174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_1313 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009634  Mevan_1313  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  100 
 
 
45 aa  94  6e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.171893  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0648  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  82.22 
 
 
45 aa  83.2  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1371  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  82.22 
 
 
45 aa  83.2  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.509744  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1305  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  81.4 
 
 
44 aa  80.9  0.000000000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0505722  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0137  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  45.1 
 
 
589 aa  61.6  0.000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.114513 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0630  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  47.06 
 
 
591 aa  61.6  0.000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.123449  normal  0.0516378 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1245  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  50 
 
 
284 aa  59.3  0.00000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0468502  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1443  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  53.85 
 
 
52 aa  58.5  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0954  Glutamate synthase (NADPH)  51.28 
 
 
529 aa  57.8  0.00000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1570  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  48.72 
 
 
529 aa  57.4  0.00000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2461  Glutamate synthase (NADPH)  44.19 
 
 
529 aa  57.4  0.00000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1288  flavin reductase-like, FMN-binding  45.83 
 
 
229 aa  54.3  0.0000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000609223 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3188  rubredoxin  53.06 
 
 
52 aa  53.9  0.0000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2210  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  42.55 
 
 
480 aa  51.6  0.000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0117  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  55.1 
 
 
52 aa  52  0.000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.403873  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0973  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  48.98 
 
 
52 aa  50.1  0.000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000000469593  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1931  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  47.06 
 
 
65 aa  49.7  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0875  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  47.83 
 
 
52 aa  50.1  0.00001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000000124351  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2501  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  44.9 
 
 
54 aa  49.3  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.843854  normal  0.828808 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0466  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  49.02 
 
 
52 aa  48.9  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2011  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  50 
 
 
45 aa  49.3  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000000593389  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2048  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  44.9 
 
 
52 aa  48.9  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.59994e-22 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0677  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  45.65 
 
 
53 aa  48.9  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000269222  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0175  hypothetical protein  45.83 
 
 
51 aa  48.5  0.00003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2127  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  45.65 
 
 
58 aa  48.1  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.240387 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0757  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  43.9 
 
 
469 aa  48.1  0.00004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1457  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  45.65 
 
 
58 aa  48.1  0.00004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.296231  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0937  rubredoxin-related protein  42.55 
 
 
105 aa  47.8  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.198839  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2713  flavin reductase domain protein FMN-binding  41.3 
 
 
227 aa  47.4  0.00007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.120734 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2175  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  42.86 
 
 
52 aa  47.4  0.00007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.81123  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0139  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  44.9 
 
 
53 aa  47.4  0.00007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.43807 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1630  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  44.9 
 
 
54 aa  47  0.00008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0146  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  42.86 
 
 
52 aa  47  0.00008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.497635  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2653  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  41.51 
 
 
53 aa  47  0.00008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1551  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  46.81 
 
 
50 aa  47  0.00009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00582708 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0869  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  46.94 
 
 
52 aa  47  0.00009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000308024  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0270  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  44.9 
 
 
53 aa  46.6  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0460906  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2515  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  42.31 
 
 
53 aa  47  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.310481  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3171  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  46.94 
 
 
52 aa  46.6  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000167353  normal  0.561512 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3222  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  44.9 
 
 
52 aa  46.2  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.798538  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0203  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  46.94 
 
 
52 aa  47  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0916  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  42.55 
 
 
100 aa  46.6  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.537464  normal  0.0622882 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0272  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  44.9 
 
 
53 aa  46.6  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000689971  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1125  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  42.86 
 
 
53 aa  45.8  0.0002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.228048  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0615  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  46.94 
 
 
52 aa  46.2  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2282  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  42.55 
 
 
60 aa  46.2  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5702  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  42.55 
 
 
60 aa  46.2  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1202  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  43.48 
 
 
63 aa  45.4  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1284  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  44.9 
 
 
53 aa  45.8  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000469047  hitchhiker  0.0000101386 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3342  putative rubredoxin  43.48 
 
 
63 aa  45.4  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1335  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  47.5 
 
 
221 aa  46.2  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.296407  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2480  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  44.9 
 
 
52 aa  45.4  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1751  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  42.55 
 
 
60 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2399  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  42.55 
 
 
70 aa  46.2  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.525804  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2363  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  42.55 
 
 
60 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2164  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  44.9 
 
 
52 aa  45.8  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2644  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  42 
 
 
59 aa  45.8  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.277748  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0847  rubredoxin  44 
 
 
52 aa  45.1  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1239  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  45.83 
 
 
114 aa  45.1  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2796  rubredoxin  43.48 
 
 
53 aa  45.1  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  7.50585e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0147  rubredoxin  42.31 
 
 
52 aa  45.1  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4069  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  42.86 
 
 
53 aa  45.1  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000133148  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0282  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  42.86 
 
 
73 aa  45.4  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00279479  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0090  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  46.94 
 
 
52 aa  45.1  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1473  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  45.65 
 
 
52 aa  45.1  0.0003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3344  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  46.94 
 
 
52 aa  45.1  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000210348  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0972  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  40.91 
 
 
476 aa  45.1  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.425779 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1197  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  42.86 
 
 
52 aa  45.1  0.0003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.1609  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0620  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  44.9 
 
 
52 aa  44.7  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.343902  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4853  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  38.3 
 
 
445 aa  45.1  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0852064 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2295  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  42.55 
 
 
51 aa  44.7  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000169241  hitchhiker  0.00000221538 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1386  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  40.82 
 
 
62 aa  44.7  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0331186  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3119  flavin reductase-like, FMN-binding  45.45 
 
 
220 aa  44.7  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2554  rubredoxin protein  41.67 
 
 
60 aa  44.3  0.0005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2173  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  40.91 
 
 
415 aa  44.3  0.0005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.953962  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0414  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  40.82 
 
 
52 aa  44.7  0.0005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1308  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  38.64 
 
 
444 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1149  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  38.64 
 
 
444 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.751699 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2205  rubredoxin  40.43 
 
 
60 aa  43.9  0.0007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0691  rubredoxin  40.43 
 
 
67 aa  43.9  0.0007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2523  rubredoxin  40.43 
 
 
60 aa  43.9  0.0007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0253  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  42.86 
 
 
52 aa  43.9  0.0007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1134  rubredoxin  40.43 
 
 
67 aa  43.9  0.0007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.82045  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1142  rubredoxin  40.43 
 
 
67 aa  43.9  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2089  rubredoxin  40.43 
 
 
67 aa  43.9  0.0007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0788  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  38.78 
 
 
56 aa  43.9  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.901493 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1444  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  43.4 
 
 
74 aa  43.9  0.0008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3357  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  40.82 
 
 
52 aa  43.5  0.0009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0177  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  40.82 
 
 
58 aa  43.5  0.0009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_16606  predicted protein  43.75 
 
 
130 aa  42.7  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.176654  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1472  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  43.48 
 
 
52 aa  42.7  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2186  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  42.86 
 
 
52 aa  43.5  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0152029  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2699  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  40.82 
 
 
52 aa  43.1  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000257372  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6897  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  39.22 
 
 
56 aa  42.7  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1534  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  44.68 
 
 
69 aa  43.1  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.477082  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3672  rubredoxin  39.13 
 
 
57 aa  43.1  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0459184  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0944  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  44.44 
 
 
51 aa  43.5  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.182729  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_9570  predicted protein  43.48 
 
 
93 aa  43.1  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.99715  normal  0.0887132 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0735  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  40.82 
 
 
52 aa  42.4  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0817  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  39.58 
 
 
115 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.187939 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>