50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_3650 on replicon NC_014214
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014214  Mesil_3650  transposase IS605 OrfB  100 
 
 
536 aa  1085    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3812  transposase, IS605 OrfB  25.59 
 
 
664 aa  101  4e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1979  putative transposase IS891/IS1136/IS1341 family  31.33 
 
 
398 aa  55.5  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0933201  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2202  transposase, IS605 OrfB family  30.47 
 
 
417 aa  55.5  0.000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2454  transposase, IS605 OrfB family  26.83 
 
 
395 aa  55.1  0.000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.1066  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3927  transposase, IS605 OrfB family  34.15 
 
 
409 aa  54.7  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.770218  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0294  IS605 family transposase OrfB  26.55 
 
 
424 aa  54.7  0.000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.414871  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2840  transposase, IS605 OrfB family  29.73 
 
 
413 aa  53.1  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.249005  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2680  transposase, IS605 OrfB family  29.58 
 
 
413 aa  53.5  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.430379  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2438  transposase, IS605 OrfB family  26.22 
 
 
391 aa  52.8  0.00001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.258594  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0386  IS605 family transposase OrfB  29.05 
 
 
394 aa  53.1  0.00001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2571  transposase, IS605 OrfB family  29.66 
 
 
413 aa  52.8  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0459  IS605 family transposase OrfB  25.66 
 
 
401 aa  52.4  0.00002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3651  IS605 family transposase OrfB  28.79 
 
 
380 aa  52  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.166379  normal  0.432603 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0597  transposase, IS605 OrfB family  25.9 
 
 
374 aa  51.2  0.00004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  hitchhiker  0.000997644  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1067  IS605 family transposase OrfB  41.67 
 
 
416 aa  51.2  0.00004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1907  IS605 family transposase OrfB  43.06 
 
 
433 aa  50.4  0.00008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.128172  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2314  transposase, IS605 OrfB family  30.4 
 
 
419 aa  50.1  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.429907  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0546  transposase, IS605 OrfB family  29.03 
 
 
406 aa  49.7  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0601  transposase, IS605 OrfB family  25.61 
 
 
399 aa  49.7  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  unclonable  0.0000137299  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2633  transposase, IS605 OrfB family  25.61 
 
 
372 aa  50.1  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.56671  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1513  IS605 family transposase OrfB  27.03 
 
 
405 aa  48.9  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0963227  normal  0.774713 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3904  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  27.27 
 
 
517 aa  49.3  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.112308 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3397  transposase, IS605 OrfB family  30 
 
 
407 aa  48.1  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3066  IS605 family transposase OrfB  22.67 
 
 
402 aa  48.1  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1280  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  26.52 
 
 
403 aa  48.1  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.138792 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3575  IS605 family transposase OrfB  29.41 
 
 
468 aa  47.8  0.0005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.40765  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3190  transposase, IS605 OrfB family  30.34 
 
 
429 aa  47.8  0.0006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1550  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  25.76 
 
 
401 aa  47.4  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.734191  normal  0.524569 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0227  IS605 family transposase OrfB  23.91 
 
 
391 aa  47.4  0.0007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0173812  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3236  IS200 transposase orfB  25.4 
 
 
399 aa  47.4  0.0007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.48969  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1623  IS605 family transposase OrfB  24.64 
 
 
391 aa  47  0.0008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2849  transposase, IS605 OrfB family  24.7 
 
 
402 aa  47  0.0009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1058  IS605 family transposase OrfB  26.12 
 
 
355 aa  47  0.0009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.14172 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0628  transposase, IS605 OrfB family  24.7 
 
 
411 aa  47  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3151  IS605 family transposase OrfB  25.37 
 
 
355 aa  46.6  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0127  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  26.52 
 
 
403 aa  46.6  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.291596 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3509  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  26.02 
 
 
398 aa  45.8  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5398  transposase  27.21 
 
 
422 aa  45.8  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3354  DNA (cytosine-5-)-methyltransferase  26.52 
 
 
403 aa  45.8  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0023  IS605 family transposase OrfB  21.94 
 
 
402 aa  45.1  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2156  transposase, IS605 OrfB family  25.45 
 
 
393 aa  44.7  0.004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1324  transposase  26.87 
 
 
397 aa  44.7  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0532148  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1133  transposase, IS605 OrfB  26.87 
 
 
397 aa  44.7  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0812  transposase, IS605 OrfB family  27.66 
 
 
418 aa  44.7  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.639137  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2509  transposase, IS605 OrfB family  27.66 
 
 
421 aa  44.7  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.229122  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0073  IS605 family transposase OrfB  23.4 
 
 
418 aa  44.3  0.006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000149259  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4737  IS605 family transposase OrfB  26.28 
 
 
371 aa  44.3  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1800  putative transposase IS891/IS1136/IS1341 family  25.62 
 
 
386 aa  43.5  0.009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.31256  normal  0.500943 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5918  IS605 family transposase OrfB  28.91 
 
 
399 aa  43.5  0.009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.320804 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>