47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1350 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_1350  sarcosine oxidase subunit D  100 
 
 		 89 aa  191  3e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000302507  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1695  Sarcosine oxidase delta subunit heterotetrameric  53.42 
 
 		 91 aa  89.7  1e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0453  sarcosine oxidase, delta subunit, heterotetrameric  48 
 
 		 86 aa  87.4  6e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000175781  normal  0.381064 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2495  sarcosine oxidase subunit D  44 
 
 		 88 aa  84.3  5e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.403118  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5915  sarcosine oxidase delta subunit heterotetrameric  37.33 
 
 		 85 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.892055 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3473  sarcosine oxidase, delta subunit, heterotetrameric  40 
 
 		 100 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2451  sarcosine oxidase, delta subunit  41.33 
 
 		 101 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0164476  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2223  sarcosine oxidase, delta subunit  40 
 
 		 101 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.075744  normal  0.251526 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2103  sarcosine oxidase delta subunit heterotetrameric  37.33 
 
 		 101 aa  67.8  0.00000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.658737 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3505  sarcosine oxidase delta subunit heterotetrameric  34.04 
 
 		 99 aa  51.2  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3992  sarcosine oxidase, delta subunit family  39.47 
 
 		 114 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.27842  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1102  sarcosine oxidase subunit delta  34.67 
 
 		 98 aa  50.8  0.000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.123321 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1599  SoxD  37.33 
 
 		 120 aa  50.8  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.245125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3332  sarcosine oxidase delta subunit heterotetrameric  36 
 
 		 99 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.460524  normal  0.508488 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3737  sarcosine oxidase delta subunit family protein  40.79 
 
 		 98 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.573954  normal  0.413879 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5150  sarcosine oxidase, delta subunit, heterotetrameric  34.67 
 
 		 99 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3217  sarcosine oxidase, delta subunit, heterotetrameric  34.67 
 
 		 99 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00204366  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0997  sarcosine oxidase delta subunit (sarcosine oxidasesubunit D)  37.33 
 
 		 97 aa  50.1  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.97807  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0487  sarcosine oxidase, delta subunit, heterotetrameric  36 
 
 		 99 aa  50.1  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0394  sarcosine oxidase, delta chain  37.33 
 
 		 97 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5129  sarcosine oxidase delta subunit heterotetrameric  34.67 
 
 		 99 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.485543  normal  0.549971 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3703  sarcosine oxidase delta subunit family protein  39.29 
 
 		 145 aa  48.9  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4032  sarcosine oxidase, delta subunit family  40.79 
 
 		 98 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.110857 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3392  sarcosine oxidase, delta subunit family  38.16 
 
 		 98 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0969492  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1861  sarcosine oxidase, delta subunit  36.99 
 
 		 96 aa  48.9  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.762279  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1953  sarcosine oxidase delta subunit  36.99 
 
 		 96 aa  48.9  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5049  Sarcosine oxidase delta subunit heterotetrameric  34.67 
 
 		 112 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.43634  normal  0.356963 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4545  sarcosine oxidase, delta subunit, heterotetrameric  33.33 
 
 		 103 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5068  sarcosine oxidase delta subunit heterotetrameric  33.33 
 
 		 103 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.344963  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0047  sarcosine oxidase subunit delta  34.67 
 
 		 107 aa  48.5  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.495698 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4829  sarcosine oxidase, delta subunit, heterotetrameric  36 
 
 		 98 aa  48.1  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.320704  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3594  sarcosine oxidase, delta subunit family  36.9 
 
 		 136 aa  46.6  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3857  sarcosine oxidase delta subunit family protein  35.8 
 
 		 92 aa  45.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.024092  normal  0.0281213 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1948  sarcosine oxidase, delta subunit  30.59 
 
 		 87 aa  45.1  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.593467 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3446  sarcosine oxidase, delta subunit, heterotetrameric  36.62 
 
 		 87 aa  44.7  0.0005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.972613  normal  0.507258 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1935  Sarcosine oxidase delta subunit heterotetrameric  31.25 
 
 		 95 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3288  sarcosine oxidase delta subunit family protein  27.59 
 
 		 92 aa  43.9  0.0007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.803176 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1653  sarcosine oxidase delta subunit heterotetrameric  31.25 
 
 		 95 aa  43.5  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.141648  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1578  Sarcosine oxidase delta subunit heterotetrameric  31.25 
 
 		 95 aa  42.4  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.940084  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0868  sarcosine oxidase delta subunit family protein  30.26 
 
 		 97 aa  42.4  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5634  sarcosine oxidase, delta subunit family  31.33 
 
 		 93 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2146  sarcosine oxidase, delta subunit, heterotetrameric  34.29 
 
 		 92 aa  42.4  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0993  sarcosine oxidase, delta subunit, heterotetrameric  31.65 
 
 		 84 aa  42  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.706743  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7232  Sarcosine oxidase delta subunit heterotetrameric  29.41 
 
 		 93 aa  41.6  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.393713  normal  0.0417746 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18820  sarcosine oxidase, delta subunit family, heterotetrameric form  38.67 
 
 		 101 aa  41.6  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2637  Sarcosine oxidase delta subunit heterotetrameric  31.33 
 
 		 95 aa  41.2  0.005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2486  sarcosine oxidase delta subunit family protein  35.71 
 
 		 98 aa  40.8  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>