More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfl554 on replicon NC_006055
Organism: Mesoplasma florum L1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006055  Mfl554  arginyl-tRNA synthetase  100 
 
 
553 aa  1138    Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.0761585  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0376  arginyl-tRNA synthetase  63.27 
 
 
554 aa  716    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3878  arginyl-tRNA synthetase  40.29 
 
 
556 aa  426  1e-118  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.542874  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3457  arginyl-tRNA synthetase  39.18 
 
 
557 aa  422  1e-117  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5485  arginyl-tRNA synthetase  40.04 
 
 
556 aa  423  1e-117  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5493  arginyl-tRNA synthetase  39.68 
 
 
556 aa  419  1e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5213  arginyl-tRNA synthetase  39.86 
 
 
556 aa  420  1e-116  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5045  arginyl-tRNA synthetase  39.86 
 
 
556 aa  421  1e-116  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5061  arginyl-tRNA synthetase  39.86 
 
 
556 aa  420  1e-116  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5465  arginyl-tRNA synthetase  39.86 
 
 
556 aa  419  1e-116  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5611  arginyl-tRNA synthetase  39.86 
 
 
556 aa  420  1e-116  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5542  arginyl-tRNA synthetase  39.86 
 
 
556 aa  420  1e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.051551  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5455  arginyl-tRNA synthetase  39.86 
 
 
556 aa  420  1e-116  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5158  arginyl-tRNA synthetase  39.86 
 
 
556 aa  418  9.999999999999999e-116  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3348  arginyl-tRNA synthetase  39.18 
 
 
556 aa  413  1e-114  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000185624  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0262  arginyl-tRNA synthetase  41.43 
 
 
553 aa  396  1e-109  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0645  arginyl-tRNA synthetase  39.68 
 
 
553 aa  392  1e-107  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0276  arginyl-tRNA synthetase  40.38 
 
 
548 aa  389  1e-107  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0630  arginyl-tRNA synthetase  39.68 
 
 
553 aa  392  1e-107  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2283  arginyl-tRNA synthetase  36.26 
 
 
554 aa  379  1e-104  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.263992  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1940  arginyl-tRNA synthetase  36.82 
 
 
554 aa  380  1e-104  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1650  arginyl-tRNA synthetase  38.37 
 
 
546 aa  372  1e-102  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1723  arginyl-tRNA synthetase  38.37 
 
 
546 aa  372  1e-101  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1607  arginyl-tRNA synthetase  36.84 
 
 
551 aa  369  1e-101  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.113173  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1814  arginyl-tRNA synthetase  38.51 
 
 
551 aa  372  1e-101  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.679896  normal  0.951448 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2181  arginyl-tRNA synthetase  37.34 
 
 
563 aa  367  1e-100  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.264732  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1316  arginyl-tRNA synthetase  37.43 
 
 
551 aa  367  1e-100  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.73633  normal  0.0144234 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0263  arginyl-tRNA synthetase  34.58 
 
 
586 aa  364  2e-99  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0742  arginyl-tRNA synthetase  38.27 
 
 
554 aa  363  4e-99  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000856279  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2013  arginyl-tRNA synthetase  36.9 
 
 
589 aa  361  2e-98  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2295  arginyl-tRNA synthetase  36.31 
 
 
551 aa  361  2e-98  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0648  arginyl-tRNA synthetase  35.21 
 
 
559 aa  360  4e-98  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0541152  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2008  arginyl-tRNA synthetase  36.39 
 
 
589 aa  359  7e-98  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0247  arginyl-tRNA synthetase  34.53 
 
 
587 aa  358  9.999999999999999e-98  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0358001  normal  0.157381 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0850  arginyl-tRNA synthetase  36.02 
 
 
551 aa  356  5e-97  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0122015 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0743  arginyl-tRNA synthetase  35.08 
 
 
550 aa  355  1e-96  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1486  arginyl-tRNA synthetase  36.92 
 
 
550 aa  354  2e-96  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29980  arginyl-tRNA synthetase  35.65 
 
 
551 aa  354  2e-96  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.661681  normal  0.169962 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1899  arginyl-tRNA synthetase  35.71 
 
 
550 aa  353  5e-96  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0198  arginyl-tRNA synthetase  34.07 
 
 
592 aa  353  5.9999999999999994e-96  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1944  arginyl-tRNA synthetase  35.48 
 
 
575 aa  352  8.999999999999999e-96  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.567724  normal  0.240014 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0052  arginyl-tRNA synthetase  36.12 
 
 
570 aa  352  1e-95  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000995895  decreased coverage  0.000521306 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2421  arginyl-tRNA synthetase  36.23 
 
 
559 aa  352  1e-95  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0639128  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4846  arginyl-tRNA synthetase  37.13 
 
 
561 aa  349  6e-95  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000272186  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01700  arginyl-tRNA synthetase  33.8 
 
 
583 aa  349  7e-95  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000411406  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2114  arginyl-tRNA synthetase  34.04 
 
 
588 aa  349  8e-95  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2416  arginyl-tRNA synthetase  33.9 
 
 
584 aa  348  1e-94  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.615558  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0050  arginyl-tRNA synthetase  34.58 
 
 
564 aa  348  2e-94  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.302748  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0720  arginyl-tRNA synthetase  34.93 
 
 
587 aa  348  2e-94  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3089  arginyl-tRNA synthetase  33.69 
 
 
586 aa  347  3e-94  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.191401  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2456  arginyl-tRNA synthetase  34.66 
 
