46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1457 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_1457  hypothetical protein  100 
 
 
65 aa  129  1.0000000000000001e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.101741  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6176  hypothetical protein  41.18 
 
 
71 aa  57.4  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.727452  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2628  hypothetical protein  43.94 
 
 
72 aa  55.5  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.483663  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2197  hypothetical protein  43.94 
 
 
70 aa  54.7  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1506  hypothetical protein  45.45 
 
 
63 aa  51.2  0.000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.988537  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2585  hypothetical protein  43.94 
 
 
65 aa  50.8  0.000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00246477 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1784  hypothetical protein  42.86 
 
 
64 aa  49.7  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.727128 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3714  hypothetical protein  43.55 
 
 
66 aa  48.5  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0621408 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2751  hypothetical protein  40.91 
 
 
303 aa  48.5  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2684  hypothetical protein  47.69 
 
 
70 aa  48.1  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3078  hypothetical protein  47.69 
 
 
70 aa  48.1  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0219  hypothetical protein  44.26 
 
 
82 aa  48.1  0.00004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1868  hypothetical protein  52.46 
 
 
72 aa  48.1  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0021  hypothetical protein  41.94 
 
 
65 aa  47.8  0.00005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1064  hypothetical protein  46.77 
 
 
63 aa  47.8  0.00006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.710613  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1190  hypothetical protein  43.55 
 
 
64 aa  47.4  0.00007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.21011  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2053  hypothetical protein  43.08 
 
 
62 aa  46.6  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.920599  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0914  hypothetical protein  46.77 
 
 
64 aa  46.6  0.0001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0164503  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3731  hypothetical protein  40 
 
 
62 aa  46.6  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2598  hypothetical protein  49.18 
 
 
73 aa  46.6  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.275443 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2965  hypothetical protein  41.94 
 
 
64 aa  45.4  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.568379 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0054  hypothetical protein  45.9 
 
 
91 aa  44.7  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0301503  normal  0.287125 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4192  hypothetical protein  43.33 
 
 
72 aa  44.7  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.187436  hitchhiker  0.00134494 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1090  hypothetical protein  37.5 
 
 
69 aa  44.3  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.108346 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2099  hypothetical protein  40 
 
 
86 aa  44.3  0.0006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1359  hypothetical protein  39.68 
 
 
65 aa  43.5  0.0009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0305  hypothetical protein  38.24 
 
 
67 aa  43.1  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.222028  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0684  hypothetical protein  38.46 
 
 
61 aa  43.5  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.367344 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1034  hypothetical protein  39.06 
 
 
64 aa  43.1  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1244  hypothetical protein  41.54 
 
 
63 aa  43.1  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.822358  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0204  hypothetical protein  40.32 
 
 
64 aa  42.4  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.160358 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2490  hypothetical protein  40.58 
 
 
83 aa  42  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.461455  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1159  hypothetical protein  41.94 
 
 
64 aa  41.6  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.136303 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0222  hypothetical protein  36.36 
 
 
66 aa  42  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0231987  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1281  conserved hypothetical secreted protein  45.16 
 
 
62 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1062  hypothetical protein  37.5 
 
 
64 aa  41.6  0.004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0427  hypothetical protein  39.13 
 
 
83 aa  41.6  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1261  hypothetical protein  45.16 
 
 
63 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.56018 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3267  hypothetical protein  41.94 
 
 
63 aa  41.2  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0336  hypothetical protein  40.62 
 
 
62 aa  40.8  0.006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3689  hypothetical protein  43.55 
 
 
67 aa  40.8  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.188444  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1269  hypothetical protein  38.46 
 
 
61 aa  40.8  0.007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.898185  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1478  hypothetical protein  40.91 
 
 
75 aa  40.4  0.007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.311784  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0231  hypothetical protein  38.71 
 
 
67 aa  40.4  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4302  hypothetical protein  40.32 
 
 
63 aa  40  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.386167  normal  0.0304485 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0981  hypothetical protein  40 
 
 
61 aa  40  0.01  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.995934  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>