23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_0664 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007404  Tbd_0664  hypothetical protein  100 
 
 
216 aa  432  1e-120  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.358372  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2064  hypothetical protein  46.88 
 
 
195 aa  165  5.9999999999999996e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0577346  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2957  CBS domain-containing protein  40.72 
 
 
196 aa  144  1e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0454  CBS  44.64 
 
 
218 aa  140  9.999999999999999e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0102  CBS domain-containing protein  40.51 
 
 
209 aa  140  9.999999999999999e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.653521  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2062  CBS domain protein  43.2 
 
 
197 aa  138  6e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.628455  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1720  putative signal-transduction protein with CBS domains  43.2 
 
 
197 aa  138  6e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.346801 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0061  CBS domain containing protein  44.97 
 
 
201 aa  138  7.999999999999999e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.315899  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0342  CBS domain containing protein  40.31 
 
 
200 aa  137  2e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.292321  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1893  CBS  36.08 
 
 
199 aa  125  4.0000000000000003e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1857  CBS domain-containing protein  37.66 
 
 
197 aa  107  1e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0333  CBS domain-containing protein  37.01 
 
 
197 aa  107  2e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2693  CBS domain-containing protein  33.53 
 
 
215 aa  105  6e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2035  hypothetical protein  33.16 
 
 
203 aa  97.1  2e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3704  signal transduction protein  34.16 
 
 
195 aa  89.4  4e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000122502  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03825  CBS domain protein  29.33 
 
 
187 aa  82.4  0.000000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2459  CBS domain-containing protein  31.79 
 
 
185 aa  80.5  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1518  CBS domain-containing protein  28.3 
 
 
186 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000300284  hitchhiker  0.000492354 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3813  hypothetical protein  29.08 
 
 
187 aa  77  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00350231  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1349  CBS domain-containing protein  29.11 
 
 
186 aa  72  0.000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.735809  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1244  CBS domain-containing protein  25 
 
 
186 aa  69.3  0.00000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2237  CBS domain-containing protein  28.99 
 
 
197 aa  66.2  0.0000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.303434  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0829  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  32.54 
 
 
504 aa  43.1  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.363415  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>