23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_2035 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_2035  hypothetical protein  100 
 
 
203 aa  409  1e-113  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0102  CBS domain-containing protein  33.94 
 
 
209 aa  100  1e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.653521  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0664  hypothetical protein  33.16 
 
 
216 aa  97.1  2e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.358372  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1349  CBS domain-containing protein  32.11 
 
 
186 aa  90.9  1e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.735809  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2062  CBS domain protein  31.76 
 
 
197 aa  90.5  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.628455  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1720  putative signal-transduction protein with CBS domains  31.76 
 
 
197 aa  90.5  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.346801 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03825  CBS domain protein  29.65 
 
 
187 aa  89  4e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1857  CBS domain-containing protein  33.53 
 
 
197 aa  88.2  7e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0333  CBS domain-containing protein  32.95 
 
 
197 aa  87.8  9e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1893  CBS  32.77 
 
 
199 aa  86.3  3e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2693  CBS domain-containing protein  30.85 
 
 
215 aa  86.3  3e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0061  CBS domain containing protein  33.16 
 
 
201 aa  85.1  7e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.315899  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1518  CBS domain-containing protein  31.71 
 
 
186 aa  85.1  7e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000300284  hitchhiker  0.000492354 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0454  CBS  35.4 
 
 
218 aa  84.3  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2064  hypothetical protein  31.02 
 
 
195 aa  82.8  0.000000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0577346  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0342  CBS domain containing protein  30.96 
 
 
200 aa  81.3  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.292321  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2459  CBS domain-containing protein  28.72 
 
 
185 aa  78.2  0.00000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3704  signal transduction protein  33.92 
 
 
195 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000122502  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2957  CBS domain-containing protein  32.47 
 
 
196 aa  76.3  0.0000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1244  CBS domain-containing protein  30.91 
 
 
186 aa  75.1  0.0000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2237  CBS domain-containing protein  27.08 
 
 
197 aa  68.9  0.00000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.303434  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3813  hypothetical protein  27.06 
 
 
187 aa  56.2  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00350231  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0771  signal-transduction protein  33.33 
 
 
164 aa  42  0.006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.411579  normal  0.0544722 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>