33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_0305 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_0305  hypothetical protein  100 
 
 
67 aa  132  1.9999999999999998e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.222028  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0269  putative transmembrane protein  71.21 
 
 
67 aa  95.9  2e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.514817  normal  0.593494 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1868  hypothetical protein  40.68 
 
 
72 aa  54.7  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4192  hypothetical protein  41.94 
 
 
72 aa  53.1  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.187436  hitchhiker  0.00134494 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0054  hypothetical protein  45 
 
 
91 aa  49.7  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0301503  normal  0.287125 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1784  hypothetical protein  37.5 
 
 
64 aa  49.3  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.727128 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2598  hypothetical protein  37.29 
 
 
73 aa  48.5  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.275443 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2751  hypothetical protein  33.87 
 
 
303 aa  45.8  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2197  hypothetical protein  34.29 
 
 
70 aa  45.8  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1846  hypothetical protein  37.14 
 
 
72 aa  45.8  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.27595  normal  0.211162 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2099  hypothetical protein  33.85 
 
 
86 aa  45.1  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1269  hypothetical protein  36.92 
 
 
61 aa  44.7  0.0004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.898185  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0222  hypothetical protein  40 
 
 
66 aa  45.1  0.0004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0231987  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1689  hypothetical protein  36.76 
 
 
77 aa  44.7  0.0004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.94474  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2628  hypothetical protein  33.82 
 
 
72 aa  44.7  0.0005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.483663  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4705  putative transmembrane protein  44.62 
 
 
67 aa  44.3  0.0006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.529381  normal  0.288258 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0684  hypothetical protein  36.92 
 
 
61 aa  43.9  0.0007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.367344 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0914  hypothetical protein  38.98 
 
 
78 aa  43.9  0.0008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00797435 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1457  hypothetical protein  38.24 
 
 
65 aa  43.1  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.101741  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0336  hypothetical protein  37.5 
 
 
62 aa  43.1  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1090  hypothetical protein  31.34 
 
 
69 aa  43.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.108346 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6176  hypothetical protein  38.46 
 
 
71 aa  42.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.727452  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1540  hypothetical protein  42.19 
 
 
126 aa  42.4  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3731  hypothetical protein  41.94 
 
 
62 aa  41.6  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2258  hypothetical protein  32.31 
 
 
76 aa  42  0.003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000331337  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3689  hypothetical protein  38.71 
 
 
67 aa  42  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.188444  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2126  hypothetical protein  34.85 
 
 
69 aa  42  0.003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000775092  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3714  hypothetical protein  35.48 
 
 
66 aa  42  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0621408 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0914  hypothetical protein  37.1 
 
 
64 aa  42  0.003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0164503  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0981  hypothetical protein  35.48 
 
 
61 aa  41.6  0.004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.995934  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0204  hypothetical protein  33.87 
 
 
64 aa  40.8  0.007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.160358 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1244  hypothetical protein  31.82 
 
 
63 aa  40.4  0.008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.822358  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1506  hypothetical protein  38.46 
 
 
63 aa  40  0.01  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.988537  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>