178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_0648 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009975  MmarC6_0648  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  100 
 
 
45 aa  93.2  1e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1371  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  97.78 
 
 
45 aa  92  2e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.509744  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1305  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  95.35 
 
 
44 aa  89  2e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0505722  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1313  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  82.22 
 
 
45 aa  83.2  0.000000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.171893  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0630  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  47.06 
 
 
591 aa  60.5  0.000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.123449  normal  0.0516378 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0137  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  46 
 
 
589 aa  58.5  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.114513 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0954  Glutamate synthase (NADPH)  50 
 
 
529 aa  57.8  0.00000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2461  Glutamate synthase (NADPH)  46.51 
 
 
529 aa  57.8  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1443  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  48.08 
 
 
52 aa  53.9  0.0000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3188  rubredoxin  53.06 
 
 
52 aa  53.5  0.0000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1288  flavin reductase-like, FMN-binding  47.83 
 
 
229 aa  52.8  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000609223 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1245  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  46.81 
 
 
284 aa  52.8  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0468502  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0175  hypothetical protein  50 
 
 
51 aa  52.8  0.000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2210  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  40.43 
 
 
480 aa  51.6  0.000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1570  glutamate synthase (NADPH) GltB2 subunit  46.67 
 
 
529 aa  51.6  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0117  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  53.06 
 
 
52 aa  50.8  0.000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.403873  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2048  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  45.1 
 
 
52 aa  50.8  0.000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.59994e-22 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3171  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  45.1 
 
 
52 aa  48.9  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000167353  normal  0.561512 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0615  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  48.98 
 
 
52 aa  48.9  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0146  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  44.9 
 
 
52 aa  48.9  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.497635  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2011  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  47.62 
 
 
45 aa  49.3  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000000593389  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1630  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  46.94 
 
 
54 aa  49.3  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2175  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  43.14 
 
 
52 aa  48.5  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.81123  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0203  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  46.94 
 
 
52 aa  48.5  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0973  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  46.94 
 
 
52 aa  48.5  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000000469593  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0677  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  45.65 
 
 
53 aa  48.5  0.00003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000269222  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0875  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  45.65 
 
 
52 aa  48.1  0.00004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000000124351  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3222  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  44.9 
 
 
52 aa  47.8  0.00005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.798538  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2480  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  46.94 
 
 
52 aa  47.4  0.00006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0139  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  42.86 
 
 
53 aa  47.4  0.00006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.43807 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2295  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  44.68 
 
 
51 aa  47.8  0.00006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000169241  hitchhiker  0.00000221538 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0466  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  46.94 
 
 
52 aa  47.4  0.00006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2515  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  42.31 
 
 
53 aa  47.8  0.00006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.310481  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1444  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  45.28 
 
 
74 aa  47  0.00008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0869  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  44.9 
 
 
52 aa  47  0.00008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000308024  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0847  rubredoxin  43.14 
 
 
52 aa  46.6  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2501  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  42.86 
 
 
54 aa  46.2  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.843854  normal  0.828808 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0147  rubredoxin  44.9 
 
 
52 aa  46.2  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1308  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  43.18 
 
 
444 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0270  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  42.86 
 
 
53 aa  46.6  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0460906  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0757  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  43.9 
 
 
469 aa  46.6  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0272  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  42.86 
 
 
53 aa  46.6  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000689971  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1149  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  43.18 
 
 
444 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.751699 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0177  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  40.82 
 
 
58 aa  45.4  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1457  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  43.48 
 
 
58 aa  45.8  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.296231  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2699  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  42.86 
 
 
52 aa  45.8  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000257372  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0972  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  40.91 
 
 
476 aa  45.4  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.425779 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0842  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  43.48 
 
 
63 aa  45.4  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000763829  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0414  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  40.38 
 
 
52 aa  45.8  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1125  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  39.62 
 
 
53 aa  45.1  0.0003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.228048  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0944  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  46.67 
 
