23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0241 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_0241  ribosomal protein S27a  100 
 
 		 61 aa  123  1e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.834895 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0599  Ribosomal protein S27a  78.72 
 
 		 51 aa  83.2  0.000000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.470612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2867  ribosomal protein S27a  72.34 
 
 		 62 aa  79  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.260163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0281  30S ribosomal protein S27ae  68.18 
 
 		 49 aa  75.1  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2246  ribosomal protein S27a  65.96 
 
 		 51 aa  73.2  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0284  ribosomal protein S27a  64.71 
 
 		 57 aa  72.4  0.000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.473204  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1193  30S ribosomal protein S27ae  56.9 
 
 		 67 aa  71.2  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0654  SSU ribosomal protein S27AE  57.63 
 
 		 60 aa  71.2  0.000000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.663989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2284  30S ribosomal protein S27ae  61.36 
 
 		 49 aa  69.3  0.00000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000131146  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0534  30S ribosomal protein S27a  61.22 
 
 		 57 aa  67.8  0.00000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1429  30S ribosomal protein S27ae  61.7 
 
 		 71 aa  68.2  0.00000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1441  30S ribosomal protein S27ae  60.87 
 
 		 67 aa  65.1  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.168869 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0564  Ribosomal protein S27a  50 
 
 		 50 aa  64.7  0.0000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0467  30S ribosomal protein S27ae  61.36 
 
 		 67 aa  64.7  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1325  ribosomal protein S27a  52.27 
 
 		 49 aa  62.4  0.000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1272  Ribosomal protein S27a  54.55 
 
 		 44 aa  50.8  0.000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.122795  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1409  Ribosomal protein S27a  53.33 
 
 		 63 aa  50.4  0.000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3054  Ribosomal protein S27a  54.05 
 
 		 44 aa  45.8  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND03060  ribosomal chaperone, putative  51.16 
 
 		 159 aa  44.3  0.0005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.473812  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1955  30S ribosomal protein S27ae  43.18 
 
 		 44 aa  43.9  0.0007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2223  SSU ribosomal protein S27AE  36.84 
 
 		 61 aa  42.7  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000310911 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1172  Ribosomal protein S27a  40.43 
 
 		 44 aa  42.7  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.70249  normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_27118  ubiquitin extension protein 3  51.22 
 
 		 155 aa  42  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>