50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_4705 on replicon NC_008688
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008688  Pden_4705  putative transmembrane protein  100 
 
 		 67 aa  125  2.0000000000000002e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.529381  normal  0.288258 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0336  hypothetical protein  47.62 
 
 		 62 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0269  putative transmembrane protein  42.42 
 
 		 67 aa  54.3  0.0000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.514817  normal  0.593494 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0914  hypothetical protein  43.94 
 
 		 64 aa  53.9  0.0000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0164503  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0427  hypothetical protein  44.78 
 
 		 83 aa  53.5  0.0000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1506  hypothetical protein  44.78 
 
 		 63 aa  52.8  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.988537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1846  hypothetical protein  40 
 
 		 72 aa  53.5  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.27595  normal  0.211162 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0305  hypothetical protein  44.62 
 
 		 67 aa  52.4  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.222028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0231  hypothetical protein  38.1 
 
 		 67 aa  50.1  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0204  hypothetical protein  39.68 
 
 		 64 aa  49.7  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.160358 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3731  hypothetical protein  46.27 
 
 		 62 aa  49.7  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2053  hypothetical protein  44.44 
 
 		 62 aa  49.7  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.920599  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0222  hypothetical protein  33.82 
 
 		 66 aa  48.9  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0231987  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0794  hypothetical protein  37.1 
 
 		 70 aa  48.1  0.00004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2965  hypothetical protein  41.27 
 
 		 64 aa  46.2  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.568379 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3203  hypothetical protein  36.36 
 
 		 68 aa  45.4  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000344489  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1190  hypothetical protein  41.27 
 
 		 64 aa  45.4  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.21011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1064  hypothetical protein  39.68 
 
 		 63 aa  45.4  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.710613  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3078  hypothetical protein  43.08 
 
 		 70 aa  45.1  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1812  hypothetical protein  42.19 
 
 		 62 aa  44.7  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2684  hypothetical protein  43.08 
 
 		 70 aa  45.1  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1457  hypothetical protein  43.75 
 
 		 65 aa  44.7  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.101741  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2258  hypothetical protein  34.33 
 
 		 76 aa  44.7  0.0005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000331337  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1359  hypothetical protein  38.33 
 
 		 65 aa  44.7  0.0005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1269  hypothetical protein  33.33 
 
 		 61 aa  44.7  0.0005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.898185  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2571  hypothetical protein  37.88 
 
 		 61 aa  44.3  0.0005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.403063 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2598  hypothetical protein  38.33 
 
 		 73 aa  43.9  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.275443 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0684  hypothetical protein  34.85 
 
 		 61 aa  43.9  0.0007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.367344 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1244  hypothetical protein  38.81 
 
 		 63 aa  43.9  0.0008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.822358  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6176  hypothetical protein  34.38 
 
 		 71 aa  43.5  0.0009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.727452  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0430  hypothetical protein  40 
 
 		 77 aa  43.5  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.180279  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0981  hypothetical protein  31.75 
 
 		 61 aa  43.1  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.995934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0459  hypothetical protein  39.34 
 
 		 65 aa  43.1  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000162501  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0054  hypothetical protein  38.33 
 
 		 91 aa  43.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0301503  normal  0.287125 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0407  hypothetical protein  34.92 
 
 		 65 aa  43.1  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2705  hypothetical protein  34.33 
 
 		 77 aa  42.7  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.0000000328169  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3267  hypothetical protein  39.68 
 
 		 63 aa  42  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0306  metal dependent phosphohydrolase  38.1 
 
 		 361 aa  41.6  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2585  hypothetical protein  32.84 
 
 		 65 aa  42  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00246477 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0021  hypothetical protein  38.1 
 
 		 65 aa  42  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2197  hypothetical protein  35.82 
 
 		 70 aa  42  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1868  hypothetical protein  38.33 
 
 		 72 aa  41.6  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2751  hypothetical protein  29.23 
 
 		 303 aa  41.6  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2099  hypothetical protein  30.16 
 
 		 86 aa  41.2  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4224  hypothetical protein  32.88 
 
 		 96 aa  41.2  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3714  hypothetical protein  36.51 
 
 		 66 aa  41.2  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0621408 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4192  hypothetical protein  38.33 
 
 		 72 aa  41.2  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.187436  hitchhiker  0.00134494 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1784  hypothetical protein  28.57 
 
 		 64 aa  40.4  0.008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.727128 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1159  hypothetical protein  39.68 
 
 		 64 aa  40.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.136303 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4302  hypothetical protein  34.92 
 
 		 63 aa  40  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.386167  normal  0.0304485 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>