 
598 aa  347  3e-94  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1228  arginyl-tRNA synthetase  35.97 
 
 
550 aa  347  3e-94  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0077  arginyl-tRNA synthetase  36.3 
 
 
586 aa  346  8e-94  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2109  arginyl-tRNA synthetase  36.3 
 
 
592 aa  346  8e-94  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.513959  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0170  arginyl-tRNA synthetase  34.5 
 
 
579 aa  345  8e-94  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0349  arginyl-tRNA synthetase  34.5 
 
 
579 aa  345  8e-94  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.87333 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3898  arginyl-tRNA synthetase  35.39 
 
 
550 aa  345  1e-93  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0879275  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0561  arginyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 
559 aa  345  1e-93  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.433886 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3972  arginyl-tRNA synthetase  35.39 
 
 
550 aa  345  1e-93  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0612  arginyl-tRNA synthetase  38.61 
 
 
562 aa  344  2e-93  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.954769  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3884  arginyl-tRNA synthetase  35.39 
 
 
550 aa  344  2.9999999999999997e-93  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.103344  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1935  arginyl-tRNA synthetase  36.13 
 
 
564 aa  344  2.9999999999999997e-93  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000950947  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0820  arginyl-tRNA synthetase  38.33 
 
 
561 aa  343  2.9999999999999997e-93  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0474084  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0598  arginyl-tRNA synthetase  37.9 
 
 
553 aa  342  1e-92  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4155  arginyl-tRNA synthetase  36.65 
 
 
553 aa  341  2e-92  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.60572  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0405  arginyl-tRNA synthetase  35.08 
 
 
542 aa  341  2e-92  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3183  arginyl-tRNA synthetase  38.32 
 
 
561 aa  340  2.9999999999999998e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000169325  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2410  arginyl-tRNA synthetase  36.26 
 
 
560 aa  340  4e-92  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000917803  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11319  arginyl-tRNA synthetase  35.58 
 
 
550 aa  339  5.9999999999999996e-92  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5548  arginyl-tRNA synthetase  37.52 
 
 
550 aa  339  5.9999999999999996e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.598965  normal  0.0339829 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0602  arginyl-tRNA synthetase  36.4 
 
 
561 aa  339  7e-92  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.154913  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0285  arginyl-tRNA synthetase  35.57 
 
 
564 aa  339  9e-92  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0318968  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf134  arginyl-tRNA synthetase  37.18 
 
 
541 aa  339  9e-92  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  hitchhiker  0.00950342  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4350  arginyl-tRNA synthetase  34.27 
 
 
550 aa  339  9.999999999999999e-92  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.301994 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1495  arginyl-tRNA synthetase  35.98 
 
 
543 aa  338  1.9999999999999998e-91  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2296  arginyl-tRNA synthetase  34.27 
 
 
550 aa  336  5.999999999999999e-91  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.847928 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06570  arginyl-tRNA synthetase  34.05 
 
 
575 aa  336  5.999999999999999e-91  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.645664 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4035  arginyl-tRNA synthetase  36.07 
 
 
554 aa  336  7.999999999999999e-91  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.205832  hitchhiker  0.00704959 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2467  arginyl-tRNA synthetase  36.1 
 
 
566 aa  335  1e-90  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0465289  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2774  arginyl-tRNA synthetase  33.33 
 
 
611 aa  335  1e-90  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.744463  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3653  arginyl-tRNA synthetase  35.51 
 
 
554 aa  335  1e-90  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6158  arginyl-tRNA synthetase  34.27 
 
 
550 aa  334  3e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2673  arginyl-tRNA synthetase  37.87 
 
 
556 aa  334  3e-90  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4490  arginyl-tRNA synthetase  36.81 
 
 
561 aa  333  5e-90  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.703488 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3215  arginyl-tRNA synthetase  35.86 
 
 
556 aa  332  8e-90  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0773  arginyl-tRNA synthetase  38.72 
 
 
565 aa  332  8e-90  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09800  arginyl-tRNA synthetase  36.52 
 
 
559 aa  332  8e-90  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0453043  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1659  arginyl-tRNA synthetase  35.03 
 
 
543 aa  332  9e-90  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.826444  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3701  arginyl-tRNA synthetase  38.19 
 
 
558 aa  331  2e-89  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.70256 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1812  arginyl-tRNA synthetase  37.06 
 
 
568 aa  330  3e-89  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.246046  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1052  arginyl-tRNA synthetase  35.94 
 
 
560 aa  330  4e-89  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.473063 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0414  arginyl-tRNA synthetase  36.89 
 
 
569 aa  330  4e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.872884  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4230  arginyl-tRNA synthetase  35.48 
 
 
561 aa  330  6e-89  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.228794 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2304  arginyl-tRNA synthetase  37.89 
 
 
561 aa  327  4.0000000000000003e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0307018  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1190  arginyl-tRNA synthetase  35.14 
 
 
530 aa  326  5e-88  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1309  arginyl-tRNA synthetase  34.95 
 
 
530 aa  326  6e-88  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.96623  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0573  arginyl-tRNA synthetase  35.77 
 
 
569 aa  325  9e-88  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0027  arginyl-tRNA synthetase  33.22 
 
 
585 aa  325  1e-87  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1087  arginyl-tRNA synthetase  35.98 
 
 
531 aa  325  1e-87  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.661396  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1053  arginyl-tRNA synthetase  35.78 
 
 
556 aa  325  1e-87  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>