52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2598 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2598  hypothetical protein  100 
 
 
73 aa  145  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.275443 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1868  hypothetical protein  87.5 
 
 
72 aa  129  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4192  hypothetical protein  62.5 
 
 
72 aa  95.9  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.187436  hitchhiker  0.00134494 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0054  hypothetical protein  56.94 
 
 
91 aa  93.6  9e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0301503  normal  0.287125 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2964  hypothetical protein  40.3 
 
 
70 aa  54.7  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.224822  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1611  hypothetical protein  40.3 
 
 
67 aa  54.3  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.931765  normal  0.039874 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1090  hypothetical protein  42.37 
 
 
69 aa  53.9  0.0000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.108346 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2751  hypothetical protein  36.36 
 
 
303 aa  53.5  0.0000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0914  hypothetical protein  43.21 
 
 
78 aa  53.1  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00797435 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2197  hypothetical protein  40.28 
 
 
70 aa  52.8  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2965  hypothetical protein  42.19 
 
 
64 aa  52.4  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.568379 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2797  hypothetical protein  40.85 
 
 
71 aa  50.8  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3689  hypothetical protein  43.48 
 
 
67 aa  50.4  0.000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.188444  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2684  hypothetical protein  42.25 
 
 
70 aa  49.7  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3078  hypothetical protein  42.25 
 
 
70 aa  49.7  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2585  hypothetical protein  39.71 
 
 
65 aa  48.9  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00246477 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1190  hypothetical protein  43.55 
 
 
64 aa  49.7  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.21011  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3731  hypothetical protein  39.39 
 
 
62 aa  48.9  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0305  hypothetical protein  37.29 
 
 
67 aa  48.5  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.222028  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0427  hypothetical protein  38.24 
 
 
83 aa  48.5  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1499  hypothetical protein  40.91 
 
 
68 aa  47.4  0.00007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1457  hypothetical protein  49.18 
 
 
65 aa  46.6  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.101741  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0021  hypothetical protein  37.68 
 
 
65 aa  46.6  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1064  hypothetical protein  42.19 
 
 
63 aa  45.4  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.710613  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3417  hypothetical protein  39.06 
 
 
65 aa  45.8  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.0064901  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2053  hypothetical protein  46.03 
 
 
62 aa  46.2  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.920599  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2751  hypothetical protein  39.06 
 
 
65 aa  45.8  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1478  hypothetical protein  39.34 
 
 
75 aa  45.8  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.311784  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6176  hypothetical protein  33.82 
 
 
71 aa  45.1  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.727452  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1689  hypothetical protein  41.43 
 
 
77 aa  45.4  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.94474  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1846  hypothetical protein  37.14 
 
 
72 aa  44.7  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.27595  normal  0.211162 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0219  hypothetical protein  38.1 
 
 
82 aa  45.1  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2099  hypothetical protein  37.31 
 
 
86 aa  44.7  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4302  hypothetical protein  40.3 
 
 
63 aa  44.3  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.386167  normal  0.0304485 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2490  hypothetical protein  38.33 
 
 
83 aa  44.3  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.461455  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1062  hypothetical protein  37.1 
 
 
64 aa  43.9  0.0007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3714  hypothetical protein  35.94 
 
 
66 aa  43.5  0.0009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0621408 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2241  hypothetical protein  43.33 
 
 
83 aa  43.1  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.778547 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1159  hypothetical protein  38.46 
 
 
64 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.136303 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1034  hypothetical protein  33.87 
 
 
64 aa  43.1  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0336  hypothetical protein  36.36 
 
 
62 aa  43.5  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1281  conserved hypothetical secreted protein  44.44 
 
 
62 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1261  hypothetical protein  46.03 
 
 
63 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.56018 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3203  hypothetical protein  41.94 
 
 
68 aa  42.4  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000344489  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0914  hypothetical protein  40.98 
 
 
64 aa  42  0.003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0164503  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3650  hypothetical protein  39.68 
 
 
63 aa  42  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0755582  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0204  hypothetical protein  39.34 
 
 
64 aa  41.6  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.160358 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1359  hypothetical protein  38.1 
 
 
65 aa  41.6  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2705  hypothetical protein  32.39 
 
 
77 aa  41.6  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.0000000328169  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0459  hypothetical protein  36.76 
 
 
65 aa  41.2  0.006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000162501  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0347  hypothetical protein  38.1 
 
 
62 aa  40.8  0.006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0269  putative transmembrane protein  32.2 
 
 
67 aa  40.4  0.009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.514817  normal  0.593494 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>