21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2867 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_2867  ribosomal protein S27a  100 
 
 
62 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.260163  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0599  Ribosomal protein S27a  72 
 
 
51 aa  79.3  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.470612  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0241  ribosomal protein S27a  72.34 
 
 
61 aa  78.6  0.00000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.834895 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2246  ribosomal protein S27a  68 
 
 
51 aa  76.6  0.0000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0654  SSU ribosomal protein S27AE  62.07 
 
 
60 aa  72  0.000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.663989  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0281  30S ribosomal protein S27ae  61.36 
 
 
49 aa  69.3  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2284  30S ribosomal protein S27ae  63.64 
 
 
49 aa  68.9  0.00000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000131146  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1193  30S ribosomal protein S27ae  54.39 
 
 
67 aa  68.2  0.00000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0564  Ribosomal protein S27a  66.67 
 
 
50 aa  66.6  0.0000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1429  30S ribosomal protein S27ae  52 
 
 
71 aa  63.5  0.000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1325  ribosomal protein S27a  54.55 
 
 
49 aa  61.6  0.000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0534  30S ribosomal protein S27a  60 
 
 
57 aa  61.6  0.000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0284  ribosomal protein S27a  50 
 
 
57 aa  60.8  0.000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.473204  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0467  30S ribosomal protein S27ae  56.82 
 
 
67 aa  60.5  0.000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1441  30S ribosomal protein S27ae  56.52 
 
 
67 aa  60.1  0.000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.168869 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1172  Ribosomal protein S27a  45.83 
 
 
44 aa  46.6  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.70249  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1272  Ribosomal protein S27a  45.45 
 
 
44 aa  46.2  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.122795  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND03060  ribosomal chaperone, putative  51.16 
 
 
159 aa  43.9  0.0007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.473812  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1409  Ribosomal protein S27a  41.38 
 
 
63 aa  43.5  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1955  30S ribosomal protein S27ae  38.64 
 
 
44 aa  42.4  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3054  Ribosomal protein S27a  48.65 
 
 
44 aa  42.7  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>