243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_4416 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_4416  flagellar motor switch protein FliG  100 
 
 		 354 aa  714    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.202988 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0251  flagellar motor switch protein G  54.55 
 
 		 336 aa  383  1e-105  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3381  flagellar motor switch protein G  53.94 
 
 		 336 aa  380  1e-104  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.344677  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0233  flagellar motor switch protein G  52.76 
 
 		 347 aa  365  1e-100  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.347754 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0712  flagellar motor switch protein G  53.07 
 
 		 347 aa  366  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0632  flagellar motor switch protein G  52.76 
 
 		 347 aa  363  3e-99  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04974  flagellar motor switch protein G  44.65 
 
 		 339 aa  312  5.999999999999999e-84  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0172  flagellar motor switch protein G  47.84 
 
 		 337 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.604211  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0224  flagellar motor switch protein G  47.84 
 
 		 337 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0076  flagellar motor switch protein G  45.37 
 
 		 337 aa  290  2e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3978  flagellar motor switch protein G  45.34 
 
 		 328 aa  290  2e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3475  flagellar motor switch protein G  45.34 
 
 		 328 aa  288  1e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4656  flagellar motor switch protein G  42.77 
 
 		 350 aa  287  2e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.508113  normal  0.411432 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0082  flagellar motor switch protein G  43.9 
 
 		 337 aa  287  2e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3658  flagellar motor switch protein G  42.35 
 
 		 338 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001187  flagellar motor switch protein FliG  44.41 
 
 		 295 aa  280  3e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3564  flagellar motor switch protein G  37.69 
 
 		 350 aa  260  3e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2307  flagellar motor switch protein G  33.86 
 
 		 350 aa  177  2e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3693  flagellar motor switch protein G  33.96 
 
 		 339 aa  176  6e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3046  flagellar motor switch protein G  32.08 
 
 		 351 aa  175  9.999999999999999e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1968  flagellar motor switch protein G  32.61 
 
 		 338 aa  173  3.9999999999999995e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50130  flagellar motor switch protein G  33.02 
 
 		 338 aa  172  1e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.509893  hitchhiker  0.0042041 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4269  flagellar motor switch protein G  32.7 
 
 		 338 aa  171  2e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0460415  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1996  flagellar motor switch protein G  31.99 
 
 		 347 aa  171  2e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1716  flagellar motor switch protein G  33.33 
 
 		 338 aa  170  3e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4368  flagellar motor switch protein G  33.02 
 
 		 339 aa  170  4e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.861838 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3929  flagellar motor switch protein G  33.02 
 
 		 339 aa  170  4e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02888  flagellar motor switch protein G  32.39 
 
 		 346 aa  169  5e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1959  flagellar motor switch protein FliG  33.33 
 
 		 333 aa  169  7e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.193303  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3456  flagellar motor switch protein G  32.72 
 
 		 338 aa  168  1e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1537  flagellar motor switch protein G  33.33 
 
 		 339 aa  168  1e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03161  flagellar motor switch protein G  32.29 
 
 		 351 aa  168  1e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2824  flagellar motor switch protein G  32.41 
 
 		 338 aa  168  1e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.113129  normal  0.0174319 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002816  flagellar motor switch protein FliG  31.33 
 
 		 351 aa  167  2e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1325  flagellar motor switch protein G  32.29 
 
 		 348 aa  167  2e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1499  flagellar motor switch protein G  32.41 
 
 		 339 aa  166  5e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.757112  normal  0.857063 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3447  flagellar motor switch protein G  31.33 
 
 		 337 aa  163  4.0000000000000004e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1159  flagellar motor switch protein FliG  31.37 
 
 		 337 aa  162  7e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00707491 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1367  flagellar motor switch protein G  31.46 
 
 		 347 aa  162  7e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3227  flagellar motor switch protein G  31.87 
 
 		 348 aa  162  1e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1343  flagellar motor switch protein G  31.87 
 
 		 348 aa  162  1e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.415793 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2935  flagellar motor switch protein G  31.56 
 
 		 350 aa  161  2e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1438  flagellar motor switch protein G  31.56 
 
 		 350 aa  161  2e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3067  flagellar motor switch protein G  31.56 
 
 		 350 aa  161  2e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.999326 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2925  flagellar motor switch protein G  31.56 
 
 		 350 aa  161  2e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1283  flagellar motor switch protein G  31.56 
 
 		 348 aa  160  3e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1350  flagellar motor switch protein G  31.56 
 
 		 348 aa  160  3e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.679184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1183  flagellar motor switch protein G  31.76 
 
 		 351 aa  159  5e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2575  flagellar motor switch protein G  30.94 
 
 		 348 aa  159  5e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.272553  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2296  flagellar motor switch protein G  31.97 
 
 		 345 aa  159  6e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1114  flagellar motor switch protein FliG  32.19 
 