 
51 aa  45.1  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.182729  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2164  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  44.9 
 
 
52 aa  45.1  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1335  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  50 
 
 
221 aa  45.4  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.296407  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0620  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  44.9 
 
 
52 aa  44.7  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.343902  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0090  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  44.9 
 
 
52 aa  45.1  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0217  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  42.86 
 
 
58 aa  44.7  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0253  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  44.9 
 
 
52 aa  45.1  0.0004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1239  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  43.14 
 
 
114 aa  44.7  0.0004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1551  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  42.55 
 
 
50 aa  44.3  0.0005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00582708 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1197  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  40.38 
 
 
52 aa  44.3  0.0005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.1609  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1284  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  40.82 
 
 
53 aa  44.3  0.0006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000469047  hitchhiker  0.0000101386 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2173  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  38.64 
 
 
415 aa  44.3  0.0006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.953962  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1386  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  40 
 
 
62 aa  44.3  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0331186  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3672  rubredoxin  39.13 
 
 
57 aa  43.9  0.0006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0459184  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2368  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  40 
 
 
75 aa  44.3  0.0006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.589579 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0667  rubredoxin protein  44.68 
 
 
60 aa  43.9  0.0007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6897  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  40 
 
 
56 aa  43.9  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1978  rubredoxin-like  38.78 
 
 
76 aa  43.9  0.0007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000953598  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0611  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  44.68 
 
 
60 aa  43.9  0.0007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.672431  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0559  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  44.68 
 
 
60 aa  43.9  0.0007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.319433  normal  0.961099 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3447  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  38.3 
 
 
58 aa  43.9  0.0007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3119  flavin reductase-like, FMN-binding  45.24 
 
 
220 aa  43.9  0.0007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2653  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  37.74 
 
 
53 aa  43.9  0.0007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4853  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  34.04 
 
 
445 aa  43.9  0.0008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0852064 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2061  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  41.67 
 
 
462 aa  43.9  0.0008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1559  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  42.55 
 
 
60 aa  43.5  0.0009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.232754  normal  0.675507 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5371  rubredoxin/rubredoxin reductase  36.73 
 
 
461 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.205307 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4666  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  38.64 
 
 
444 aa  43.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00796628  normal  0.983667 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2554  rubredoxin protein  42.55 
 
 
60 aa  43.1  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1857  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  42.86 
 
 
111 aa  43.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3173  rubredoxin  43.48 
 
 
91 aa  43.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.665694  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2796  rubredoxin  38.78 
 
 
53 aa  43.1  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  7.50585e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0788  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  36.73 
 
 
56 aa  43.5  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.901493 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2184  rubrerythrin  37.5 
 
 
243 aa  43.1  0.001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0937  rubredoxin-related protein  38.3 
 
 
105 aa  43.1  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.198839  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2186  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  40.82 
 
 
52 aa  42.7  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0152029  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1538  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  42.55 
 
 
237 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.029752 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0782  rubredoxin  39.22 
 
 
53 aa  43.1  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0768  rubredoxin  39.22 
 
 
53 aa  43.1  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.108863  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0282  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  44.9 
 
 
73 aa  43.5  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00279479  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1352  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  45.45 
 
 
59 aa  43.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.246389  normal  0.726116 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1744  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  45.45 
 
 
60 aa  42.7  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2127  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  39.13 
 
 
58 aa  42.7  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.240387 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1511  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  42.55 
 
 
237 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1931  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  44 
 
 
65 aa  43.1  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1377  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  38.78 
 
 
55 aa  43.1  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.320132  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13279  rubredoxin rubB  40.43 
 
 
60 aa  43.5  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.610704  normal  0.724934 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1999  rubredoxin  43.48 
 
 
56 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3960  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  43.48 
 
 
56 aa  42.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.326479 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1460  rubredoxin  43.48 
 
 
56 aa  42.7  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>