
329 aa  157  3e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0434  flagellar motor switch protein FliG  30.38 
 
 
346 aa  157  3e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0450299  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2358  flagellar motor switch protein FliG  29.97 
 
 
334 aa  156  5.0000000000000005e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3771  flagellar motor switch protein G  28.71 
 
 
331 aa  155  7e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0165  flagellar motor switch protein G  28.71 
 
 
331 aa  155  8e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.629305 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3080  flagellar motor switch protein FliG  29.3 
 
 
331 aa  155  8e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.178582  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4394  flagellar motor switch protein FliG  29.17 
 
 
331 aa  154  2e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1879  flagellar motor switch protein FliG  31.25 
 
 
333 aa  153  2.9999999999999998e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.246079  normal  0.586274 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0199  flagellar motor switch protein G  29.07 
 
 
331 aa  153  4e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2932  flagellar motor switch protein G  28.25 
 
 
331 aa  153  5e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2976  flagellar motor switch protein G  28.43 
 
 
331 aa  153  5e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.593842 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3110  flagellar motor switch protein G  28.43 
 
 
331 aa  153  5e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.464673  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3062  flagellar motor switch protein G  28.43 
 
 
331 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0772  flagellar motor switch protein FliG  29.11 
 
 
334 aa  152  7e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0843003  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0639  flagellar motor switch protein FliG  27.71 
 
 
331 aa  152  8e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3280  flagellar motor switch protein G  28.75 
 
 
331 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.67552  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0416  flagellar motor switch protein G  28.75 
 
 
331 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.329911  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2945  flagellar motor switch protein G  28.75 
 
 
331 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.18619  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0221  flagellar motor switch protein G  28.75 
 
 
331 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0619042  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0233  flagellar motor switch protein G  28.75 
 
 
331 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0631477  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2451  flagellar motor switch protein G  28.57 
 
 
331 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00544517  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3065  flagellar motor switch protein G  28.57 
 
 
331 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00336873  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0054  flagellar motor switch protein FliG  28.4 
 
 
340 aa  150  2e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0822309  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0497  flagellar motor switch protein FliG  27.36 
 
 
329 aa  151  2e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.324062  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2143  flagellar motor switch protein G  28.43 
 
 
331 aa  150  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.536155  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1689  flagellar motor switch protein FliG  28.4 
 
 
340 aa  150  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00159309  hitchhiker  0.00060474 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3401  flagellar motor switch protein G  28.43 
 
 
331 aa  150  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3084  flagellar motor switch protein G  28.57 
 
 
331 aa  151  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.231623  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1503  flagellar motor switch protein G  28.8 
 
 
351 aa  149  5e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1441  flagellar motor switch protein FliG  28.57 
 
 
339 aa  149  5e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0710  flagellar motor switch protein FliG  27.76 
 
 
334 aa  147  3e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.618446 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1642  flagellar motor switch protein FliG  28.88 
 
 
339 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.049908  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6414  flagellar motor switch protein G  27.3 
 
 
331 aa  145  9e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.326479 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2050  flagellar motor switch protein G  28.18 
 
 
342 aa  145  9e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4169  flagellar motor switch protein FliG  31.21 
 
 
331 aa  145  1e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.562365  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0551  flagellar motor switch protein FliG  27.67 
 
 
332 aa  145  1e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2900  flagellar motor switch protein FliG  29.56 
 
 
333 aa  144  2e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0290509  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>