61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_1741 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009975  MmarC6_1741  hypothetical protein  100 
 
 
235 aa  471  1e-132  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.300848  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0721  hypothetical protein  96.17 
 
 
235 aa  460  9.999999999999999e-129  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.538394  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0161  hypothetical protein  90.64 
 
 
235 aa  439  9.999999999999999e-123  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.110174 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0007  hypothetical protein  75.74 
 
 
236 aa  362  2e-99  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.121063  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0076  hypothetical protein  50.21 
 
 
235 aa  255  5e-67  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.656256  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1086  3-isopropylmalate dehydratase  37.77 
 
 
248 aa  154  1e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0926  hypothetical protein  36.4 
 
 
248 aa  150  2e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2010  hypothetical protein  35.62 
 
 
237 aa  146  3e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0720  hypothetical protein  35.19 
 
 
234 aa  144  1e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1927  hypothetical protein  36.65 
 
 
242 aa  141  9.999999999999999e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.655814  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0058  hypothetical protein  33.62 
 
 
244 aa  137  2e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0354366 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0692  protein of unknown function DUF75  36.49 
 
 
249 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.343449 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0790  protein of unknown function DUF75  29.36 
 
 
242 aa  104  1e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0583  hypothetical protein  25.57 
 
 
241 aa  103  2e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1402  hypothetical protein  31.09 
 
 
267 aa  100  2e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0774  hypothetical protein  28.38 
 
 
253 aa  94.4  2e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.179453  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2034  protein of unknown function DUF75  27.97 
 
 
255 aa  93.2  3e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0667  protein of unknown function DUF75  27.85 
 
 
248 aa  85.5  7e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.440209  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2829  protein of unknown function DUF75  27.64 
 
 
245 aa  85.1  9e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.626247  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3816  protein of unknown function DUF75  30.2 
 
 
253 aa  85.1  0.000000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0659933  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1531  protein of unknown function DUF75  24.44 
 
 
246 aa  79.7  0.00000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.687731  normal  0.501878 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2882  protein of unknown function DUF75  26.21 
 
 
251 aa  76.6  0.0000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.728218 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1902  protein of unknown function DUF75  26.55 
 
 
248 aa  76.3  0.0000000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.180772  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1661  hypothetical protein  23.81 
 
 
253 aa  75.9  0.0000000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.32781  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0342  protein of unknown function DUF75  25.51 
 
 
245 aa  75.9  0.0000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1565  3-isopropylmalate dehydratase  25.2 
 
 
256 aa  74.3  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0357  hypothetical protein  24.24 
 
 
247 aa  74.3  0.000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1486  protein of unknown function DUF75  26.03 
 
 
246 aa  73.6  0.000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.243377  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2792  protein of unknown function DUF75  24.14 
 
 
250 aa  70.9  0.00000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.147305  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1250  protein of unknown function DUF75  30.6 
 
 
240 aa  68.2  0.0000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.549926  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1398  hypothetical protein  25.89 
 
 
261 aa  67.4  0.0000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.139952  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1007  protein of unknown function DUF75  25.82 
 
 
250 aa  66.6  0.0000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1058  hypothetical protein  23.5 
 
 
250 aa  64.3  0.000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0859  hypothetical protein  23.08 
 
 
250 aa  62.8  0.000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.776803  hitchhiker  0.00442614 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3654  protein of unknown function DUF75  26.41 
 
 
252 aa  62  0.000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0921  hypothetical protein  24.07 
 
 
251 aa  61.2  0.00000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1797  hypothetical protein  23.85 
 
 
250 aa  61.2  0.00000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1150  protein of unknown function DUF75  24.34 
 
 
251 aa  60.8  0.00000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.13291  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0226  hypothetical protein  26.52 
 
 
255 aa  60.8  0.00000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0414  hypothetical protein  25.53 
 
 
255 aa  60.1  0.00000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.270771  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0501  hypothetical protein  21.85 
 
 
276 aa  59.3  0.00000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.686369  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0525  hypothetical protein  22.27 
 
 
276 aa  59.3  0.00000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.902286  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_466  hypothetical protein  21.68 
 
 
276 aa  58.9  0.00000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.841701  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2273  hypothetical protein  26.48 
 
 
241 aa  57.4  0.0000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.222464  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0647  hypothetical protein  24.11 
 
 
237 aa  55.5  0.0000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.941733 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0800  hypothetical protein  25.63 
 
 
302 aa  55.5  0.0000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1950  hypothetical protein  27.35 
 
 
252 aa  53.9  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.622804 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2052  hypothetical protein  27.49 
 
 
248 aa  54.3  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0868  protein of unknown function DUF75  25.76 
 
 
258 aa  54.3  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4768  protein of unknown function DUF75  29.05 
 
 
181 aa  52  0.000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1297  hypothetical protein  26.32 
 
 
252 aa  51.6  0.00001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.607867 
 
 
-
 
NC_002936  DET0916  hypothetical protein  22.22 
 
 
302 aa  47  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.470991  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0034  hypothetical protein  24.87 
 
 
238 aa  47.4  0.0002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1126  hypothetical protein  22.97 
 
 
251 aa  46.2  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_787  hypothetical protein  23.12 
 
 
302 aa  46.2  0.0004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1998  hypothetical protein  24.24 
 
 
274 aa  44.7  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2223  hypothetical protein  22.01 
 
 
273 aa  44.3  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.37331  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0959  protein of unknown function DUF75  23.5 
 
 
256 aa  44.3  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.405373  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2504  protein of unknown function DUF75  25.11 
 
 
255 aa  43.9  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.496594  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0198  hypothetical protein  21.33 
 
 
257 aa  43.9  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0725  hypothetical protein  22.91 
 
 
226 aa  42.7  0.005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>