15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_1272 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_1272  Ribosomal protein S27a  100 
 
 
44 aa  93.6  8e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.122795  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3054  Ribosomal protein S27a  81.82 
 
 
44 aa  80.1  0.000000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1172  Ribosomal protein S27a  77.27 
 
 
44 aa  76.3  0.0000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.70249  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1955  30S ribosomal protein S27ae  75 
 
 
44 aa  75.5  0.0000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0241  ribosomal protein S27a  54.55 
 
 
61 aa  49.7  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.834895 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2246  ribosomal protein S27a  52.38 
 
 
51 aa  48.9  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1325  ribosomal protein S27a  52.38 
 
 
49 aa  48.5  0.00003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0281  30S ribosomal protein S27ae  54.76 
 
 
49 aa  47.4  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2284  30S ribosomal protein S27ae  54.76 
 
 
49 aa  46.2  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000131146  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0654  SSU ribosomal protein S27AE  53.19 
 
 
60 aa  46.6  0.0001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.663989  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2867  ribosomal protein S27a  45.45 
 
 
62 aa  45.4  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.260163  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0284  ribosomal protein S27a  50 
 
 
57 aa  45.1  0.0004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.473204  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0599  Ribosomal protein S27a  47.73 
 
 
51 aa  43.9  0.0007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.470612  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1429  30S ribosomal protein S27ae  42.86 
 
 
71 aa  42  0.003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0564  Ribosomal protein S27a  50 
 
 
50 aa  41.6  0.003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>