32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0350 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_0350  putative GAF sensor protein  100 
 
 		 443 aa  898    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0055  GAF:pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  51 
 
 		 458 aa  424  1e-117  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3714  putative GAF sensor protein  51.12 
 
 		 448 aa  405  1.0000000000000001e-112  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.865149 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0630  putative GAF sensor protein  50.78 
 
 		 473 aa  406  1.0000000000000001e-112  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3699  hypothetical protein  48.31 
 
 		 445 aa  403  1e-111  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0480  putative phytochrome sensor protein  51.12 
 
 		 448 aa  405  1e-111  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2916  putative GAF sensor protein  40.63 
 
 		 450 aa  273  5.000000000000001e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.129198  normal  0.11422 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3146  putative phytochrome sensor protein  41.65 
 
 		 466 aa  268  1e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.211727  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3247  putative phytochrome sensor protein  41.43 
 
 		 466 aa  266  7e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0419634  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3048  putative GAF sensor protein  41.12 
 
 		 467 aa  265  1e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1553  putative GAF sensor protein  37.69 
 
 		 448 aa  251  2e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00827304  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0503  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase PtsP  25.15 
 
 		 760 aa  60.5  0.00000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0356191 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1045  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  28.8 
 
 		 134 aa  57.4  0.0000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0950451  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1657  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  28.16 
 
 		 134 aa  52.8  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4523  diguanylate cyclase with GAF sensor  24.56 
 
 		 499 aa  51.6  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.967133  normal  0.833222 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1503  putative phytochrome sensor protein  30.71 
 
 		 1182 aa  51.2  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.531436 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1441  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  35.63 
 
 		 134 aa  50.1  0.00009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.109181  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0462  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  33.33 
 
 		 134 aa  48.1  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.191705 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2414  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase PtsP  21.64 
 
 		 756 aa  47.8  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4627  GAF sensor signal transduction histidine kinase  26.26 
 
 		 662 aa  47  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.622134  hitchhiker  0.00510111 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2295  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.93 
 
 		 905 aa  46.6  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4451  signal transduction histidine kinase  26.77 
 
 		 647 aa  46.6  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0783644  hitchhiker  0.000419686 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0586  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  28.3 
 
 		 134 aa  46.2  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.114456  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0905  fused phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase PtsP/GAF domain  21.86 
 
 		 748 aa  45.4  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0677572  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0570  fused phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase PtsP/GAF domain  20.2 
 
 		 753 aa  45.1  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00603169  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1577  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  32.26 
 
 		 134 aa  44.3  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.188247  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3004  hypothetical protein  29.81 
 
 		 134 aa  44.7  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.146588  hitchhiker  0.00337909 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0609  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  31.86 
 
 		 123 aa  43.9  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0297  hypothetical protein  32.08 
 
 		 139 aa  43.9  0.006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.275356  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3170  multi-sensor signal transduction histidine kinase  22.73 
 
 		 911 aa  43.9  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004430  phosphocarrier protein kinase/phosphorylase nitrogen regulation associated  19.41 
 
 		 748 aa  43.5  0.008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000755885  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0815  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase PtsP  22.09 
 
 		 768 aa  43.1  0.009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.552071  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>