64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2197 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_2197  hypothetical protein  100 
 
 
70 aa  130  5e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2628  hypothetical protein  49.21 
 
 
72 aa  70.1  0.00000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.483663  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1784  hypothetical protein  55.56 
 
 
64 aa  64.3  0.0000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.727128 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3731  hypothetical protein  46.27 
 
 
62 aa  61.2  0.000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3714  hypothetical protein  43.66 
 
 
66 aa  59.3  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0621408 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0723  hypothetical protein  44.78 
 
 
104 aa  59.3  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2965  hypothetical protein  43.28 
 
 
64 aa  57.4  0.00000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.568379 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0021  hypothetical protein  43.48 
 
 
65 aa  56.2  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0914  hypothetical protein  40.3 
 
 
78 aa  55.8  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00797435 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3267  hypothetical protein  46.27 
 
 
63 aa  55.1  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3417  hypothetical protein  42.86 
 
 
65 aa  55.1  0.0000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.0064901  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2751  hypothetical protein  42.86 
 
 
65 aa  55.1  0.0000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1457  hypothetical protein  43.94 
 
 
65 aa  54.7  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.101741  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0204  hypothetical protein  40.58 
 
 
64 aa  54.3  0.0000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.160358 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0914  hypothetical protein  47.62 
 
 
64 aa  54.3  0.0000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0164503  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1868  hypothetical protein  42.25 
 
 
72 aa  53.9  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4192  hypothetical protein  44.62 
 
 
72 aa  52.8  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.187436  hitchhiker  0.00134494 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0054  hypothetical protein  41.43 
 
 
91 aa  52.4  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0301503  normal  0.287125 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2598  hypothetical protein  40.28 
 
 
73 aa  52.8  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.275443 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1506  hypothetical protein  49.21 
 
 
63 aa  52  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.988537  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1611  hypothetical protein  41.18 
 
 
67 aa  50.8  0.000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.931765  normal  0.039874 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2964  hypothetical protein  41.18 
 
 
70 aa  50.4  0.000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.224822  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1190  hypothetical protein  46.15 
 
 
64 aa  50.4  0.000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.21011  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0981  hypothetical protein  46.15 
 
 
61 aa  50.4  0.000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.995934  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6176  hypothetical protein  35.82 
 
 
71 aa  50.4  0.000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.727452  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1015  hypothetical protein  43.48 
 
 
69 aa  50.1  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1689  hypothetical protein  41.89 
 
 
77 aa  50.1  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.94474  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3689  hypothetical protein  41.18 
 
 
67 aa  48.9  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.188444  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2126  hypothetical protein  38.24 
 
 
69 aa  48.9  0.00002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.0000775092  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2585  hypothetical protein  35.82 
 
 
65 aa  48.5  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00246477 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1022  hypothetical protein  41.79 
 
 
81 aa  48.1  0.00004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.493994  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0231  hypothetical protein  42.19 
 
 
67 aa  48.1  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3078  hypothetical protein  44.78 
 
 
70 aa  48.1  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2684  hypothetical protein  44.78 
 
 
70 aa  48.1  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1025  hypothetical protein  41.1 
 
 
75 aa  47.8  0.00005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.155621  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3650  hypothetical protein  41.79 
 
 
63 aa  47.4  0.00007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0755582  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0305  hypothetical protein  34.29 
 
 
67 aa  45.8  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.222028  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1244  hypothetical protein  39.71 
 
 
63 aa  45.8  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.822358  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0347  hypothetical protein  38.57 
 
 
62 aa  45.4  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1478  hypothetical protein  41.79 
 
 
75 aa  45.1  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.311784  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0851  hypothetical protein  43.28 
 
 
63 aa  45.4  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0738922  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1359  hypothetical protein  37.1 
 
 
65 aa  45.4  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0219  hypothetical protein  35.71 
 
 
82 aa  44.7  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2705  hypothetical protein  37.5 
 
 
77 aa  45.1  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.0000000328169  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3203  hypothetical protein  40.91 
 
 
68 aa  44.3  0.0006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000344489  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0222  hypothetical protein  37.14 
 
 
66 aa  43.9  0.0007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0231987  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4302  hypothetical protein  38.81 
 
 
63 aa  43.9  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.386167  normal  0.0304485 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0336  hypothetical protein  40.3 
 
 
62 aa  43.5  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1300  hypothetical protein  40.58 
 
 
66 aa  43.5  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.428744  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2917  hypothetical protein  40.3 
 
 
67 aa  43.5  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.37466 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2053  hypothetical protein  32.84 
 
 
62 aa  43.1  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.920599  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2490  hypothetical protein  33.87 
 
 
83 aa  43.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.461455  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2571  hypothetical protein  40.91 
 
 
61 aa  42.7  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.403063 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1261  hypothetical protein  40.58 
 
 
63 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.56018 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1064  hypothetical protein  33.33 
 
 
63 aa  42.4  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.710613  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0459  hypothetical protein  42.62 
 
 
65 aa  42.7  0.002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000162501  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0794  hypothetical protein  40.32 
 
 
70 aa  42.7  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1159  hypothetical protein  37.68 
 
 
64 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.136303 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1281  conserved hypothetical secreted protein  38.24 
 
 
62 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1499  hypothetical protein  33.33 
 
 
68 aa  41.2  0.005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0448  hypothetical protein  44.26 
 
 
63 aa  40.8  0.007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000908926  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0407  hypothetical protein  35.94 
 
 
65 aa  40.4  0.009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0117  hypothetical protein  40.3 
 
 
66 aa  40.4  0.009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0547  hypothetical protein  37.84 
 
 
76 aa  40.4  0.009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.521133  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>