39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A0055 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A0055  GAF:pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  100 
 
 		 458 aa  917    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3714  putative GAF sensor protein  57.49 
 
 		 448 aa  461  1e-129  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.865149 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0480  putative phytochrome sensor protein  58.09 
 
 		 448 aa  460  9.999999999999999e-129  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0630  putative GAF sensor protein  57.08 
 
 		 473 aa  461  9.999999999999999e-129  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3699  hypothetical protein  54.28 
 
 		 445 aa  443  1e-123  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0350  putative GAF sensor protein  50.88 
 
 		 443 aa  426  1e-118  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2916  putative GAF sensor protein  44.57 
 
 		 450 aa  312  1e-83  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.129198  normal  0.11422 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3146  putative phytochrome sensor protein  44.02 
 
 		 466 aa  306  5.0000000000000004e-82  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.211727  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3247  putative phytochrome sensor protein  43.79 
 
 		 466 aa  305  1.0000000000000001e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0419634  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3048  putative GAF sensor protein  43.54 
 
 		 467 aa  303  3.0000000000000004e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1553  putative GAF sensor protein  38.27 
 
 		 448 aa  263  4.999999999999999e-69  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00827304  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1045  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  28.04 
 
 		 134 aa  57.8  0.0000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0950451  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0503  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase PtsP  23.84 
 
 		 760 aa  52.8  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0356191 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3170  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.08 
 
 		 911 aa  51.6  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1441  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  27.36 
 
 		 134 aa  51.6  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.109181  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0185  diguanylate cyclase with GAF sensor  28.83 
 
 		 1125 aa  51.2  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.161564 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1657  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  27.36 
 
 		 134 aa  51.2  0.00004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2295  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.14 
 
 		 905 aa  51.2  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0341  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.5 
 
 		 725 aa  50.4  0.00007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0143238  hitchhiker  0.0051816 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1132  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  34.15 
 
 		 134 aa  50.1  0.00008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.492287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4523  diguanylate cyclase with GAF sensor  25.73 
 
 		 499 aa  47.8  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.967133  normal  0.833222 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0293  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  40.98 
 
 		 132 aa  47.8  0.0004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1577  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  32.98 
 
 		 134 aa  47.8  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.188247  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3004  hypothetical protein  27.36 
 
 		 134 aa  47.4  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.146588  hitchhiker  0.00337909 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0012  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.84 
 
 		 2783 aa  46.6  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.296104 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2414  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase PtsP  24.42 
 
 		 756 aa  46.6  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1217  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25 
 
 		 1877 aa  45.8  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0884  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase PtsP  25.51 
 
 		 755 aa  45.8  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0462  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  27.94 
 
 		 134 aa  46.2  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.191705 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4656  multi-sensor signal transduction histidine kinase  22.29 
 
 		 677 aa  45.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0586  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  24.14 
 
 		 134 aa  45.8  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.114456  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4114  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 		 3470 aa  45.1  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1426  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  39.22 
 
 		 133 aa  45.1  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.0000000000000163802  normal  0.0247628 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0996  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  26.27 
 
 		 134 aa  44.3  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0213212  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0428  phosphoenolpyruvate-protein phosphotransferase PtsP  26.4 
 
 		 754 aa  44.3  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0167147 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2019  GAF sensor hybrid histidine kinase  23.96 
 
 		 1016 aa  44.3  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.25506  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004430  phosphocarrier protein kinase/phosphorylase nitrogen regulation associated  20.83 
 
 		 748 aa  43.9  0.006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000755885  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0287  GAF sensor hybrid histidine kinase  25.66 
 
 		 1160 aa  43.9  0.006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1522  hypothetical protein  32.5 
 
 		 134 aa  43.1  0.01  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.249328  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>