40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1553 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_1553  putative GAF sensor protein  100 
 
 		 448 aa  896    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00827304  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0055  GAF:pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  39.38 
 
 		 458 aa  286  4e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0350  putative GAF sensor protein  38.75 
 
 		 443 aa  278  1e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0480  putative phytochrome sensor protein  40.37 
 
 		 448 aa  278  2e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3714  putative GAF sensor protein  40 
 
 		 448 aa  275  1.0000000000000001e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.865149 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0630  putative GAF sensor protein  38.72 
 
 		 473 aa  261  2e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3699  hypothetical protein  35.11 
 
 		 445 aa  254  3e-66  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3146  putative phytochrome sensor protein  36.91 
 
 		 466 aa  245  9.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.211727  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3048  putative GAF sensor protein  36.53 
 
 		 467 aa  244  1.9999999999999999e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3247  putative phytochrome sensor protein  35.79 
 
 		 466 aa  240  5e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0419634  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2916  putative GAF sensor protein  36.69 
 
 		 450 aa  239  6.999999999999999e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.129198  normal  0.11422 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1850  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with GAF sensor  29.02 
 
 		 790 aa  58.5  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.136475  hitchhiker  0.00884897 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1045  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  30.08 
 
 		 134 aa  57.8  0.0000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0950451  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1217  multi-sensor signal transduction histidine kinase  22.75 
 
 		 1877 aa  56.2  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1441  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  31.48 
 
 		 134 aa  55.1  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.109181  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3004  hypothetical protein  27.88 
 
 		 134 aa  52.8  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.146588  hitchhiker  0.00337909 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0341  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.66 
 
 		 725 aa  52  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0143238  hitchhiker  0.0051816 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0293  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  32.08 
 
 		 132 aa  52  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1125  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  37.74 
 
 		 136 aa  50.1  0.00008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.502995  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0783  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  29.13 
 
 		 151 aa  48.9  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.409434  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1522  hypothetical protein  26.92 
 
 		 134 aa  48.9  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.249328  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1657  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  26.27 
 
 		 134 aa  45.8  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1035  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase PtsP  27.27 
 
 		 756 aa  46.2  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1801  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase  27.1 
 
 		 756 aa  46.2  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0479951  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1426  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  40 
 
 		 133 aa  45.8  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.0000000000000163802  normal  0.0247628 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0996  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  28.32 
 
 		 134 aa  45.8  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0213212  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1870  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase  27.1 
 
 		 756 aa  45.8  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2783  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  26.92 
 
 		 1101 aa  44.7  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0428  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase PtsP  28.74 
 
 		 754 aa  44.3  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0167147 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3000  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase PtsP  26.89 
 
 		 756 aa  44.3  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.246916  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4114  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.84 
 
 		 3470 aa  43.9  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0822  diguanylate cyclase  23.67 
 
 		 554 aa  43.9  0.005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00155452  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2549  GAF sensor signal transduction histidine kinase  26.26 
 
 		 456 aa  44.3  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0462  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  41.67 
 
 		 134 aa  43.9  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.191705 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0149  signal transduction histidine kinase, LytS  30.1 
 
 		 1192 aa  43.9  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.413609 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1261  hypothetical protein  33.33 
 
 		 133 aa  43.5  0.007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1346  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  21.79 
 
 		 947 aa  43.1  0.009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0320  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase PtsP  26.14 
 
 		 759 aa  43.1  0.009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.874945  normal  0.406154 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4523  diguanylate cyclase with GAF sensor  22.53 
 
 		 499 aa  43.1  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.967133  normal  0.833222 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2414  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase PtsP  23.98 
 
 		 756 aa  43.1  0.01  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>