279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0282 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0282  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  100 
 
 
73 aa  151  2.9999999999999998e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00279479  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0875  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  56.25 
 
 
52 aa  61.2  0.000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000000124351  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0147  rubredoxin  50 
 
 
52 aa  61.2  0.000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1931  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  47.76 
 
 
65 aa  60.8  0.000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0137  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  51.02 
 
 
589 aa  60.8  0.000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.114513 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4069  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  45.28 
 
 
53 aa  59.7  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000133148  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1538  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  52.17 
 
 
237 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.029752 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2501  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  48.15 
 
 
54 aa  58.9  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.843854  normal  0.828808 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1443  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  46.15 
 
 
52 aa  58.9  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1511  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  52.17 
 
 
237 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0620  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  50.98 
 
 
52 aa  58.5  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.343902  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0217  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  43.1 
 
 
58 aa  58.5  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0139  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  50.94 
 
 
53 aa  58.2  0.00000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.43807 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2210  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  45.65 
 
 
480 aa  57.8  0.00000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1197  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  50 
 
 
52 aa  57.8  0.00000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.1609  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3188  rubredoxin  49.02 
 
 
52 aa  57.4  0.00000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3080  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  46 
 
 
54 aa  57.4  0.00000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.3234  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0677  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  54.35 
 
 
53 aa  57  0.00000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000269222  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28841  rubredoxin:rubrerythrin:rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  45.83 
 
 
235 aa  57  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2173  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  38.89 
 
 
415 aa  57  0.00000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.953962  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0414  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  48.08 
 
 
52 aa  56.2  0.0000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_9570  predicted protein  52.08 
 
 
93 aa  56.2  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.99715  normal  0.0887132 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1978  rubredoxin-like  45.1 
 
 
76 aa  56.2  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000953598  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1472  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  46 
 
 
52 aa  55.5  0.0000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0177  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  47.17 
 
 
58 aa  56.2  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1473  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  46 
 
 
52 aa  56.2  0.0000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1245  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  50 
 
 
284 aa  55.5  0.0000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0468502  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0735  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  46.15 
 
 
52 aa  55.1  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0750  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  46.15 
 
 
52 aa  55.5  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000427442 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2713  flavin reductase domain protein FMN-binding  54.55 
 
 
227 aa  55.5  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.120734 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2699  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  46.15 
 
 
52 aa  55.1  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000257372  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0090  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  44.23 
 
 
52 aa  55.5  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0203  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  47.06 
 
 
52 aa  54.7  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2533  rubrerythrin  45.83 
 
 
237 aa  54.7  0.0000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3344  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  47.06 
 
 
52 aa  53.9  0.0000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000210348  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2515  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  45.28 
 
 
53 aa  54.3  0.0000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.310481  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1649  rubrerythrin  43.48 
 
 
238 aa  54.3  0.0000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.429351 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1081  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  47.06 
 
 
54 aa  53.9  0.0000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0767205  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0037  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  39.29 
 
 
455 aa  53.9  0.0000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1630  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  50 
 
 
54 aa  53.9  0.0000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4853  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  36.07 
 
 
445 aa  53.9  0.0000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0852064 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1288  flavin reductase-like, FMN-binding  46.67 
 
 
229 aa  53.9  0.0000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000609223 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13279  rubredoxin rubB  45.1 
 
 
60 aa  53.5  0.0000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.610704  normal  0.724934 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1582  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  42 
 
 
54 aa  53.5  0.0000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1444  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  42.59 
 
 
74 aa  53.5  0.0000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4424  rubrerythrin  42.55 
 
 
237 aa  53.1  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0272  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  49.02 
 
 
53 aa  52.8  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000689971  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3171  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  46 
 
 
52 aa  53.1  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000167353  normal  0.561512 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0270  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  49.02 
 
 
53 aa  52.8  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0460906  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0973  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  47.06 
 
 
52 aa  53.1  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000000469593  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2164  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  44.23 
 
 
52 aa  53.5  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1386  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  45.1 
 
 
62 aa  53.1  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0331186  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3222  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  46.15 
 
 
52 aa  53.1  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.798538  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2688  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  48 
 
 
54 aa  53.1  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.243531  normal  0.0572068 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0847  rubredoxin  44.9 
 
 
52 aa  52.8  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27651  rubredoxin  43.14 
 
 
53 aa  52.8  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3357  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  42.31 
 
 
52 aa  52  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2796  rubredoxin  46.94 
 
 
53 aa  52.8  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  7.50585e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0630  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  42.86 
 
 
591 aa  52.8  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.123449  normal  0.0516378 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1352  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  44.23 
 
 
59 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.246389  normal  0.726116 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1551  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  48.08 
 
 
50 aa  52  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00582708 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2748  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  44.23 
 
 
62 aa  52  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0439  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  47.83 
 
 
172 aa  52  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.281329  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0817  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  47.73 
 
 
115 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.187939 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1308  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  39.62 
 
 
444 aa  52  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1202  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  45.65 
 
 
63 aa  51.6  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3342  putative rubredoxin  45.65 
 
 
63 aa  51.6  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3952  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  47.83 
 
 
61 aa  51.6  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.336788 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0146  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  47.06 
 
 
52 aa  52  0.000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.497635  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3502  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  42.59 
 
 
113 aa  51.6  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.373315 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2399  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  45.1 
 
 
70 aa  51.6  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.525804  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2127  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  47.83 
 
 
58 aa  52  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.240387 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48490  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  46 
 
 
55 aa  52  0.000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.552989  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0608  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  47.83 
 
 
172 aa  52  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.128184  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1125  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  44 
 
 
53 aa  51.2  0.000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.228048  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4666  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  39.62 
 
 
444 aa  51.2  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.00796628  normal  0.983667 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22490  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  45.1 
 
 
53 aa  51.6  0.000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000285186  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0869  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  43.14 
 
 
52 aa  51.2  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000308024  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1751  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  45.1 
 
 
60 aa  51.2  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3355  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  42.31 
 
 
57 aa  51.6  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.862516  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2282  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  45.1 
 
 
60 aa  51.6  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2363  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  45.1 
 
 
60 aa  51.2  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2935  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  43.14 
 
 
53 aa  51.6  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2026  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  40.43 
 
 
641 aa  51.2  0.000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000211003  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1149  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  39.62 
 
 
444 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.751699 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6897  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  46.94 
 
 
56 aa  51.2  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0937  rubredoxin-related protein  45.65 
 
 
105 aa  51.2  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.198839  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1537  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  43.48 
 
 
237 aa  51.2  0.000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0402296  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7086  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  45.65 
 
 
137 aa  50.8  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7103  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  45.65 
 
 
140 aa  50.8  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.712022 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0205  RubA  45.65 
 
 
81 aa  50.8  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3930  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  46 
 
 
53 aa  50.8  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00186647 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4719  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  43.14 
 
 
60 aa  50.8  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.378789 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0441  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  45.65 
 
 
177 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0132862  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5371  rubredoxin/rubredoxin reductase  37.7 
 
 
461 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.205307 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0602  rubredoxin  44.68 
 
 
58 aa  50.4  0.000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000399652 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2749  rubredoxin  50 
 
 
51 aa  50.4  0.000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0916  rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  43.14 
 
 
100 aa  50.4  0.000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.537464  normal  0.0622882 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2480  Rubredoxin-type Fe(Cys)4 protein  41.18 
 
 
52 aa  50.1  0.000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0081  acyl-CoA dehydrogenase domain protein  53.85 
 
 
642 aa  49.7  0.00001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>