65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1086 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1086  3-isopropylmalate dehydratase  100 
 
 		 248 aa  503  1e-141  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0926  hypothetical protein  72.58 
 
 		 248 aa  378  1e-104  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0720  hypothetical protein  53.91 
 
 		 234 aa  269  2.9999999999999997e-71  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0692  protein of unknown function DUF75  42.68 
 
 		 249 aa  223  2e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.343449 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0058  hypothetical protein  44.81 
 
 		 244 aa  212  3.9999999999999995e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0354366 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2010  hypothetical protein  41.67 
 
 		 237 aa  211  7e-54  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1927  hypothetical protein  39.18 
 
 		 242 aa  206  4e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.655814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1402  hypothetical protein  38.68 
 
 		 267 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0721  hypothetical protein  38.63 
 
 		 235 aa  160  2e-38  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.538394  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1741  hypothetical protein  37.77 
 
 		 235 aa  154  1e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.300848  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0161  hypothetical protein  38.63 
 
 		 235 aa  152  4e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.110174 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0007  hypothetical protein  35.19 
 
 		 236 aa  146  3e-34  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.121063  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0076  hypothetical protein  30.51 
 
 		 235 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.656256  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0583  hypothetical protein  31.78 
 
 		 241 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0342  protein of unknown function DUF75  29.74 
 
 		 245 aa  115  5e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0790  protein of unknown function DUF75  31.9 
 
 		 242 aa  112  5e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1486  protein of unknown function DUF75  29.34 
 
 		 246 aa  104  1e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.243377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0667  protein of unknown function DUF75  29.46 
 
 		 248 aa  103  2e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.440209  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2829  protein of unknown function DUF75  29.74 
 
 		 245 aa  103  3e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.626247  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2034  protein of unknown function DUF75  28.51 
 
 		 255 aa  99.8  3e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1126  hypothetical protein  30.6 
 
 		 251 aa  97.4  2e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2882  protein of unknown function DUF75  27.51 
 
 		 251 aa  94.7  1e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.728218 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2792  protein of unknown function DUF75  28.57 
 
 		 250 aa  93.6  3e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.147305  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3816  protein of unknown function DUF75  29.33 
 
 		 253 aa  90.5  2e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0659933  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1661  hypothetical protein  26.61 
 
 		 253 aa  89.7  4e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.32781  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1531  protein of unknown function DUF75  23.48 
 
 		 246 aa  89.4  5e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.687731  normal  0.501878 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1565  3-isopropylmalate dehydratase  28.18 
 
 		 256 aa  89  7e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1250  protein of unknown function DUF75  27.8 
 
 		 240 aa  88.6  8e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.549926  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1398  hypothetical protein  26.87 
 
 		 261 aa  85.5  7e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.139952  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1797  hypothetical protein  30.8 
 
 		 250 aa  84.3  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0774  hypothetical protein  27.27 
 
 		 253 aa  84.3  0.000000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.179453  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0414  hypothetical protein  30.93 
 
 		 255 aa  83.2  0.000000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.270771  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0859  hypothetical protein  31.7 
 
 		 250 aa  83.6  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.776803  hitchhiker  0.00442614 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1058  hypothetical protein  32 
 
 		 250 aa  83.2  0.000000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0921  hypothetical protein  31.54 
 
 		 251 aa  82.8  0.000000000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1950  hypothetical protein  28.77 
 
 		 252 aa  82.4  0.000000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.622804 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0357  hypothetical protein  28.57 
 
 		 247 aa  82.4  0.000000000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1007  protein of unknown function DUF75  27.43 
 
 		 250 aa  81.6  0.000000000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2273  hypothetical protein  26.61 
 
 		 241 aa  80.1  0.00000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.222464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0647  hypothetical protein  23.74 
 
 		 237 aa  80.1  0.00000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.941733 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3654  protein of unknown function DUF75  24.58 
 
 		 252 aa  79  0.00000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2052  hypothetical protein  27.7 
 
 		 248 aa  75.9  0.0000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0198  hypothetical protein  27.2 
 
 		 257 aa  73.6  0.000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0226  hypothetical protein  28.93 
 
 		 255 aa  72.8  0.000000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0959  protein of unknown function DUF75  27.27 
 
 		 256 aa  72.8  0.000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.405373  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1902  protein of unknown function DUF75  24.36 
 
 		 248 aa  70.1  0.00000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.180772  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2223  hypothetical protein  23.53 
 
 		 273 aa  67.8  0.0000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.37331  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0868  protein of unknown function DUF75  27.19 
 
 		 258 aa  67  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1998  hypothetical protein  25.48 
 
 		 274 aa  67  0.0000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1150  protein of unknown function DUF75  24.88 
 
 		 251 aa  66.2  0.0000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.13291  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0906  hypothetical protein  24.04 
 
 		 274 aa  61.6  0.00000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.992976  normal  0.453754 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1297  hypothetical protein  25 
 
 		 252 aa  60.1  0.00000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.607867 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0765  hypothetical protein  22.33 
 
 		 276 aa  59.7  0.00000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.174527  normal  0.0509855 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0501  hypothetical protein  24.37 
 
 		 276 aa  57.8  0.0000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.686369  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2504  protein of unknown function DUF75  27.23 
 
 		 255 aa  57.8  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.496594  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1550  hypothetical protein  25.84 
 
 		 304 aa  55.8  0.0000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.705196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_466  hypothetical protein  25.11 
 
 		 276 aa  55.8  0.0000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.841701  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0525  hypothetical protein  24.58 
 
 		 276 aa  53.5  0.000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.902286  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0800  hypothetical protein  22.18 
 
 		 302 aa  50.8  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0031  hypothetical protein  25.12 
 
 		 239 aa  49.3  0.00006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00817392 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2148  hypothetical protein  25.48 
 
 		 237 aa  47.8  0.0001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4768  protein of unknown function DUF75  31.79 
 
 		 181 aa  46.2  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0034  hypothetical protein  23.81 
 
 		 238 aa  45.8  0.0006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_787  hypothetical protein  22.13 
 
 		 302 aa  42.4  0.007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2630  hypothetical protein  24.47 
 
 		 282 aa  42.4  0.007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>