50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0198 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_0198  hypothetical protein  100 
 
 
257 aa  512  1e-144  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0859  hypothetical protein  30.35 
 
 
250 aa  99.8  4e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.776803  hitchhiker  0.00442614 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1797  hypothetical protein  29.57 
 
 
250 aa  99  7e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1058  hypothetical protein  29.64 
 
 
250 aa  99  7e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0921  hypothetical protein  28.69 
 
 
251 aa  95.1  1e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1565  3-isopropylmalate dehydratase  31.12 
 
 
256 aa  88.2  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0926  hypothetical protein  29.34 
 
 
248 aa  88.2  1e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0226  hypothetical protein  31.78 
 
 
255 aa  84.7  0.000000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1398  hypothetical protein  26.92 
 
 
261 aa  83.2  0.000000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.139952  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2882  protein of unknown function DUF75  28.17 
 
 
251 aa  79.3  0.00000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.728218 
 
 
-
 
NC_002936  DET0525  hypothetical protein  28 
 
 
276 aa  76.3  0.0000000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.902286  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_466  hypothetical protein  28 
 
 
276 aa  74.7  0.000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.841701  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1007  protein of unknown function DUF75  27.64 
 
 
250 aa  74.7  0.000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0501  hypothetical protein  28 
 
 
276 aa  73.9  0.000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.686369  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1086  3-isopropylmalate dehydratase  27.2 
 
 
248 aa  73.6  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2792  protein of unknown function DUF75  27.16 
 
 
250 aa  72  0.000000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.147305  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0076  hypothetical protein  24.79 
 
 
235 aa  70.1  0.00000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.656256  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0790  protein of unknown function DUF75  28.11 
 
 
242 aa  69.7  0.00000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2034  protein of unknown function DUF75  29.41 
 
 
255 aa  66.6  0.0000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0720  hypothetical protein  23.89 
 
 
234 aa  65.1  0.000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0007  hypothetical protein  24.67 
 
 
236 aa  62.4  0.000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.121063  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1150  protein of unknown function DUF75  27.27 
 
 
251 aa  62  0.000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.13291  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0667  protein of unknown function DUF75  26.36 
 
 
248 aa  61.6  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.440209  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0465  hypothetical protein  26.09 
 
 
245 aa  61.6  0.00000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0485311  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1950  hypothetical protein  30.61 
 
 
252 aa  60.5  0.00000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.622804 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0414  hypothetical protein  27.35 
 
 
255 aa  57.4  0.0000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.270771  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1902  protein of unknown function DUF75  25 
 
 
248 aa  57  0.0000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.180772  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1927  hypothetical protein  24.28 
 
 
242 aa  57  0.0000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.655814  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0583  hypothetical protein  22.97 
 
 
241 aa  56.2  0.0000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2052  hypothetical protein  28.12 
 
 
248 aa  55.1  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2829  protein of unknown function DUF75  26.86 
 
 
245 aa  54.7  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.626247  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1486  protein of unknown function DUF75  26.83 
 
 
246 aa  54.7  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.243377  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0868  protein of unknown function DUF75  28.74 
 
 
258 aa  54.3  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1297  hypothetical protein  24.37 
 
 
252 aa  53.1  0.000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.607867 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0800  hypothetical protein  24.05 
 
 
302 aa  51.6  0.00001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1126  hypothetical protein  27.78 
 
 
251 aa  50.8  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0058  hypothetical protein  26.59 
 
 
244 aa  50.8  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0354366 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0692  protein of unknown function DUF75  22.4 
 
 
249 aa  50.4  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.343449 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0342  protein of unknown function DUF75  24.17 
 
 
245 aa  47.8  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2504  protein of unknown function DUF75  28.86 
 
 
255 aa  47.8  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.496594  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2010  hypothetical protein  25.42 
 
 
237 aa  47.8  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_787  hypothetical protein  22.61 
 
 
302 aa  47.4  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0647  hypothetical protein  23.32 
 
 
237 aa  46.6  0.0004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.941733 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0959  protein of unknown function DUF75  24.24 
 
 
256 aa  45.1  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.405373  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3654  protein of unknown function DUF75  22.27 
 
 
252 aa  45.1  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0721  hypothetical protein  23.25 
 
 
235 aa  43.9  0.003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.538394  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1741  hypothetical protein  21.33 
 
 
235 aa  43.9  0.003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.300848  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0916  hypothetical protein  22.56 
 
 
302 aa  43.9  0.003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.470991  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0161  hypothetical protein  21.78 
 
 
235 aa  43.1  0.005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.110174 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1661  hypothetical protein  19.72 
 
 
253 aa  42.7  0.005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.32781  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>