10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0594 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0594  ribosomal protein S27a  100 
 
 		 72 aa  154  5.0000000000000005e-37  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0307  30S ribosomal protein S27ae  78 
 
 		 65 aa  95.1  3e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1439  30S ribosomal protein S27ae  77.55 
 
 		 65 aa  92.4  2e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.143356  normal  0.0246372 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1198  30S ribosomal protein S27ae  74 
 
 		 63 aa  92.4  2e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.591289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1894  30S ribosomal protein S27ae  70 
 
 		 67 aa  90.9  5e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0449  ribosomal protein S27a  51.92 
 
 		 53 aa  67.8  0.00000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1409  Ribosomal protein S27a  46.55 
 
 		 63 aa  60.1  0.000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2223  SSU ribosomal protein S27AE  45.45 
 
 		 61 aa  55.1  0.0000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000310911 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0654  SSU ribosomal protein S27AE  41.27 
 
 		 60 aa  41.2  0.005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.663989  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0599  Ribosomal protein S27a  60 
 
 		 51 aa  41.2  0.005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.470612  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>