30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_2459 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_2459  CBS domain-containing protein  100 
 
 
185 aa  374  1e-103  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2693  CBS domain-containing protein  47.51 
 
 
215 aa  184  7e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03825  CBS domain protein  40.44 
 
 
187 aa  165  4e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1349  CBS domain-containing protein  44.75 
 
 
186 aa  164  1.0000000000000001e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.735809  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3704  signal transduction protein  37.57 
 
 
195 aa  149  2e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000122502  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1244  CBS domain-containing protein  36.22 
 
 
186 aa  148  4e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2237  CBS domain-containing protein  38.38 
 
 
197 aa  144  7.0000000000000006e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.303434  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1518  CBS domain-containing protein  34.57 
 
 
186 aa  144  9e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000300284  hitchhiker  0.000492354 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3813  hypothetical protein  40.45 
 
 
187 aa  138  3.9999999999999997e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00350231  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0102  CBS domain-containing protein  34.44 
 
 
209 aa  87  1e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.653521  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1893  CBS  30.52 
 
 
199 aa  81.3  0.000000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0664  hypothetical protein  31.79 
 
 
216 aa  80.5  0.00000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.358372  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0061  CBS domain containing protein  31.74 
 
 
201 aa  79.7  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.315899  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2035  hypothetical protein  28.72 
 
 
203 aa  78.2  0.00000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1857  CBS domain-containing protein  32.43 
 
 
197 aa  75.5  0.0000000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0333  CBS domain-containing protein  31.76 
 
 
197 aa  75.1  0.0000000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0342  CBS domain containing protein  29.25 
 
 
200 aa  73.2  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.292321  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2957  CBS domain-containing protein  27.72 
 
 
196 aa  72.4  0.000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2064  hypothetical protein  26.16 
 
 
195 aa  70.9  0.00000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0577346  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1720  putative signal-transduction protein with CBS domains  29.34 
 
 
197 aa  69.3  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.346801 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2062  CBS domain protein  29.34 
 
 
197 aa  69.3  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.628455  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0454  CBS  29.45 
 
 
218 aa  68.2  0.00000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4280  hypothetical protein  31.18 
 
 
251 aa  49.3  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0839  CBS domain containing membrane protein  23.68 
 
 
388 aa  47.4  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0914  putative signal transduction protein with CBS domains  24.26 
 
 
131 aa  42.7  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.0000312526  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0620  signal-transduction protein  27.42 
 
 
144 aa  42.7  0.003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0253  signal-transduction protein  26.19 
 
 
140 aa  42  0.005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.00276555  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0389  signal-transduction protein  30.21 
 
 
150 aa  41.6  0.006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1326  signal-transduction protein  26.61 
 
 
144 aa  41.6  0.006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3679  signal-transduction protein  31.11 
 
 
150 aa  41.2  0.009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>