27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_03825 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_03825  CBS domain protein  100 
 
 		 187 aa  385  1e-106  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2693  CBS domain-containing protein  45.9 
 
 		 215 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2459  CBS domain-containing protein  40.44 
 
 		 185 aa  165  4e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1518  CBS domain-containing protein  38.76 
 
 		 186 aa  153  1e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000300284  hitchhiker  0.000492354 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3704  signal transduction protein  39.89 
 
 		 195 aa  147  7e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000122502  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1349  CBS domain-containing protein  38.92 
 
 		 186 aa  147  1.0000000000000001e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.735809  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1244  CBS domain-containing protein  37.57 
 
 		 186 aa  144  5e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2237  CBS domain-containing protein  38.33 
 
 		 197 aa  138  4.999999999999999e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.303434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3813  hypothetical protein  34.25 
 
 		 187 aa  130  1.0000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00350231  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2035  hypothetical protein  29.65 
 
 		 203 aa  89  4e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0102  CBS domain-containing protein  30.67 
 
 		 209 aa  84  0.000000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.653521  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0664  hypothetical protein  29.33 
 
 		 216 aa  82.4  0.000000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.358372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0061  CBS domain containing protein  32 
 
 		 201 aa  81.3  0.000000000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.315899  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0342  CBS domain containing protein  28.72 
 
 		 200 aa  80.5  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.292321  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2062  CBS domain protein  29.24 
 
 		 197 aa  77.4  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.628455  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1720  putative signal-transduction protein with CBS domains  29.24 
 
 		 197 aa  77.4  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.346801 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0454  CBS  30 
 
 		 218 aa  73.2  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1857  CBS domain-containing protein  30.82 
 
 		 197 aa  73.6  0.000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0333  CBS domain-containing protein  30.14 
 
 		 197 aa  72.8  0.000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2064  hypothetical protein  28.25 
 
 		 195 aa  73.6  0.000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0577346  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2957  CBS domain-containing protein  30.97 
 
 		 196 aa  72.4  0.000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1893  CBS  29.17 
 
 		 199 aa  71.2  0.000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1669  CBS domain-containing protein  27.82 
 
 		 389 aa  45.8  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2035  CBS domain containing membrane protein  27.82 
 
 		 389 aa  45.8  0.0004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0677  signal transduction protein  27.27 
 
 		 399 aa  42.4  0.004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2675  CBS:HPP  24.59 
 
 		 379 aa  41.6  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2520  putative signal transduction protein with CBS domains  29.27 
 
 		 143 aa  41.2  0.01  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>