59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_2052 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_2052  hypothetical protein  100 
 
 
248 aa  493  9.999999999999999e-139  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1126  hypothetical protein  54.18 
 
 
251 aa  259  4e-68  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0959  protein of unknown function DUF75  58.04 
 
 
256 aa  258  9e-68  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.405373  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1950  hypothetical protein  55.83 
 
 
252 aa  250  1e-65  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.622804 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1398  hypothetical protein  47.89 
 
 
261 aa  235  4e-61  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.139952  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1565  3-isopropylmalate dehydratase  47.66 
 
 
256 aa  232  4.0000000000000004e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1297  hypothetical protein  45.24 
 
 
252 aa  222  4e-57  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.607867 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0414  hypothetical protein  51.95 
 
 
255 aa  222  4.9999999999999996e-57  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.270771  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2882  protein of unknown function DUF75  46.43 
 
 
251 aa  218  8.999999999999998e-56  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.728218 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1007  protein of unknown function DUF75  46.8 
 
 
250 aa  214  7e-55  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2792  protein of unknown function DUF75  46.22 
 
 
250 aa  213  2.9999999999999995e-54  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.147305  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0921  hypothetical protein  44.49 
 
 
251 aa  202  5e-51  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1797  hypothetical protein  40.87 
 
 
250 aa  198  5e-50  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1058  hypothetical protein  42.55 
 
 
250 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0859  hypothetical protein  41.27 
 
 
250 aa  195  5.000000000000001e-49  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.776803  hitchhiker  0.00442614 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0868  protein of unknown function DUF75  46.81 
 
 
258 aa  174  1.9999999999999998e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2504  protein of unknown function DUF75  45.53 
 
 
255 aa  170  2e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.496594  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1150  protein of unknown function DUF75  41.38 
 
 
251 aa  164  9e-40  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.13291  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0226  hypothetical protein  39.17 
 
 
255 aa  162  6e-39  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0720  hypothetical protein  28.93 
 
 
234 aa  104  2e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_466  hypothetical protein  31.17 
 
 
276 aa  98.2  1e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.841701  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0525  hypothetical protein  30.3 
 
 
276 aa  95.1  9e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.902286  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0501  hypothetical protein  30.3 
 
 
276 aa  95.1  1e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.686369  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0926  hypothetical protein  28.63 
 
 
248 aa  90.1  3e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1086  3-isopropylmalate dehydratase  26.75 
 
 
248 aa  80.5  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0800  hypothetical protein  25.31 
 
 
302 aa  78.2  0.0000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_787  hypothetical protein  25.61 
 
 
302 aa  75.9  0.0000000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0916  hypothetical protein  25.61 
 
 
302 aa  74.7  0.000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.470991  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0465  hypothetical protein  30.2 
 
 
245 aa  72.8  0.000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0485311  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0725  hypothetical protein  26.13 
 
 
226 aa  71.6  0.00000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0007  hypothetical protein  27.73 
 
 
236 aa  70.5  0.00000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.121063  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0198  hypothetical protein  28.89 
 
 
257 aa  70.5  0.00000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0721  hypothetical protein  27.49 
 
 
235 aa  68.9  0.00000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.538394  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0692  protein of unknown function DUF75  28.03 
 
 
249 aa  68.2  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.343449 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2010  hypothetical protein  27.43 
 
 
237 aa  68.2  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0058  hypothetical protein  30.26 
 
 
244 aa  66.6  0.0000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0354366 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1741  hypothetical protein  27.49 
 
 
235 aa  66.2  0.0000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.300848  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0161  hypothetical protein  26.54 
 
 
235 aa  63.5  0.000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.110174 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0790  protein of unknown function DUF75  25.11 
 
 
242 aa  60.1  0.00000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0076  hypothetical protein  24.26 
 
 
235 aa  59.3  0.00000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.656256  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3816  protein of unknown function DUF75  25.98 
 
 
253 aa  58.2  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0659933  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0583  hypothetical protein  24.06 
 
 
241 aa  57  0.0000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1927  hypothetical protein  24.05 
 
 
242 aa  56.2  0.0000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.655814  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2829  protein of unknown function DUF75  25.4 
 
 
245 aa  56.2  0.0000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.626247  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0342  protein of unknown function DUF75  25.31 
 
 
245 aa  53.5  0.000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0774  hypothetical protein  27.39 
 
 
253 aa  52  0.000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.179453  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0357  hypothetical protein  22.22 
 
 
247 aa  50.4  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1486  protein of unknown function DUF75  27.53 
 
 
246 aa  48.9  0.00007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.243377  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1902  protein of unknown function DUF75  24.89 
 
 
248 aa  48.9  0.00008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.180772  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0647  hypothetical protein  24.34 
 
 
237 aa  48.5  0.0001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.941733 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5826  protein of unknown function DUF75  24.6 
 
 
297 aa  46.6  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.22756  normal  0.126375 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1826  hypothetical protein  28.29 
 
 
281 aa  46.6  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0638514  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0888  protein of unknown function DUF75  26.94 
 
 
311 aa  45.1  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2034  protein of unknown function DUF75  23.35 
 
 
255 aa  43.1  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3951  hypothetical protein  27.48 
 
 
330 aa  43.1  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.731534 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1402  hypothetical protein  24.77 
 
 
267 aa  42.4  0.006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1661  hypothetical protein  22.08 
 
 
253 aa  42.7  0.006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.32781  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2446  hypothetical protein  25.75 
 
 
329 aa  42.4  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.211453 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0667  protein of unknown function DUF75  22.69 
 
 
248 aa  42.4  0.008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.440209  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>