22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_1441 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009637  MmarC7_1441  30S ribosomal protein S27ae  100 
 
 		 67 aa  135  3.0000000000000003e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.168869 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1193  30S ribosomal protein S27ae  92.54 
 
 		 67 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0467  30S ribosomal protein S27ae  91.04 
 
 		 67 aa  107  4.0000000000000004e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1429  30S ribosomal protein S27ae  84.48 
 
 		 71 aa  106  9.000000000000001e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0284  ribosomal protein S27a  74 
 
 		 57 aa  83.2  0.000000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.473204  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0281  30S ribosomal protein S27ae  62.22 
 
 		 49 aa  72  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2284  30S ribosomal protein S27ae  60 
 
 		 49 aa  69.7  0.00000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000131146  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0654  SSU ribosomal protein S27AE  55 
 
 		 60 aa  69.7  0.00000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.663989  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0599  Ribosomal protein S27a  62.5 
 
 		 51 aa  67  0.00000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.470612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0241  ribosomal protein S27a  59.57 
 
 		 61 aa  65.5  0.0000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.834895 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0564  Ribosomal protein S27a  53.19 
 
 		 50 aa  61.2  0.000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2867  ribosomal protein S27a  55.32 
 
 		 62 aa  60.8  0.000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.260163  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0534  30S ribosomal protein S27a  47.46 
 
 		 57 aa  60.8  0.000000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1325  ribosomal protein S27a  52.27 
 
 		 49 aa  59.3  0.00000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2246  ribosomal protein S27a  48.98 
 
 		 51 aa  57  0.00000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND03060  ribosomal chaperone, putative  56.1 
 
 		 159 aa  50.4  0.000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.473812  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04872  Putative uncharacterized proteinUBI1 ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UV58]  51.02 
 
 		 154 aa  50.4  0.000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.171083 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1409  Ribosomal protein S27a  51.11 
 
 		 63 aa  48.5  0.00003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_27118  ubiquitin extension protein 3  51.28 
 
 		 155 aa  47.8  0.00005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_73842  Ubiquitin/40S ribosomal protein S27a fusion  52.08 
 
 		 151 aa  46.6  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32483  Ribosomal protein S27a, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  55 
 
 		 150 aa  44.7  0.0004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.079306  decreased coverage  0.00789821 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1172  Ribosomal protein S27a  45.65 
 
 		 44 aa  42.4  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.70249  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>