27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_1518 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_1518  CBS domain-containing protein  100 
 
 		 186 aa  380  1e-105  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000300284  hitchhiker  0.000492354 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1244  CBS domain-containing protein  70.65 
 
 		 186 aa  275  4e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03825  CBS domain protein  38.76 
 
 		 187 aa  153  1e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2693  CBS domain-containing protein  39.34 
 
 		 215 aa  149  3e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1349  CBS domain-containing protein  41.3 
 
 		 186 aa  147  1.0000000000000001e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.735809  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2459  CBS domain-containing protein  34.57 
 
 		 185 aa  144  9e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2237  CBS domain-containing protein  40.11 
 
 		 197 aa  129  2.0000000000000002e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.303434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3704  signal transduction protein  32.07 
 
 		 195 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.0000000122502  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3813  hypothetical protein  33.52 
 
 		 187 aa  106  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00350231  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2035  hypothetical protein  31.71 
 
 		 203 aa  85.1  6e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0664  hypothetical protein  28.3 
 
 		 216 aa  76.6  0.0000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.358372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0454  CBS  30.06 
 
 		 218 aa  72  0.000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1893  CBS  28.48 
 
 		 199 aa  70.1  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0342  CBS domain containing protein  26.85 
 
 		 200 aa  69.7  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.292321  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0061  CBS domain containing protein  27.33 
 
 		 201 aa  64.7  0.0000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.315899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0102  CBS domain-containing protein  27.33 
 
 		 209 aa  64.3  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.653521  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2957  CBS domain-containing protein  26.95 
 
 		 196 aa  63.5  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2064  hypothetical protein  27.65 
 
 		 195 aa  63.2  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0577346  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2062  CBS domain protein  28.38 
 
 		 197 aa  62  0.000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.628455  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1720  putative signal-transduction protein with CBS domains  28.38 
 
 		 197 aa  62  0.000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.346801 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4280  hypothetical protein  30.28 
 
 		 251 aa  58.9  0.00000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1857  CBS domain-containing protein  22.88 
 
 		 197 aa  55.5  0.0000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0333  CBS domain-containing protein  22.22 
 
 		 197 aa  55.1  0.0000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3679  signal-transduction protein  24.06 
 
 		 150 aa  44.7  0.0007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0562  hypothetical protein  29.91 
 
 		 439 aa  42  0.005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.371677  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0608  hemolysin  29.91 
 
 		 439 aa  42  0.005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0615  protein of unknown function DUF190  25 
 
 		 426 aa  41.2  0.008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>