11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0449 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_0449  ribosomal protein S27a  100 
 
 		 53 aa  112  1.0000000000000001e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1409  Ribosomal protein S27a  73.81 
 
 		 63 aa  72.4  0.000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2223  SSU ribosomal protein S27AE  69.05 
 
 		 61 aa  72.8  0.000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000310911 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1439  30S ribosomal protein S27ae  54.9 
 
 		 65 aa  71.2  0.000000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.143356  normal  0.0246372 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1198  30S ribosomal protein S27ae  51.92 
 
 		 63 aa  71.6  0.000000000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.591289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1894  30S ribosomal protein S27ae  51.92 
 
 		 67 aa  71.2  0.000000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0307  30S ribosomal protein S27ae  51.92 
 
 		 65 aa  70.5  0.000000000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0594  ribosomal protein S27a  51.92 
 
 		 72 aa  67.8  0.00000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3054  Ribosomal protein S27a  50 
 
 		 44 aa  41.6  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0564  Ribosomal protein S27a  46.67 
 
 		 50 aa  40.8  0.007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0654  SSU ribosomal protein S27AE  42.31 
 
 		 60 aa  40.4  0.008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.663989  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>