17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_1172 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_1172  Ribosomal protein S27a  100 
 
 		 44 aa  94.7  4e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.70249  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3054  Ribosomal protein S27a  79.55 
 
 		 44 aa  79  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1272  Ribosomal protein S27a  77.27 
 
 		 44 aa  76.3  0.0000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.122795  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1955  30S ribosomal protein S27ae  72.73 
 
 		 44 aa  74.3  0.0000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1325  ribosomal protein S27a  52.08 
 
 		 49 aa  52.8  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2284  30S ribosomal protein S27ae  56.25 
 
 		 49 aa  49.7  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000131146  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0564  Ribosomal protein S27a  53.33 
 
 		 50 aa  47.8  0.00006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0284  ribosomal protein S27a  50 
 
 		 57 aa  47  0.00009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.473204  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0281  30S ribosomal protein S27ae  52.08 
 
 		 49 aa  46.2  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2867  ribosomal protein S27a  47.83 
 
 		 62 aa  45.4  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.260163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2246  ribosomal protein S27a  45.83 
 
 		 51 aa  46.2  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0654  SSU ribosomal protein S27AE  48.94 
 
 		 60 aa  45.8  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.663989  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0599  Ribosomal protein S27a  46.67 
 
 		 51 aa  44.7  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.470612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1193  30S ribosomal protein S27ae  45.65 
 
 		 67 aa  42  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0241  ribosomal protein S27a  40.43 
 
 		 61 aa  41.6  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.834895 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0467  30S ribosomal protein S27ae  47.73 
 
 		 67 aa  40.8  0.006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1441  30S ribosomal protein S27ae  47.73 
 
 		 67 aa  40.8  0.006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.168869 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>