68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_3714 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_0480  putative phytochrome sensor protein  98.43 
 
 		 448 aa  889    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3714  putative GAF sensor protein  100 
 
 		 448 aa  904    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.865149 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0630  putative GAF sensor protein  63.89 
 
 		 473 aa  518  1e-146  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0055  GAF:pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  57.68 
 
 		 458 aa  485  1e-136  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3699  hypothetical protein  51.12 
 
 		 445 aa  427  1e-118  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0350  putative GAF sensor protein  51.34 
 
 		 443 aa  419  1e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3146  putative phytochrome sensor protein  42.06 
 
 		 466 aa  295  1e-78  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.211727  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3247  putative phytochrome sensor protein  42.03 
 
 		 466 aa  294  2e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0419634  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3048  putative GAF sensor protein  41.33 
 
 		 467 aa  294  2e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2916  putative GAF sensor protein  42.86 
 
 		 450 aa  292  1e-77  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.129198  normal  0.11422 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1553  putative GAF sensor protein  39.31 
 
 		 448 aa  266  5e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00827304  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0503  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase PtsP  25.26 
 
 		 760 aa  56.6  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0356191 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1045  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  26.92 
 
 		 134 aa  54.3  0.000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0950451  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2503  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase PtsP  32.79 
 
 		 755 aa  52  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.118134 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1441  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  35.63 
 
 		 134 aa  52  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.109181  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4523  diguanylate cyclase with GAF sensor  27.67 
 
 		 499 aa  51.6  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.967133  normal  0.833222 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2414  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase PtsP  25.6 
 
 		 756 aa  50.8  0.00005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3956  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase  32.79 
 
 		 754 aa  50.4  0.00007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1734  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase  24.85 
 
 		 759 aa  49.3  0.0001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0439  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase  24.85 
 
 		 766 aa  49.3  0.0001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.293101  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3004  hypothetical protein  27.83 
 
 		 134 aa  49.7  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.146588  hitchhiker  0.00337909 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1035  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase PtsP  33.61 
 
 		 756 aa  49.7  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1801  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase  33.61 
 
 		 756 aa  48.5  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0479951  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1870  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase  33.61 
 
 		 756 aa  48.5  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1010  NifA subfamily transcriptional regulator  25.25 
 
 		 510 aa  48.9  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.502201  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3845  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase PtsP  23.53 
 
 		 762 aa  48.5  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1657  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  28.16 
 
 		 134 aa  48.1  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3525  PTSINtr with GAF domain, PtsP  32.69 
 
 		 755 aa  47.4  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.475893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0293  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  40 
 
 		 132 aa  47.4  0.0005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3817  PTSINtr with GAF domain, PtsP  32.69 
 
 		 755 aa  47.4  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.394917  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0341  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.42 
 
 		 725 aa  47  0.0006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0143238  hitchhiker  0.0051816 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004430  phosphocarrier protein kinase/phosphorylase nitrogen regulation associated  21.08 
 
 		 748 aa  47.4  0.0006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000755885  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1919  Fis family transcriptional regulator  24.5 
 
 		 545 aa  47  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3000  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase PtsP  31.07 
 
 		 756 aa  47  0.0007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.246916  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0586  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  27.45 
 
 		 134 aa  47  0.0007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.114456  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0462  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  27.2 
 
 		 134 aa  47  0.0007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.191705 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1522  hypothetical protein  33.75 
 
 		 134 aa  47  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.249328  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0570  fused phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase PtsP/GAF domain  22.16 
 
 		 753 aa  47  0.0008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00603169  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0046  transcriptional regulator, CdaR  29.1 
 
 		 665 aa  46.6  0.0008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.541147  normal  0.0349089 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2004  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.33 
 
 		 634 aa  46.2  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000423635  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2864  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase PtsP  27.03 
 
 		 744 aa  45.4  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000439505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2946  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase PtsP  27.03 
 
 		 744 aa  45.4  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00960304  normal  0.595887 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3631  signal transduction histidine kinase  27.49 
 
 		 666 aa  45.4  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0281267  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3042  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase PtsP  27.03 
 
 		 744 aa  45.4  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00619839  normal  0.738534 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2966  transcriptional regulator NifA  28.47 
 
 		 515 aa  45.8  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0884  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase PtsP  25.45 
 
 		 755 aa  45.4  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4627  GAF sensor signal transduction histidine kinase  26.9 
 
 		 662 aa  45.1  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.622134  hitchhiker  0.00510111 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1426  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  35.09 
 
 		 133 aa  44.7  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.0000000000000163802  normal  0.0247628 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0771  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  25.43 
 
 		 880 aa  44.7  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0538  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  25.43 
 
 		 860 aa  45.1  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.883741  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1132  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  31.71 
 
 		 134 aa  45.1  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.492287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3577  hypothetical protein  27.97 
 
 		 137 aa  44.7  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.179326 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1108  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.27 
 
 		 464 aa  44.3  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1577  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  36.14 
 
 		 134 aa  44.7  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.188247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4451  signal transduction histidine kinase  25.73 
 
 		 647 aa  43.9  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0783644  hitchhiker  0.000419686 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0570  NifA subfamily transcriptional regulator  25.98 
 
 		 508 aa  43.9  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.106051  normal  0.50757 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0428  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase PtsP  23.18 
 
 		 754 aa  43.9  0.006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0167147 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0397  PTSINtr with GAF domain, PtsP  23.03 
 
 		 755 aa  43.9  0.006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.330427  normal  0.719594 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2576  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase PtsP  24.14 
 
 		 755 aa  43.9  0.006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3197  fused phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase PtsP/GAF domain  24.71 
 
 		 749 aa  43.5  0.007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00965467  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0993  PTSINtr with GAF domain, PtsP  29.45 
 
 		 761 aa  43.5  0.007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1959  hypothetical protein  21.78 
 
 		 139 aa  43.5  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1332  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase PtsP  26.49 
 
 		 744 aa  43.5  0.008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00968  fused phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase PtsP/GAF domain  20.1 
 
 		 748 aa  43.5  0.008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1261  hypothetical protein  29.59 
 
 		 133 aa  43.5  0.008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0996  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  25.44 
 
 		 134 aa  43.1  0.009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0213212  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0353  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  31.86 
 
 		 123 aa  43.1  0.01  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.257976  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0204  fused phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase PtsP/GAF domain  19.61 
 
 		 748 aa  43.1  0.01  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>