74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_0453 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007947  Mfla_0453  sarcosine oxidase, delta subunit, heterotetrameric  100 
 
 		 86 aa  184  4e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000175781  normal  0.381064 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2495  sarcosine oxidase subunit D  58.75 
 
 		 88 aa  110  7.000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.403118  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5915  sarcosine oxidase delta subunit heterotetrameric  60 
 
 		 85 aa  110  9e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.892055 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3473  sarcosine oxidase, delta subunit, heterotetrameric  55.7 
 
 		 100 aa  102  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2103  sarcosine oxidase delta subunit heterotetrameric  56.96 
 
 		 101 aa  100  9e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.658737 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2223  sarcosine oxidase, delta subunit  54.43 
 
 		 101 aa  99  2e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.075744  normal  0.251526 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2451  sarcosine oxidase, delta subunit  53.16 
 
 		 101 aa  97.4  6e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0164476  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1695  Sarcosine oxidase delta subunit heterotetrameric  57.69 
 
 		 91 aa  97.1  8e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1350  sarcosine oxidase subunit D  48 
 
 		 89 aa  87.4  6e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000302507  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0993  sarcosine oxidase, delta subunit, heterotetrameric  43.75 
 
 		 84 aa  59.3  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.706743  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0868  sarcosine oxidase delta subunit family protein  41.86 
 
 		 97 aa  59.3  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1102  sarcosine oxidase subunit delta  42.31 
 
 		 98 aa  57  0.00000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.123321 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3992  sarcosine oxidase, delta subunit family  35.56 
 
 		 114 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.27842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3392  sarcosine oxidase, delta subunit family  36.78 
 
 		 98 aa  54.7  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0969492  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3288  sarcosine oxidase delta subunit family protein  39.19 
 
 		 92 aa  53.9  0.0000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.803176 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0997  sarcosine oxidase delta subunit (sarcosine oxidasesubunit D)  42.67 
 
 		 97 aa  53.5  0.0000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.97807  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3446  sarcosine oxidase, delta subunit, heterotetrameric  32.93 
 
 		 87 aa  53.9  0.0000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.972613  normal  0.507258 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3737  sarcosine oxidase delta subunit family protein  34.44 
 
 		 98 aa  53.5  0.0000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.573954  normal  0.413879 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0487  sarcosine oxidase, delta subunit, heterotetrameric  39.74 
 
 		 99 aa  52  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4032  sarcosine oxidase, delta subunit family  33.33 
 
 		 98 aa  52  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.110857 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2146  sarcosine oxidase, delta subunit, heterotetrameric  35.06 
 
 		 92 aa  52.4  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2882  sarcosine oxidase, delta subunit family  41.46 
 
 		 104 aa  52  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.245307  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0394  sarcosine oxidase, delta chain  41.33 
 
 		 97 aa  52  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0230  sarcosine oxidase, delta subunit  36.78 
 
 		 101 aa  51.2  0.000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0223  sarcosine oxidase, delta subunit  36.78 
 
 		 101 aa  51.2  0.000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.835097  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71490  sarcosine oxidase delta subunit  36.36 
 
 		 106 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.752855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2116  putative sarcosine oxidase  35.63 
 
 		 99 aa  50.8  0.000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3505  sarcosine oxidase delta subunit heterotetrameric  38.1 
 
 		 99 aa  50.4  0.000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1953  sarcosine oxidase delta subunit  41.1 
 
 		 96 aa  50.4  0.000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1861  sarcosine oxidase, delta subunit  41.1 
 
 		 96 aa  50.4  0.000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.762279  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0302  sarcosine oxidase delta subunit family protein  36.78 
 
 		 101 aa  50.4  0.000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.499086  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5068  sarcosine oxidase delta subunit heterotetrameric  37.18 
 
 		 103 aa  50.1  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.344963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4545  sarcosine oxidase, delta subunit, heterotetrameric  37.18 
 
 		 103 aa  50.1  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3217  sarcosine oxidase, delta subunit, heterotetrameric  37.18 
 
 		 99 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00204366  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5634  sarcosine oxidase, delta subunit family  39.47 
 
 		 93 aa  49.3  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5129  sarcosine oxidase delta subunit heterotetrameric  37.18 
 
