31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_2916 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009675  Anae109_2916  putative GAF sensor protein  100 
 
 		 450 aa  897    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.129198  normal  0.11422 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3048  putative GAF sensor protein  69.83 
 
 		 467 aa  592  1e-168  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3146  putative phytochrome sensor protein  69.6 
 
 		 466 aa  583  1.0000000000000001e-165  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.211727  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3247  putative phytochrome sensor protein  69.16 
 
 		 466 aa  580  1e-164  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0419634  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0055  GAF:pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  44.12 
 
 		 458 aa  325  9e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0630  putative GAF sensor protein  41.81 
 
 		 473 aa  306  6e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3699  hypothetical protein  40.13 
 
 		 445 aa  305  1.0000000000000001e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0480  putative phytochrome sensor protein  43.81 
 
 		 448 aa  290  2e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0350  putative GAF sensor protein  39.95 
 
 		 443 aa  288  1e-76  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3714  putative GAF sensor protein  42.98 
 
 		 448 aa  282  8.000000000000001e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.865149 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1553  putative GAF sensor protein  36.47 
 
 		 448 aa  227  3e-58  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00827304  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1441  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  27.12 
 
 		 134 aa  58.9  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.109181  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1657  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  26.27 
 
 		 134 aa  57.4  0.0000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1045  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  24.77 
 
 		 134 aa  55.8  0.000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0950451  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3577  hypothetical protein  29.84 
 
 		 137 aa  56.2  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.179326 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0586  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  26.98 
 
 		 134 aa  54.3  0.000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.114456  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2295  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.32 
 
 		 905 aa  52.4  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1426  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  31.11 
 
 		 133 aa  50.8  0.00005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.0000000000000163802  normal  0.0247628 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1522  hypothetical protein  30.39 
 
 		 134 aa  50.4  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.249328  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3004  hypothetical protein  26.4 
 
 		 134 aa  49.7  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.146588  hitchhiker  0.00337909 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0341  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.12 
 
 		 725 aa  48.1  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0143238  hitchhiker  0.0051816 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1217  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.59 
 
 		 1877 aa  46.6  0.0009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2013  multi-sensor hybrid histidine kinase  25 
 
 		 801 aa  46.6  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2162  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  26.09 
 
 		 1017 aa  45.8  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.266871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2935  putative GAF sensor protein  26.83 
 
 		 242 aa  45.8  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000271944  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0293  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  37.74 
 
 		 132 aa  45.4  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1196  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  27.03 
 
 		 1004 aa  44.7  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.472848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3439  serine phosphatase  23.85 
 
 		 584 aa  44.7  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0503  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase PtsP  24.16 
 
 		 760 aa  44.3  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0356191 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0570  NifA subfamily transcriptional regulator  34.04 
 
 		 508 aa  43.9  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.106051  normal  0.50757 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1133  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase PtsP  23.37 
 
 		 744 aa  43.5  0.008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000186405  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>