28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1998 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009073  Pcal_1998  hypothetical protein  100 
 
 
274 aa  550  1e-155  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2223  hypothetical protein  86.5 
 
 
273 aa  489  1e-137  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.37331  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0906  hypothetical protein  85.4 
 
 
274 aa  487  1e-137  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.992976  normal  0.453754 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0765  hypothetical protein  84.67 
 
 
276 aa  485  1e-136  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.174527  normal  0.0509855 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1550  hypothetical protein  55.73 
 
 
304 aa  314  9.999999999999999e-85  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.705196  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0583  hypothetical protein  25.11 
 
 
241 aa  83.2  0.000000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0720  hypothetical protein  25.44 
 
 
234 aa  68.6  0.0000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3654  protein of unknown function DUF75  25.64 
 
 
252 aa  68.2  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1086  3-isopropylmalate dehydratase  25.48 
 
 
248 aa  67  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0926  hypothetical protein  22.22 
 
 
248 aa  67  0.0000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1531  protein of unknown function DUF75  21.93 
 
 
246 aa  64.7  0.000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.687731  normal  0.501878 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0058  hypothetical protein  25.11 
 
 
244 aa  64.3  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0354366 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2010  hypothetical protein  23.26 
 
 
237 aa  63.5  0.000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0692  protein of unknown function DUF75  25.31 
 
 
249 aa  61.6  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.343449 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0647  hypothetical protein  23.35 
 
 
237 aa  58.5  0.0000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.941733 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1927  hypothetical protein  23.63 
 
 
242 aa  56.6  0.0000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.655814  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0790  protein of unknown function DUF75  24.69 
 
 
242 aa  55.5  0.0000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2034  protein of unknown function DUF75  26.51 
 
 
255 aa  55.1  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1402  hypothetical protein  24.43 
 
 
267 aa  53.1  0.000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2829  protein of unknown function DUF75  24.45 
 
 
245 aa  52.8  0.000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.626247  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1902  protein of unknown function DUF75  26.27 
 
 
248 aa  50.4  0.00003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.180772  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0721  hypothetical protein  24.24 
 
 
235 aa  48.9  0.00008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.538394  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0007  hypothetical protein  26.59 
 
 
236 aa  47.8  0.0002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.121063  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0774  hypothetical protein  22.54 
 
 
253 aa  48.1  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.179453  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1661  hypothetical protein  21.57 
 
 
253 aa  47  0.0004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.32781  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1741  hypothetical protein  24.24 
 
 
235 aa  44.7  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.300848  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1565  3-isopropylmalate dehydratase  24.28 
 
 
256 aa  44.3  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3816  protein of unknown function DUF75  22.92 
 
 
253 aa  43.9  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0659933  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>