26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_1349 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_1349  CBS domain-containing protein  100 
 
 		 186 aa  376  1e-104  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.735809  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2459  CBS domain-containing protein  44.75 
 
 		 185 aa  164  1.0000000000000001e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2693  CBS domain-containing protein  41.85 
 
 		 215 aa  158  4e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3704  signal transduction protein  39.46 
 
 		 195 aa  153  1e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000122502  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03825  CBS domain protein  38.92 
 
 		 187 aa  147  1.0000000000000001e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1518  CBS domain-containing protein  41.3 
 
 		 186 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000300284  hitchhiker  0.000492354 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1244  CBS domain-containing protein  41.3 
 
 		 186 aa  145  3e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2237  CBS domain-containing protein  36.81 
 
 		 197 aa  122  3e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.303434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3813  hypothetical protein  35.71 
 
 		 187 aa  118  3.9999999999999996e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00350231  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2035  hypothetical protein  32.11 
 
 		 203 aa  90.9  9e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0102  CBS domain-containing protein  29.69 
 
 		 209 aa  79  0.00000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.653521  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2957  CBS domain-containing protein  32.19 
 
 		 196 aa  73.2  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0664  hypothetical protein  29.11 
 
 		 216 aa  72  0.000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.358372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0454  CBS  29.63 
 
 		 218 aa  70.5  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2062  CBS domain protein  31.65 
 
 		 197 aa  67.8  0.00000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.628455  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1720  putative signal-transduction protein with CBS domains  31.65 
 
 		 197 aa  67.8  0.00000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.346801 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0061  CBS domain containing protein  26.8 
 
 		 201 aa  67  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.315899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1893  CBS  28.05 
 
 		 199 aa  66.2  0.0000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0342  CBS domain containing protein  26 
 
 		 200 aa  61.2  0.000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.292321  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1857  CBS domain-containing protein  27.7 
 
 		 197 aa  59.7  0.00000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0333  CBS domain-containing protein  27.03 
 
 		 197 aa  59.3  0.00000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4280  hypothetical protein  27.49 
 
 		 251 aa  56.2  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2064  hypothetical protein  25 
 
 		 195 aa  55.8  0.0000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0577346  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0280  signal-transduction protein  28.91 
 
 		 141 aa  45.1  0.0006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.460001  normal  0.121609 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2962  putative signal transduction protein with CBS domains  30.23 
 
 		 145 aa  42  0.005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0735  putative signal transduction protein with CBS domains  26.52 
 
 		 290 aa  41.2  0.009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.14806  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>