17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_1550 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_1550  hypothetical protein  100 
 
 
304 aa  610  9.999999999999999e-175  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.705196  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0906  hypothetical protein  56.87 
 
 
274 aa  314  9.999999999999999e-85  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.992976  normal  0.453754 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1998  hypothetical protein  55.73 
 
 
274 aa  314  9.999999999999999e-85  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0765  hypothetical protein  56.47 
 
 
276 aa  311  7.999999999999999e-84  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.174527  normal  0.0509855 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2223  hypothetical protein  55.91 
 
 
273 aa  308  6.999999999999999e-83  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.37331  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3654  protein of unknown function DUF75  22.41 
 
 
252 aa  62  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0583  hypothetical protein  21.89 
 
 
241 aa  58.2  0.0000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1531  protein of unknown function DUF75  22.34 
 
 
246 aa  57  0.0000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.687731  normal  0.501878 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1086  3-isopropylmalate dehydratase  25.84 
 
 
248 aa  55.8  0.0000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0926  hypothetical protein  22.66 
 
 
248 aa  52.4  0.000009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1902  protein of unknown function DUF75  27.97 
 
 
248 aa  52  0.00001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.180772  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0720  hypothetical protein  22.39 
 
 
234 aa  50.1  0.00004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1661  hypothetical protein  29.27 
 
 
253 aa  49.3  0.00007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.32781  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0647  hypothetical protein  21.4 
 
 
237 aa  47  0.0005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.941733 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0058  hypothetical protein  25 
 
 
244 aa  45.4  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0354366 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2010  hypothetical protein  23.87 
 
 
237 aa  45.1  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0692  protein of unknown function DUF75  20.93 
 
 
249 aa  42.7  0.008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.343449 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>