 		 331 aa  159  7e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.622643  normal  0.125066 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1362  flagellar motor switch protein G  30.65 
 
 		 349 aa  157  2e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2187  flagellar motor switch protein G  30.82 
 
 		 346 aa  158  2e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3065  flagellar motor switch protein G  31.13 
 
 		 349 aa  157  2e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1619  flagellar motor switch protein G  31.45 
 
 		 349 aa  157  4e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2358  flagellar motor switch protein FliG  30.53 
 
 		 334 aa  155  1e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1723  flagellar motor switch protein  30.7 
 
 		 329 aa  154  2.9999999999999998e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1723  flagellar motor switch protein  30.7 
 
 		 329 aa  153  4e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0054  flagellar motor switch protein FliG  31.27 
 
 		 340 aa  153  4e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0822309  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4394  flagellar motor switch protein FliG  31.45 
 
 		 331 aa  153  4e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1689  flagellar motor switch protein FliG  31.27 
 
 		 340 aa  153  4e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00159309  hitchhiker  0.00060474 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1642  flagellar motor switch protein FliG  31.25 
 
 		 339 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.049908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2948  flagellar motor switch protein G  31.35 
 
 		 330 aa  152  1e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3080  flagellar motor switch protein FliG  30.7 
 
 		 331 aa  150  3e-35  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.178582  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0710  flagellar motor switch protein FliG  27.64 
 
 		 334 aa  150  4e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.618446 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1503  flagellar motor switch protein G  30.5 
 
 		 351 aa  149  5e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06186  flagellar motor switch protein FliG  30.18 
 
 		 336 aa  147  2.0000000000000003e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0060655  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00980  flagellar motor switch protein FliG  30.18 
 
 		 336 aa  147  2.0000000000000003e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.882654  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3806  flagellar motor switch protein FliG  30.7 
 
 		 331 aa  148  2.0000000000000003e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.055767  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2013  flagellar motor switch protein G  29.91 
 
 		 330 aa  147  3e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1288  flagellar motor switch protein FliG  31.03 
 
 		 344 aa  147  3e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.392476  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2392  flagellar motor switch protein G  29.91 
 
 		 330 aa  147  3e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.178254  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2291  flagellar motor switch protein G  29.91 
 
 		 330 aa  147  3e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.60642  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1601  flagellar motor switch protein FliG  31.82 
 
 		 333 aa  145  1e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.523158  normal  0.301606 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2128  flagellar motor switch protein G  29.6 
 
 		 331 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.213906 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2186  flagellar motor switch protein G  29.6 
 
 		 331 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.296587 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2133  flagellar motor switch protein G  29.6 
 
 		 331 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000184117 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1149  flagellar motor switch protein G  29.6 
 
 		 331 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.561296  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1272  flagellar motor switch protein G  29.6 
 
 		 331 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.674292 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0566  flagellar motor switch protein  30.25 
 
 		 331 aa  144  2e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.298533  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1575  flagellar motor switch protein G  31.87 
 
 		 330 aa  144  3e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1017  flagellar motor switch protein FliG  28.3 
 
 		 333 aa  143  4e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1977  flagellar motor switch protein FliG  29.07 
 
 		 331 aa  143  4e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0497  flagellar motor switch protein FliG  26.88 
 
 		 329 aa  143  4e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.324062  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2530  flagellar motor switch protein G  29.41 
 
 		 333 aa  143  5e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0434  flagellar motor switch protein FliG  30.22 
 
 		 346 aa  142  9.999999999999999e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0450299  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0138  flagellar motor switch protein FliG  28.19 
 
 		 337 aa  141  9.999999999999999e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.902934  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1879  flagellar motor switch protein FliG  30.84 
 
 		 333 aa  142  9.999999999999999e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.246079  normal  0.586274 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4169  flagellar motor switch protein FliG  30.72 
 
 		 331 aa  142  9.999999999999999e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.562365  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0551  flagellar motor switch protein FliG  28.75 
 
 		 332 aa  140  3e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1956  flagellar motor switch protein FliG  29.87 
 
 		 331 aa  140  3e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.389436  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1709  flagellar motor switch protein FliG  28.66 
 
 		 331 aa  140  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.311791  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2715  flagellar motor switch protein G  28.66 
 
 		 331 aa  140  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.483179 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2039  flagellar motor switch protein G  28.66 
 
 		 331 aa  140  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2172  flagellar motor switch protein G  28.66 
 
 		 331 aa  140  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.450504  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1245  flagellar motor switch protein G  28.66 
 
 		 331 aa  140  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0466  flagellar motor switch protein G  29.53 
 
 		 340 aa  140  3.9999999999999997e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1703  flagellar motor switch protein G  28.66 
 
 		 331 aa  140  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0342564 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2932  flagellar motor switch protein G  29.11 
 
 		 331 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3401  flagellar motor switch protein G  30.72 
 
 		 331 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>