47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0914 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0914  hypothetical protein  100 
 
 
64 aa  127  6e-29  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0164503  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0981  hypothetical protein  49.18 
 
 
61 aa  59.7  0.00000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.995934  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2705  hypothetical protein  43.75 
 
 
77 aa  55.5  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.0000000328169  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1506  hypothetical protein  52.46 
 
 
63 aa  55.1  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.988537  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3714  hypothetical protein  49.18 
 
 
66 aa  54.7  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0621408 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2197  hypothetical protein  47.62 
 
 
70 aa  54.3  0.0000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0054  hypothetical protein  50 
 
 
91 aa  53.9  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0301503  normal  0.287125 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1359  hypothetical protein  45.76 
 
 
65 aa  53.5  0.0000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4192  hypothetical protein  50 
 
 
72 aa  53.5  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.187436  hitchhiker  0.00134494 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2585  hypothetical protein  42.19 
 
 
65 aa  52.8  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00246477 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1784  hypothetical protein  42.86 
 
 
64 aa  52.4  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.727128 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2965  hypothetical protein  45.9 
 
 
64 aa  50.4  0.000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.568379 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1064  hypothetical protein  45.9 
 
 
63 aa  50.1  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.710613  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0231  hypothetical protein  42.62 
 
 
67 aa  48.5  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2490  hypothetical protein  40 
 
 
83 aa  48.1  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.461455  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2053  hypothetical protein  42.62 
 
 
62 aa  47.8  0.00006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.920599  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3731  hypothetical protein  42.62 
 
 
62 aa  47.4  0.00007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3267  hypothetical protein  44.26 
 
 
63 aa  46.2  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2478  hypothetical protein  49.18 
 
 
61 aa  47  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.328506  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1457  hypothetical protein  46.77 
 
 
65 aa  46.6  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.101741  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2628  hypothetical protein  39.39 
 
 
72 aa  46.6  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.483663  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1281  conserved hypothetical secreted protein  47.54 
 
 
62 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1868  hypothetical protein  44.26 
 
 
72 aa  45.8  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3689  hypothetical protein  40.62 
 
 
67 aa  45.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.188444  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1190  hypothetical protein  45.9 
 
 
64 aa  46.2  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.21011  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2099  hypothetical protein  41.27 
 
 
86 aa  45.1  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1478  hypothetical protein  39.34 
 
 
75 aa  44.3  0.0006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.311784  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1261  hypothetical protein  45.9 
 
 
63 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.56018 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1159  hypothetical protein  40.98 
 
 
64 aa  43.5  0.0009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.136303 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0222  hypothetical protein  32.81 
 
 
66 aa  42.7  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0231987  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4302  hypothetical protein  40.98 
 
 
63 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.386167  normal  0.0304485 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2258  hypothetical protein  37.5 
 
 
76 aa  42.4  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000331337  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3078  hypothetical protein  44.26 
 
 
70 aa  42.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2684  hypothetical protein  44.26 
 
 
70 aa  42.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2598  hypothetical protein  40.98 
 
 
73 aa  42  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.275443 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2751  hypothetical protein  40.98 
 
 
65 aa  42  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0204  hypothetical protein  37.7 
 
 
64 aa  42  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.160358 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3417  hypothetical protein  40.98 
 
 
65 aa  42  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.0064901  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6176  hypothetical protein  36.36 
 
 
71 aa  42  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.727452  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0269  putative transmembrane protein  35.38 
 
 
67 aa  42  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.514817  normal  0.593494 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0305  hypothetical protein  37.1 
 
 
67 aa  42  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.222028  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4037  hypothetical protein  39.34 
 
 
83 aa  40.8  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.649084  normal  0.130232 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2751  hypothetical protein  40.35 
 
 
303 aa  40.4  0.007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0459  hypothetical protein  37.93 
 
 
65 aa  40.8  0.007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000162501  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4705  putative transmembrane protein  43.94 
 
 
67 aa  40.4  0.009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.529381  normal  0.288258 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0021  hypothetical protein  37.7 
 
 
65 aa  40.4  0.009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0475  hypothetical protein  35 
 
 
63 aa  40  0.01  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0267877  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>