 		 99 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.485543  normal  0.549971 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4829  sarcosine oxidase, delta subunit, heterotetrameric  40 
 
 		 98 aa  49.3  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.320704  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7232  Sarcosine oxidase delta subunit heterotetrameric  39.47 
 
 		 93 aa  49.3  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.393713  normal  0.0417746 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1599  SoxD  38.46 
 
 		 120 aa  49.3  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.245125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5150  sarcosine oxidase, delta subunit, heterotetrameric  37.18 
 
 		 99 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3703  sarcosine oxidase delta subunit family protein  33.72 
 
 		 145 aa  49.7  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3857  sarcosine oxidase delta subunit family protein  37.65 
 
 		 92 aa  48.5  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.024092  normal  0.0281213 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6205  sarcosine oxidase delta subunit  35.23 
 
 		 106 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.258516  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8585  sarcosine oxidase, delta subunit family  36.78 
 
 		 100 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.446767  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3332  sarcosine oxidase delta subunit heterotetrameric  36 
 
 		 99 aa  48.1  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.460524  normal  0.508488 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2365  sarcosine oxidase delta subunit heterotetrameric  34.94 
 
 		 97 aa  48.1  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1142  sarcosine oxidase, delta subunit, heterotetrameric  34.88 
 
 		 91 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.432537 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5049  Sarcosine oxidase delta subunit heterotetrameric  34.62 
 
 		 112 aa  47.8  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.43634  normal  0.356963 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0459  sarcosine oxidase, delta subunit  36.26 
 
 		 98 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5745  sarcosine oxidase delta subunit  32.91 
 
 		 90 aa  47  0.00009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.576459  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2637  Sarcosine oxidase delta subunit heterotetrameric  31.11 
 
 		 95 aa  46.2  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0047  sarcosine oxidase subunit delta  37.33 
 
 		 107 aa  46.2  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.495698 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4714  sarcosine oxidase, delta subunit, heterotetrameric  34.44 
 
 		 98 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5206  sarcosine oxidase, delta subunit, heterotetrameric  34.44 
 
 		 109 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0212721 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1948  sarcosine oxidase, delta subunit  34.18 
 
 		 87 aa  45.4  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.593467 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0592  sarcosine oxidase delta subunit family protein  34.88 
 
 		 100 aa  45.1  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1935  Sarcosine oxidase delta subunit heterotetrameric  35.14 
 
 		 95 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2486  sarcosine oxidase delta subunit family protein  37.65 
 
 		 98 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2185  sarcosine oxidase, delta subunit, heterotetrameric  39.51 
 
 		 107 aa  44.7  0.0004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18820  sarcosine oxidase, delta subunit family, heterotetrameric form  37.21 
 
 		 101 aa  44.7  0.0005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4130  sarcosine oxidase delta subunit family protein  31.03 
 
 		 108 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.324326  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0999  sarcosine oxidase delta subunit family protein  37.04 
 
 		 130 aa  43.1  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0324  sarcosine oxidase, delta subunit family  32.22 
 
 		 111 aa  42  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.434954  normal  0.014081 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1578  Sarcosine oxidase delta subunit heterotetrameric  33.78 
 
 		 95 aa  42  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.940084  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4883  sarcosine oxidase delta subunit family protein  32.22 
 
 		 111 aa  42  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.437416 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0347  sarcosine oxidase delta subunit family protein  32.22 
 
 		 111 aa  42  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.418659  normal  0.928034 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2265  putative sarcosine oxidase  32.93 
 
 		 87 aa  41.6  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.437713 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0346  sarcosine oxidase delta subunit family protein  32.22 
 
 		 111 aa  42  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.670889  normal  0.611429 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4033  sarcosine oxidase, delta subunit  39.62 
 
 		 99 aa  41.6  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2479  sarcosine oxidase, delta subunit  39.62 
 
 		 99 aa  41.6  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3659  sarcosine oxidase, delta subunit family  34.48 
 
 		 113 aa  41.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.189042  normal  0.165705 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1653  sarcosine oxidase delta subunit heterotetrameric  33.78 
 
 		 95 aa  41.2  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.141648  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3357  sarcosine oxidase, delta subunit family  34.48 
 
 		 113 aa  40.8  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.346352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2751  sarcosine oxidase delta subunit family protein  33.33 
 
 		 113 aa  40.4  0.008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>