29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0654 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_0654  SSU ribosomal protein S27AE  100 
 
 		 60 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.663989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1193  30S ribosomal protein S27ae  55 
 
 		 67 aa  70.1  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0564  Ribosomal protein S27a  59.18 
 
 		 50 aa  65.5  0.0000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2867  ribosomal protein S27a  62.5 
 
 		 62 aa  65.1  0.0000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.260163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0241  ribosomal protein S27a  58 
 
 		 61 aa  65.1  0.0000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.834895 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0599  Ribosomal protein S27a  61.22 
 
 		 51 aa  64.7  0.0000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.470612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1429  30S ribosomal protein S27ae  49.02 
 
 		 71 aa  60.1  0.000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2246  ribosomal protein S27a  57.14 
 
 		 51 aa  58.5  0.00000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1441  30S ribosomal protein S27ae  53.19 
 
 		 67 aa  57.8  0.00000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.168869 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1325  ribosomal protein S27a  75.86 
 
 		 49 aa  56.6  0.0000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0467  30S ribosomal protein S27ae  51.67 
 
 		 67 aa  56.2  0.0000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0284  ribosomal protein S27a  51.02 
 
 		 57 aa  55.8  0.0000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.473204  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2284  30S ribosomal protein S27ae  72.41 
 
 		 49 aa  55.5  0.0000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000131146  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0534  30S ribosomal protein S27a  48.33 
 
 		 57 aa  55.5  0.0000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0281  30S ribosomal protein S27ae  56.1 
 
 		 49 aa  54.3  0.0000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND03060  ribosomal chaperone, putative  54.76 
 
 		 159 aa  48.9  0.00003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.473812  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1272  Ribosomal protein S27a  53.19 
 
 		 44 aa  46.6  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.122795  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1172  Ribosomal protein S27a  48.94 
 
 		 44 aa  45.8  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.70249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_73842  Ubiquitin/40S ribosomal protein S27a fusion  52.38 
 
 		 151 aa  45.1  0.0003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3054  Ribosomal protein S27a  48.94 
 
 		 44 aa  45.4  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1409  Ribosomal protein S27a  42.62 
 
 		 63 aa  44.3  0.0005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1955  30S ribosomal protein S27ae  46.81 
 
 		 44 aa  44.7  0.0005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_27118  ubiquitin extension protein 3  39.62 
 
 		 155 aa  42.7  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2223  SSU ribosomal protein S27AE  41.67 
 
 		 61 aa  42.7  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000310911 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04872  Putative uncharacterized proteinUBI1 ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UV58]  47.62 
 
 		 154 aa  42  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.171083 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32483  Ribosomal protein S27a, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  48.78 
 
 		 150 aa  41.2  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.079306  decreased coverage  0.00789821 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0594  ribosomal protein S27a  41.27 
 
 		 72 aa  41.2  0.005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1198  30S ribosomal protein S27ae  36.36 
 
 		 63 aa  40.8  0.007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.591289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0449  ribosomal protein S27a  42.31 
 
 		 53 aa  40.4  0.008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>