31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_5298 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009077  Mjls_5298  hypothetical protein  100 
 
 		 59 aa  125  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.148687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4916  ATP-dependent DNA ligase  100 
 
 		 353 aa  85.5  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0422666  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5005  ATP-dependent DNA ligase  100 
 
 		 353 aa  85.5  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.142668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5543  ATP-dependent DNA ligase  64.91 
 
 		 359 aa  75.9  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1273  ATP-dependent DNA ligase  82.05 
 
 		 351 aa  71.6  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.22692 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5866  ATP-dependent DNA ligase  66.67 
 
 		 369 aa  55.5  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.884257  normal  0.301201 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1947  ATP dependent DNA ligase  69.44 
 
 		 359 aa  55.1  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.314114  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2256  ATP dependent DNA ligase  63.89 
 
 		 352 aa  52.4  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.209492 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1489  ATP-dependent DNA ligase  63.89 
 
 		 369 aa  51.6  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000199621 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4083  ATP-dependent DNA ligase  59.52 
 
 		 363 aa  51.2  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6710  ATP-dependent DNA ligase  61.11 
 
 		 346 aa  50.4  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00369161  normal  0.292979 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1546  ATP-dependent DNA ligase  61.11 
 
 		 369 aa  50.1  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.290467 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0653  ATP-dependent DNA ligase  57.14 
 
 		 353 aa  50.1  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.192766 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0826  ATP-dependent DNA ligase  66.67 
 
 		 354 aa  49.7  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13763  ATP-dependent DNA ligase  61.11 
 
 		 358 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.872341 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1254  ATP-dependent DNA ligase  58.97 
 
 		 366 aa  47.4  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.351593  hitchhiker  0.000397091 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5292  ATP-dependent DNA ligase  61.11 
 
 		 374 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0907  ATP-dependent DNA ligase  57.89 
 
 		 366 aa  46.6  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5320  ATP-dependent DNA ligase  61.11 
 
 		 353 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0415  ATP dependent DNA ligase  60 
 
 		 346 aa  45.8  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6355  ATP dependent DNA ligase  58.33 
 
 		 361 aa  45.4  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.915888  normal  0.696639 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5549  ATP-dependent DNA ligase  58.33 
 
 		 360 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.480302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5169  ATP-dependent DNA ligase  41.82 
 
 		 408 aa  44.7  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00454515  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5027  ATP-dependent DNA ligase  58.33 
 
 		 353 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.792567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4939  ATP-dependent DNA ligase  58.33 
 
 		 353 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4038  ATP-dependent DNA ligase  55.56 
 
 		 365 aa  44.3  0.0006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3429  ATP-dependent DNA ligase  48.72 
 
 		 374 aa  43.9  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4039  ATP dependent DNA ligase  59.38 
 
 		 342 aa  43.1  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0480  ATP-dependent DNA ligase  51.28 
 
 		 371 aa  42.7  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1376  ATP-dependent DNA ligase  55.56 
 
 		 360 aa  42  0.003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.165882  normal  0.400562 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1579  ATP-dependent DNA ligase  41.07 
 
 		 358 aa  41.6  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>