24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0281 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0281  30S ribosomal protein S27ae  100 
 
 		 49 aa  104  4e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2284  30S ribosomal protein S27ae  79.59 
 
 		 49 aa  89.7  1e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000131146  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0241  ribosomal protein S27a  68.18 
 
 		 61 aa  73.6  0.0000000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.834895 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0467  30S ribosomal protein S27ae  62.22 
 
 		 67 aa  72  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1441  30S ribosomal protein S27ae  62.22 
 
 		 67 aa  71.6  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.168869 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1193  30S ribosomal protein S27ae  62.22 
 
 		 67 aa  71.2  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1429  30S ribosomal protein S27ae  64.44 
 
 		 71 aa  70.5  0.000000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1325  ribosomal protein S27a  57.14 
 
 		 49 aa  69.7  0.00000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0284  ribosomal protein S27a  64.44 
 
 		 57 aa  68.9  0.00000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.473204  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2867  ribosomal protein S27a  61.36 
 
 		 62 aa  67.8  0.00000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.260163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0564  Ribosomal protein S27a  51.02 
 
 		 50 aa  66.6  0.0000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0534  30S ribosomal protein S27a  63.64 
 
 		 57 aa  66.6  0.0000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2246  ribosomal protein S27a  58.82 
 
 		 51 aa  66.2  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0599  Ribosomal protein S27a  61.36 
 
 		 51 aa  65.9  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.470612  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0654  SSU ribosomal protein S27AE  56.1 
 
 		 60 aa  54.3  0.0000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.663989  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND03060  ribosomal chaperone, putative  50 
 
 		 159 aa  48.1  0.00004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.473812  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1272  Ribosomal protein S27a  54.76 
 
 		 44 aa  47.4  0.00006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.122795  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1172  Ribosomal protein S27a  52.08 
 
 		 44 aa  46.2  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.70249  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1409  Ribosomal protein S27a  45.83 
 
 		 63 aa  45.8  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3054  Ribosomal protein S27a  47.62 
 
 		 44 aa  45.4  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04872  Putative uncharacterized proteinUBI1 ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UV58]  47.92 
 
 		 154 aa  44.7  0.0005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.171083 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_73842  Ubiquitin/40S ribosomal protein S27a fusion  47.92 
 
 		 151 aa  42.4  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1955  30S ribosomal protein S27ae  42.86 
 
 		 44 aa  42.7  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_27118  ubiquitin extension protein 3  46.34 
 
 		 155 aa  41.6  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>