26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0884 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_0884    100 
 
 		 842 bp  1669    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.552937  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5695    95.28 
 
 		 381 bp  613  1e-173  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8452  integrase family protein  84.35 
 
 		 861 bp  377  1e-102  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.032039  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4502  integrase family protein  86.61 
 
 		 873 bp  103  8e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4806  phage integrase  87.13 
 
 		 876 bp  97.6  5e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.92941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0369    90.79 
 
 		 165 bp  95.6  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0262  integrase family protein  85.34 
 
 		 876 bp  95.6  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0826  putative phage integrase  87.8 
 
 		 801 bp  83.8  0.00000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.225694 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2348  phage integrase family protein  83.93 
 
 		 906 bp  79.8  0.000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1077  integrase family protein  86.9 
 
 		 876 bp  79.8  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6657  integrase family protein  86.9 
 
 		 876 bp  79.8  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.358251 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0822  putative phage integrase  83.87 
 
 		 876 bp  65.9  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.341397 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0858  phage integrase  83.17 
 
 		 870 bp  65.9  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3470  phage integrase family protein  89.8 
 
 		 909 bp  58  0.000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.229271  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7619  integrase family protein  88.46 
 
 		 879 bp  56  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.192826  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1196  phage integrase  87.5 
 
 		 876 bp  56  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7462  integrase family protein  88.46 
 
 		 879 bp  56  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.105755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6605  integrase family protein  88.46 
 
 		 879 bp  56  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3661  integrase family protein  87.5 
 
 		 873 bp  56  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.311976  decreased coverage  0.00000149049 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3629  integrase family protein  87.5 
 
 		 873 bp  56  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2797  phage integrase-like SAM-like  94.29 
 
 		 225 bp  54  0.00007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.554398  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3393    100 
 
 		 892 bp  54  0.00007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.281539  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3348  integrase domain protein SAM domain protein  92.11 
 
 		 366 bp  52  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6957  integrase family protein  86.54 
 
 		 879 bp  48.1  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0373  integrase domain protein SAM domain protein  88.64 
 
 		 780 bp  48.1  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1799  integron integrase  90 
 
 		 1389 bp  48.1  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.174616  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>